東方山羊豆種質(zhì)資源ISSR分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-21 21:53
【目的】分析東方山羊豆種質(zhì)資源遺傳多樣性,為其種質(zhì)資源鑒定評價(jià)、新品種選育及開發(fā)利用提供理論參考!痉椒ā恳4份引進(jìn)東方山羊豆種質(zhì)及其29份雜交后代為材料,利用ISSR引物對其進(jìn)行多態(tài)性擴(kuò)增,并以PopGene32計(jì)算其遺傳參數(shù),采用NTsys-pc 2.1計(jì)算遺傳相似系數(shù),運(yùn)用SHAN模型中的非加權(quán)配對算術(shù)平均法(UPGMA)繪制聚類樹狀圖!窘Y(jié)果】從24條ISSR引物中篩選出8條擴(kuò)增條帶清晰、多態(tài)性良好且易擴(kuò)增的引物,利用其從33份東方山羊豆種質(zhì)材料中共擴(kuò)增出79條條帶,其中65條具有多態(tài)性,多態(tài)百分率為82.15%;觀察等位基因數(shù)(Na)為1.6667~2.0000,平均為1.8215,有效等位基因數(shù)(Ne)為1.2212~1.5740,平均為1.4242;Nei’基因多樣性指數(shù)(H)為0.1521~0.3322,平均為0.2509,Shannon多態(tài)信息指數(shù)(I)為0.2473~0.4976,平均為0.3813。這些種質(zhì)材料遺傳相似系數(shù)為0.5696~0.9241,平均為0.7623,在0.7140處可劃分為三大類群(Ⅰ~Ⅲ),分別包含25、3和5份種質(zhì)材料,不同地理來源種質(zhì)相...
【文章來源】:南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
33份東方山羊豆種質(zhì)材料基因組DNA的檢測結(jié)果
引物834對33份東方山羊豆種質(zhì)材料的PCR擴(kuò)增結(jié)果
通過UPGMA法對33份供試材料的ISSR多態(tài)性進(jìn)行聚類分析,結(jié)果如圖4所示。33份東方山羊豆種質(zhì)資源在遺傳相似系數(shù)0.7140處可分為三大類群(Ⅰ~Ⅲ)。第Ⅰ類群包括25份種質(zhì),其在遺傳相似系數(shù)0.7260處又可分為2個(gè)亞群Ⅰ-1和Ⅰ-2:Ⅰ-1亞類包括23份種質(zhì),其中GY07號白花(編號7)、ZNK18(編號26)、GYN18(編號29)和GYP18(編號30)與其他19份種質(zhì)的遺傳相似系數(shù)介于0.7380~0.7500,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳多樣性較豐富;進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在這19份種質(zhì)中,GY04號白花(編號4)與GY05號白花(編號5)種質(zhì)間的親緣關(guān)系最近,遺傳差異最小,其余17份種質(zhì)中位于同一小分支種質(zhì)的親緣關(guān)系較近,遺傳多樣性較低,如ZNH18(編號23)與GYI18(編號24)二者間、ZNE18(編號22)、ZN小葉(編號20)和GY大葉(編號19)三者間等。Ⅰ-2亞群包括GY08號白花(編號8)和GY17號白花(編號15)2份種質(zhì),二者的遺傳相似系數(shù)為0.7342,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),存在一定的遺傳差異。第Ⅱ類群包括GY10號白花(編號10)、GY16號白花(編號14)和GYD18白花(編號16)3份種質(zhì)。第Ⅲ類群包括GYJ18(編號25)、GYM18(編號28)、GYQ18(編號31)、GYS18(編號33)和GYR18(編號32)等5份種質(zhì),其中GYR18與另外4份遺傳相似系數(shù)介于0.7140~0.7260,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異較大,遺傳多樣性較豐富。綜上所述,不同地理來源種質(zhì)相互混雜分布,種質(zhì)資源間遺傳分布與地理來源間無明顯相關(guān)性,第Ⅱ類群和第Ⅲ類群東方山羊豆種質(zhì)材料間遺傳多樣性較第Ⅰ類群豐富。3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑茅野生種質(zhì)資源遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 徐榮,何麗蓮,王先宏,陳疏影,楊清輝,張漢堯,李富生. 分子植物育種. 2017(07)
[2]37份山羊豆種質(zhì)資源的遺傳多樣性SSR分析[J]. 尹淑英,Vladimir F.Chapurin,Nickolay I.Dzyubenko,高洪文,王贊. 中國草地學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]20個(gè)紫花苜蓿品種的ISSR遺傳多樣性分析[J]. 李杉杉,毛培春,郭靜雅,郭強(qiáng),田小霞,孟林. 草原與草坪. 2016(04)
[4]東方山羊豆種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR分析[J]. 余國輝,王贊,王俊娥,劉海泉,高洪文,Nikolay Dzyubenko,Vladimir Chapurin,呼天明. 中國草地學(xué)報(bào). 2014(03)
[5]ISSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用[J]. 朱巖芳,祝水金,李永平,馬文廣,鄭昀曄,胡晉. 種子. 2010(02)
[6]ISSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用[J]. 羅海燕,陳業(yè)淵. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2008(19)
