金線蓮是傳統(tǒng)的名貴中藥材,以耐熱品系金線蓮NYJ2為研究對象,分析其在蛋白質(zhì)水平上對高溫脅迫的響應。通過比較高溫脅迫前后NYJ2葉片蛋白質(zhì)組學的變化,獲得二級圖譜326 478個,匹配到34 376個,鑒定到肽段9 804個,蛋白質(zhì)2 534個,大多數(shù)肽段分布的長度在7～25 aa。通過對高溫脅迫前后蛋白質(zhì)數(shù)量和種類的差異分析,共獲得143個差異表達的蛋白質(zhì),其中,40個蛋白質(zhì)上調(diào)表達,103個下調(diào)表達,HSP20家族的基因（HSP17.4）編碼蛋白質(zhì)、病程相關蛋白質(zhì)（PR）、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶（GSTF1）、過氧化氫酶（CAT）的表達差異較多。另外,在KOG功能分類中發(fā)現(xiàn)有112個功能不明確的蛋白質(zhì),223個信號轉(zhuǎn)導機制蛋白質(zhì)。通過分析NYJ2在蛋白質(zhì)組學層面對熱脅迫的響應,為金線蓮耐熱栽培提供了參考依據(jù)。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2020,36(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

蛋白質(zhì)基本鑒定信息統(tǒng)計

從高溫脅迫前后金線蓮葉片中蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量大小來看,鑒定出來的蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量主要集中在10 000～80 000,其數(shù)量約占總蛋白質(zhì)數(shù)量的83.94%,其中相對分子質(zhì)量為20 000～30 000和30 000～40 000的蛋白質(zhì)數(shù)量分別為439個和429個,分別占總蛋白質(zhì)數(shù)量的17.32%和16.93%;相對分子質(zhì)量為0～10 000的蛋白質(zhì)數(shù)量占總蛋白質(zhì)數(shù)量的3.28%,相對分子質(zhì)量為80 000～100 000的蛋白質(zhì)數(shù)量占總蛋白質(zhì)數(shù)量的5.25%,相對分子質(zhì)量>100 000的蛋白質(zhì)數(shù)量占總蛋白質(zhì)數(shù)量的7.54%左右(圖2)。2.1.2 肽段長度分布

對高溫脅迫前后獲得的所有金線蓮葉片的蛋白質(zhì)進行GO功能注釋,主要對分子功能、生物學過程和細胞組分中所涉及的GO條目及相應的蛋白質(zhì)ID和數(shù)量進行統(tǒng)計分析,并略去沒有相應蛋白質(zhì)的GO條目。結(jié)果顯示,所有鑒定到的蛋白質(zhì)被注釋到41個GO條目中(圖5)。在生物學過程中,注釋蛋白質(zhì)數(shù)量較多的是代謝過程、細胞過程和單一生物體過程,分別為1 584個、1 342個、1 205個;在分子功能中,催化活性和結(jié)合的注釋蛋白質(zhì)數(shù)量較多,分別為1 317個和1 135個;在細胞組分中,細胞和細胞器的注釋蛋白質(zhì)數(shù)量較多,分別為1 470個和1 207個。圖4 不同肽段數(shù)量蛋白質(zhì)的數(shù)量分布

【參考文獻】：
期刊論文
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