本文關(guān)鍵詞：腫瘤代謝相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后相關(guān)性研究及其機(jī)制

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【摘要】：據(jù)最新流行病學(xué)數(shù)據(jù)顯示,肺癌已經(jīng)成為最為常見(jiàn)的惡性腫瘤,2012年全球肺癌新發(fā)病例約180萬(wàn),占新增癌癥病例總數(shù)的13%,已成為男性中發(fā)病率和死亡率最高的癌癥,在女性中發(fā)病率排第三位,死亡率排第二位。肺癌中約80%是非小細(xì)胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),由于我國(guó)肺癌篩查手段不足,難以做到早期診治,使得75%左右的NSCLC患者發(fā)現(xiàn)時(shí)已處中晚期,加上肺癌治療方法不夠規(guī)范和先進(jìn),僅有少數(shù)患者可通過(guò)手術(shù)獲益,造成了非小細(xì)胞肺癌的5年生存率較低,為此找到有效的分子標(biāo)志物用于NSCLC患者的早期診治及預(yù)后評(píng)估,對(duì)于提高肺癌患者的總體生存期具有重要意義。NSCLC治療的首選方案和最主要的治療方法是外科手術(shù)。為了提高肺癌外科手術(shù)的治愈率和患者的生存率,常常需在術(shù)前或術(shù)后進(jìn)行輔助化療、放療等治療。晚期NSCLC患者因不能手術(shù)或不宜手術(shù),臨床上建議采用放療,放、化療結(jié)合綜合治療也是目前局部晚期NSCLC廣泛應(yīng)用的治療策略。然而,由于腫瘤異質(zhì)性的特點(diǎn),采用同一種治療方案的不同患者療效差異顯著,為了解決這個(gè)問(wèn)題,個(gè)體化醫(yī)療的概念被提出,但目前臨床中仍缺乏有效的區(qū)分不同患者個(gè)體差異的標(biāo)志物,難以有效的區(qū)分患者個(gè)體差異實(shí)施個(gè)體化治療。目前,利用腫瘤細(xì)胞與正常細(xì)胞在分子、細(xì)胞水平差異,針對(duì)細(xì)胞受體、基因及調(diào)控分子等信號(hào)傳導(dǎo)為藥物靶點(diǎn)的分子靶向治療應(yīng)用已成為當(dāng)前肺癌臨床應(yīng)用研究領(lǐng)域的熱點(diǎn),但可以應(yīng)用到臨床實(shí)踐的標(biāo)志物仍然很少。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是基因組中由單個(gè)堿基變異或短片段插入缺少而引起人群中DNA序列的多態(tài)性,變異在人群中達(dá)到一定頻率(大于1%)。隨著SNP研究的深入,已發(fā)現(xiàn)多個(gè)癌基因或抑癌基因中SNP與包括腫瘤在內(nèi)多種疾病發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),另有SNP也可用于腫瘤化療療效評(píng)估。在NSCLC中已發(fā)現(xiàn)部分與患者預(yù)后密切相關(guān)的SNP,但數(shù)目較少,且利用單個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行評(píng)估時(shí)效果有限,為此尋找更多的可用于NSCLC預(yù)后評(píng)估的SNP位點(diǎn),制定聯(lián)合分析策略,在NSCLC個(gè)體化治療中具有重要意義。代謝異常是腫瘤重要特征之一,早在20世紀(jì)30年代,生物化學(xué)家Otto Warburg就發(fā)現(xiàn)即使在氧供充分的條件下腫瘤細(xì)胞依然保持旺盛的糖酵解,消耗大量葡萄糖。陸續(xù)研究發(fā)現(xiàn)腫瘤代謝重編程與腫瘤進(jìn)展密切相關(guān)。目前,腫瘤中已發(fā)現(xiàn)多條代謝通路發(fā)生改變包括糖代謝、核苷酸代謝、線粒體能量代謝等影響生命活動(dòng)的重要代謝通路。對(duì)于這些通路中關(guān)鍵基因的研究,尋找腫瘤特異的標(biāo)志物,有利于NSCLC臨床個(gè)體化治療開(kāi)展。目的:本研究以代謝通路關(guān)鍵基因?yàn)槟繕?biāo),尋找并證實(shí)與NSCLC患者預(yù)后密切相關(guān)的SNP標(biāo)志物,為臨床個(gè)體化治療提供更多策略。方法:入組病例來(lái)自第四軍醫(yī)大學(xué)唐都醫(yī)院胸外科,經(jīng)過(guò)剔除后最終入組500例NSCLC患者進(jìn)行研究。通過(guò)SEQUENOM Mass Array基因質(zhì)譜儀對(duì)上述樣本中代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)基因、三羧酸循環(huán)通路關(guān)鍵基因、糖代謝相關(guān)基因、核苷酸合成代謝基因共計(jì)15個(gè)基因43個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型檢測(cè),并結(jié)合患者臨床信息,采用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型、Kaplan-Meier法、Log-rank秩和檢驗(yàn)、生存樹(shù)分析等多種統(tǒng)計(jì)方法分析SNP不同基因型與NSCLC患者預(yù)后之間的相關(guān)性,并利用TCGA公共數(shù)據(jù)進(jìn)行基因差異表達(dá)和拷貝數(shù)分析。結(jié)果:研究發(fā)現(xiàn),在NSCLC中代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因CD98 SNP位點(diǎn)rs1059292WV+VV型患者與WW型患者相比,死亡風(fēng)險(xiǎn)顯著升高,并且rs1059292 WV+VV型患者與WW型患者相比,促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)以及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,該位點(diǎn)突變型可促進(jìn)CD98基因轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)。另一個(gè)基因MCT1 SNP位點(diǎn)rs1049434突變型患者與野性型患者相比死亡、復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)均顯著降低,MCT2基因SNP位點(diǎn)rs995343 VV型患者與WW+WV型患者相比死亡風(fēng)險(xiǎn)升高。還發(fā)現(xiàn)三羧酸循環(huán)通路關(guān)鍵酶基因SDHC SNP位點(diǎn)rs12064957 WV+VV型NSCLC患者與WW型患者相比,死亡風(fēng)險(xiǎn)顯著降低。IDH2基因SNP位點(diǎn)rs11540478在Additive模型下,突變型患者死亡風(fēng)險(xiǎn)顯著升高。另外,FH基因rs1414493位點(diǎn)WV+VV型患者與WW型患者相比,死亡風(fēng)險(xiǎn)顯著升高。生存樹(shù)分析發(fā)現(xiàn)rs1414493位點(diǎn)對(duì)患者死亡影響最大,rs4932158對(duì)患者復(fù)發(fā)影響最大。NSCLC患者中糖代謝相關(guān)基因GPI 2個(gè)SNP位點(diǎn)rs7248411,rs8191356 VV型患者與WW+WV患者相比死亡、復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)均顯著降低。2個(gè)SNP位點(diǎn)基因型進(jìn)行累積效應(yīng)分析發(fā)現(xiàn)危險(xiǎn)基因型對(duì)患者死亡、復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)隨危險(xiǎn)基因型個(gè)數(shù)增加而具有遞增趨勢(shì)。用腫瘤分化級(jí)別、TNM分期分層后GPI基因2個(gè)SNP位點(diǎn)仍與患者預(yù)后密切相關(guān)。核苷酸合成代謝基因TYMS SNP位點(diǎn)rs2847153 VV型NSCLC患者與WW+WV患者相比復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)顯著升高。rs2847153 WW+WV型患者中,術(shù)后化療患者與未化療患者相比死亡、復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)均顯著下降。另一個(gè)核苷酸代謝基因RRM2B SNP位點(diǎn)rs2290707和rs2853231 VV型患者與WW+WV患者相比復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)均顯著降低。結(jié)論:①代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)基因CD98、MCT1、MCT2中rs1059292、rs1049434、rs995343可用于NSCLC患者預(yù)后評(píng)估;②三羧酸循環(huán)通路基因中rs12064957、rs11540478、rs1414493等位點(diǎn)或可作為NSCLC患者早期預(yù)后不良的重要指標(biāo);③糖代謝相關(guān)基因GPI中rs7248411,rs8191356不同基因型與NSCLC患者預(yù)后密切相關(guān);④核苷酸代謝基因TYMS、RRM2B中rs2847153、rs2290707和rs2853231位點(diǎn)可作為NSCLC患者預(yù)后評(píng)判的指導(dǎo)依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：非小細(xì)胞肺癌 單核苷酸多態(tài)性 三羧酸循環(huán) 糖代謝 核苷酸合成代謝 預(yù)后
【學(xué)位授予單位】：第四軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R734.2
【目錄】：