[7]山羊豆種質(zhì)資源形態(tài)多樣性分析[J]. 王俊娥,王贊,王運(yùn)琦,高洪文,Vladimir Chapurin. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2008(02)
[8]鹽脅迫對東方山羊豆生理特性的影響[J]. 沙偉,侯云杰,羅新義. 北方園藝. 2008(04)
[9]PEG脅迫下東方山羊豆抗旱生理特性的研究[J]. 郝偉偉,師帥,禤麗芳,沙偉. 齊齊哈爾大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(02)
[10]野牛草實(shí)生群體多樣性的表型及ISSR分析[J]. 劉莉,鄧春婷,包滿珠. 草業(yè)科學(xué). 2008(01)
本文編號:3449782
【文章來源】:南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
33份東方山羊豆種質(zhì)材料基因組DNA的檢測結(jié)果
引物834對33份東方山羊豆種質(zhì)材料的PCR擴(kuò)增結(jié)果
通過UPGMA法對33份供試材料的ISSR多態(tài)性進(jìn)行聚類分析,結(jié)果如圖4所示。33份東方山羊豆種質(zhì)資源在遺傳相似系數(shù)0.7140處可分為三大類群(Ⅰ~Ⅲ)。第Ⅰ類群包括25份種質(zhì),其在遺傳相似系數(shù)0.7260處又可分為2個(gè)亞群Ⅰ-1和Ⅰ-2:Ⅰ-1亞類包括23份種質(zhì),其中GY07號白花(編號7)、ZNK18(編號26)、GYN18(編號29)和GYP18(編號30)與其他19份種質(zhì)的遺傳相似系數(shù)介于0.7380~0.7500,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳多樣性較豐富;進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在這19份種質(zhì)中,GY04號白花(編號4)與GY05號白花(編號5)種質(zhì)間的親緣關(guān)系最近,遺傳差異最小,其余17份種質(zhì)中位于同一小分支種質(zhì)的親緣關(guān)系較近,遺傳多樣性較低,如ZNH18(編號23)與GYI18(編號24)二者間、ZNE18(編號22)、ZN小葉(編號20)和GY大葉(編號19)三者間等。Ⅰ-2亞群包括GY08號白花(編號8)和GY17號白花(編號15)2份種質(zhì),二者的遺傳相似系數(shù)為0.7342,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),存在一定的遺傳差異。第Ⅱ類群包括GY10號白花(編號10)、GY16號白花(編號14)和GYD18白花(編號16)3份種質(zhì)。第Ⅲ類群包括GYJ18(編號25)、GYM18(編號28)、GYQ18(編號31)、GYS18(編號33)和GYR18(編號32)等5份種質(zhì),其中GYR18與另外4份遺傳相似系數(shù)介于0.7140~0.7260,說明其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異較大,遺傳多樣性較豐富。綜上所述,不同地理來源種質(zhì)相互混雜分布,種質(zhì)資源間遺傳分布與地理來源間無明顯相關(guān)性,第Ⅱ類群和第Ⅲ類群東方山羊豆種質(zhì)材料間遺傳多樣性較第Ⅰ類群豐富。3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑茅野生種質(zhì)資源遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 徐榮,何麗蓮,王先宏,陳疏影,楊清輝,張漢堯,李富生. 分子植物育種. 2017(07)
[2]37份山羊豆種質(zhì)資源的遺傳多樣性SSR分析[J]. 尹淑英,Vladimir F.Chapurin,Nickolay I.Dzyubenko,高洪文,王贊. 中國草地學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]20個(gè)紫花苜蓿品種的ISSR遺傳多樣性分析[J]. 李杉杉,毛培春,郭靜雅,郭強(qiáng),田小霞,孟林. 草原與草坪. 2016(04)
[4]東方山羊豆種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR分析[J]. 余國輝,王贊,王俊娥,劉海泉,高洪文,Nikolay Dzyubenko,Vladimir Chapurin,呼天明. 中國草地學(xué)報(bào). 2014(03)
[5]ISSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用[J]. 朱巖芳,祝水金,李永平,馬文廣,鄭昀曄,胡晉. 種子. 2010(02)
[6]ISSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用[J]. 羅海燕,陳業(yè)淵. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2008(19)
[7]山羊豆種質(zhì)資源形態(tài)多樣性分析[J]. 王俊娥,王贊,王運(yùn)琦,高洪文,Vladimir Chapurin. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2008(02)
[8]鹽脅迫對東方山羊豆生理特性的影響[J]. 沙偉,侯云杰,羅新義. 北方園藝. 2008(04)
[9]PEG脅迫下東方山羊豆抗旱生理特性的研究[J]. 郝偉偉,師帥,禤麗芳,沙偉. 齊齊哈爾大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(02)
[10]野牛草實(shí)生群體多樣性的表型及ISSR分析[J]. 劉莉,鄧春婷,包滿珠. 草業(yè)科學(xué). 2008(01)
本文編號:3449782
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