基于高通量測序方法研究腌制麻竹筍發(fā)酵過程中細(xì)菌群落的動態(tài)演替
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【部分圖文】:
圖1不同鹽濃度腌制麻竹筍細(xì)菌群落的OTU維恩圖
OTU與物種呈現(xiàn)對應(yīng)關(guān)系,可通過分析OTU分布情況了解樣本中微生物的多樣性與存在量[13];16SrRNA基因測序所獲得的細(xì)菌群落OTU維恩圖如圖1所示,共得到2417個OTU。不同鹽濃度樣本中OTU分布具有較大差異。部分OTU是兩種鹽濃度樣本所共有的(575例,23.7....
圖2不同鹽濃度腌制麻竹筍細(xì)菌群落α多樣性分析
Chao指數(shù)反映群落豐富度,Shannon指數(shù)反映群落多樣性[14]。由圖2-a可知,發(fā)酵前28d不同鹽濃度樣本Chao指數(shù)變化趨勢均不明顯,集中在250左右,并且均在發(fā)酵第10天達(dá)到最低值,第35天達(dá)到最高值。具體來看,5g/100mL鹽質(zhì)量濃度腌制麻竹筍在第35天Cha....
圖4不同鹽濃度腌制麻竹筍中細(xì)菌微生物區(qū)系UPGMA聚類分析和主成分分析
圖3不同鹽濃度腌制麻竹筍中細(xì)菌在門水平和屬水平的高通量相對豐度2.5腌制麻竹筍細(xì)菌進(jìn)化分析
圖3不同鹽濃度腌制麻竹筍中細(xì)菌在門水平和屬水平的高通量相對豐度
采用非加權(quán)組平均法(unweightedpairgroupmethodwitharithmeticmean,UPGMA)構(gòu)建樹狀結(jié)構(gòu)進(jìn)行層聚類分析,樹枝的長短可直觀呈現(xiàn)不同鹽濃度下麻竹筍腌制過程中群落組成的相似或差異程度。如圖4-a所示,15g/100mL鹽質(zhì)量濃度....
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