• 縮略語(yǔ)表4-6
• 中文摘要6-9
• ABSTRACT9-13
• 前言13-14
• 文獻(xiàn)回顧14-31
• 正文31-96
• 第一部分 非小細(xì)胞肺癌樣本、信息收集及功能性SNP位點(diǎn)選擇與基因分型檢測(cè)31-45
• 1. 非小細(xì)胞肺癌樣本收集31-33
• 2．樣本臨床信息收集及預(yù)后分析33-36
• 3．功能性SNP位點(diǎn)篩選36-38
• 4．基于SEQUENOM Mass ARRAY?飛行質(zhì)譜儀的功能性SNP分型檢測(cè)38-44
• 5. 主要實(shí)驗(yàn)儀器及試劑44-45
• 第二部分 代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因CD98，，MCT SNP與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后研究及其機(jī)制45-68
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準(zhǔn)備45
• 2 方法45-53
• 3 結(jié)果53-66
• 4 討論66-68
• 第三部分 三羧酸循環(huán)通路關(guān)鍵基因SNP與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后研究及其機(jī)制68-78
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準(zhǔn)備68
• 2 方法68-70
• 3 結(jié)果70-76
• 4 討論76-78
• 第四部分 糖代謝相關(guān)基因GLUT1，GPI SNP與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后研究78-87
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準(zhǔn)備78
• 2 方法78-79
• 3 結(jié)果79-86
• 4 討論86-87
• 第五部分 核苷酸合成代謝基因TYMS，RRM2B SNP與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后研究87-96
• 1 血液樣本采集及臨床資料的準(zhǔn)備87
• 2 方法87-89
• 3 結(jié)果89-94
• 4 討論94-96
• 小結(jié)96-98
• 參考文獻(xiàn)98-106
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷和研究成果106-108
• 致謝108

本文編號(hào)：1029670