發(fā)布時(shí)間：2017-12-09 11:37

  本文關(guān)鍵詞：腎癌中MMP-7的表達(dá)及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：研究背景腎細(xì)胞癌(Renal cell carcinoma,RCC)是成人腎臟最常見的惡性腫瘤,近年來隨著社會(huì)的進(jìn)步和經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,生活水平的提高,其發(fā)病率和死亡率呈上升趨勢。目前,雖然在生物治療與手術(shù)治療等方面取得了一定的進(jìn)展,但因腎癌具有發(fā)現(xiàn)晚、進(jìn)展快、轉(zhuǎn)移早、預(yù)后仍差的特點(diǎn),嚴(yán)重影響患者生活質(zhì)量。因此,進(jìn)一步對RCC相關(guān)基因的研究對探討腎癌的發(fā)生機(jī)制及腎癌的早期診斷、早期治療具有非常重要的意義。研究目的本研究旨在探討基質(zhì)溶解素(MMP-7)及微血管密度(MVD)在腎癌浸潤轉(zhuǎn)移中的作用,深入了解腎癌中癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的分子生理機(jī)制,初步建立腎癌相關(guān)基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型,為臨床上腎癌的靶向治療提供一定的理論依據(jù)。材料與方法1.收集80例來自鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院泌尿外科2014年3月-2015年10月手術(shù)切除,臨床資料完整和經(jīng)病理檢查確診的腎透明細(xì)胞癌組織標(biāo)本。其中男性50例,女性30例,年齡20~76歲。臨床分期標(biāo)準(zhǔn)(TNM)分為:TNM1期24例,TNM2期21例,TNM3期18例,TNM4期7例;按Fuhrman分級(jí),1級(jí)20例、2級(jí)28例、3級(jí)24例、4級(jí)4例;采用免疫組織化學(xué)S-P法檢測80例腎細(xì)胞癌及癌旁正常腎組織中MMP-7和MVD的表達(dá)情況。運(yùn)用SPSS21.0軟件分析兩者的表達(dá)與臨床病例特征之間的關(guān)系以及兩者之間的相關(guān)性。2.以MMP-7蛋白為研究對象,采用生物信息學(xué)方法,對其氨基酸組成、跨膜結(jié)構(gòu)、卷曲螺旋、亞細(xì)胞定位、信號(hào)肽、功能及各級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。3.利用基因本體數(shù)據(jù)庫(GO)和京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)對腎癌相關(guān)基因p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7和VHL等六種基因標(biāo)志物進(jìn)行GO功能分析和KEGG信號(hào)通路分析,初步建立腎癌調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。研究結(jié)果1.MMP-7在腎癌組織和癌旁正常組織中的表達(dá)率分別為65.00%,25.00%;腎癌組織和癌旁正常組織中MVD均值分別為(147.53±32.72),(53.17±11.87)。MMP-7及MVD在腎癌中的表達(dá)與癌旁正常組織中的表達(dá)分別比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);腎癌組織中MVD和MMP-7的表達(dá)均與腎包膜侵襲、病理分級(jí)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、不同臨床分期及腫瘤直徑密切相關(guān)(P0.05);與患者年齡,性別無關(guān)(P0.05;無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義);MMP-7陽性者的MVD值明顯高于陰性者,表明MMP-7陽性表達(dá)與MVD均呈正相關(guān)。2.MMP-7基因共含有1131bp,包含編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩個(gè)部分,編碼區(qū)共編碼了一條含有267個(gè)氨基酸的肽鏈,該肽鏈主要靠無規(guī)則卷曲和α螺旋,并進(jìn)一步超螺旋,形成了一個(gè)穩(wěn)定的中性親水蛋白。亞細(xì)胞定位分析結(jié)果顯示,該蛋白存在分泌途徑,且定位于胞外,N端1-17位氨基酸是信號(hào)肽剪切位點(diǎn),成熟肽鏈起始于第18氨基酸,可見該蛋白屬于分泌蛋白。通過功能結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)該蛋白含有兩個(gè)功能域,分別為PG結(jié)合域和ZnMc—MMP結(jié)構(gòu)域,并且發(fā)現(xiàn)該蛋白相互交聯(lián)的蛋白,也是癌細(xì)胞增殖轉(zhuǎn)移相關(guān)的蛋白。3.結(jié)合GO功能分析和KEGG信號(hào)通路分析結(jié)果,初步建立了由p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7、VHL和VEGF七個(gè)基因標(biāo)志物及其他相關(guān)基因組成的腎癌初級(jí)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。結(jié)論MMP-7與血管生成關(guān)系密切,聯(lián)合檢測MVD和MMP-7對RCC惡性程度的評(píng)估、轉(zhuǎn)移及其預(yù)后具有一定的研究價(jià)值;MMP-7蛋白屬于分泌蛋白,與該蛋白相互交聯(lián)的蛋白,也是癌細(xì)胞增殖轉(zhuǎn)移相關(guān)的蛋白;初步建立了p53、PTEN、MMP-9、KISS-1、MMP-7、VHL和VEGF基因標(biāo)志物參與的腎癌調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型,可作為腎癌靶向治療的潛在靶點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R737.11

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本文編號(hào)：1270275