藻藍色素蛋白是我國認可的天然食用色素,可用于多種低溫食品的著色;它同時也是一種優(yōu)良的功能性色素蛋白。許多研究表明,藻藍蛋白具有顯著的腫瘤抑制作用,能夠抑制非小細胞肺癌的增殖和遷移。為深入探究藻藍蛋白抑制非小細胞肺癌活性的調(diào)控機制,本研究以A549細胞為代表,采用高通量小分子RNA轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對藻藍蛋白處理前后的細胞進行miRNA的篩選分析。結(jié)果表明,已知和新預(yù)測的miRNA被成功測序;通過統(tǒng)計學(xué)分析篩選得到了136個藻藍蛋白處理后具有表達差異的miRNA,其中74個顯著上調(diào),62個顯著下調(diào)。根據(jù)這些差異miRNA在不同樣本中的表達情況,可以聚類為4類不同的表達模式;實時熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)對上述miRNA進行表達量的驗證,與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果相吻合;此外,miRNA靶基因的Gene Ontology注釋和功能富集分析結(jié)果顯示,與細胞增殖信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控過程相關(guān)的靶蛋白例如PAK4、MAPK13、RASSF10等均被預(yù)測為差異miRNA的全新靶點,可能在藻藍蛋白抑制非小細胞肺癌增殖過程中起到重要的調(diào)控作用。不同于傳統(tǒng)的mRNA轉(zhuǎn)錄組測序,本研究采用小分子miRNA測序深入探究了藻藍蛋白抑制肺... 

【文章來源】：食品科學(xué). 2020,41(21)北大核心EICSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

藻藍蛋白對A549細胞體外增殖活性的影響

部分差異mi RNA的q PCR驗證

2.7 mi RNA的靶基因功能分析結(jié)果使用mi Randa軟件對篩選出的mi RNA進行靶基因的預(yù)測分析，共預(yù)測得到了5 186個潛在的靶基因。首先對這些靶基因進行了GO注釋分析，結(jié)果如圖7所示。GO注釋可將基因分為三大類：生物過程、細胞組分和分子功能。在生物過程中，靶基因功能主要集中在代謝調(diào)控、應(yīng)激反應(yīng)和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等；在細胞組分和分子功能中，主要集中在分子相互作用以及酶催化活性等。GO功能注釋提供了靶基因的功能分類，但缺乏具體的功能信息，因此，為全面分析受到藻藍蛋白調(diào)控mi RNA靶基因的功能，又對這些基因進行了GO富集分析（圖8）。結(jié)果顯示，細胞活動相關(guān)的許多生物學(xué)過程都在GO富集分析中出現(xiàn)顯著性差異，主要包括細胞離子轉(zhuǎn)運過程、細胞膜結(jié)構(gòu)的調(diào)控過程、細胞增殖信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控過程、細胞骨架系統(tǒng)形態(tài)發(fā)生過程等。藻藍蛋白對A549細胞具有明顯的增殖抑制作用，而GO富集分析中細胞增殖信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程與本研究相一致，進一步表明了測序結(jié)果的準確性。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]肺癌分子生物學(xué)研究進展[J]. 代水平,汪周峰,李為民.  腫瘤防治研究. 2018(10)
[2]肺癌的流行病學(xué)及治療現(xiàn)狀[J]. 姚曉軍,劉倫旭.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2014(08)



本文編號：3605926