干旱脅迫下白沙蒿SIP2-1的表達(dá)和序列分析
發(fā)布時(shí)間:2023-02-15 18:47
水通道蛋白家族(Aquaporins)的成員在植物體中起著膜通道的作用;谵D(zhuǎn)錄組測(cè)序,對(duì)在干旱脅迫下呈顯著下調(diào)表達(dá)的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示:AsSIP 2-1的cDNA序列的開放閱讀框全長(zhǎng)1 191 bp,共編碼235個(gè)氨基酸;屬于水通道蛋白SIP2-1家族的成員;AsSIP 2-1與5個(gè)參考物種的比對(duì)結(jié)果顯示6個(gè)物種的總體同源性為82.92%,并具有SIP2-1家族的特有的NPL和NPA保守性結(jié)構(gòu)域; AsSIP 2-1的等電點(diǎn)為9.32;分子量為26.145 kDa;分子式為C1218H1893N301O317S10;屬于疏水性、穩(wěn)定性蛋白;具有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜保留信號(hào)EKKT基序;具有6個(gè)跨膜區(qū),屬于跨膜蛋白;無信號(hào)肽,屬于非分泌蛋白。在干旱迫下,AsSIP 2-1表達(dá)量顯著下調(diào),參與了應(yīng)答反應(yīng)。
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與種植方法
1.2 研究方法
1.2.1 干旱脅迫處理方法
1.2.2 白沙蒿水通道蛋白基因的獲取方法
1.2.3 生物信息學(xué)分析方法
2 結(jié)果與分析
2.1 白沙蒿水通道蛋白(AsSIP 2-1)在干旱脅迫下表達(dá)量分析
2.2 同源性比對(duì)分析及亞細(xì)胞定位分析
2.3 跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.4 理化性質(zhì)分析
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3743638
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1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與種植方法
1.2 研究方法
1.2.1 干旱脅迫處理方法
1.2.2 白沙蒿水通道蛋白基因的獲取方法
1.2.3 生物信息學(xué)分析方法
2 結(jié)果與分析
2.1 白沙蒿水通道蛋白(AsSIP 2-1)在干旱脅迫下表達(dá)量分析
2.2 同源性比對(duì)分析及亞細(xì)胞定位分析
2.3 跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.4 理化性質(zhì)分析
3 討論
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