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鴨疫里默氏菌B739 0 873基因功能研究

發(fā)布時(shí)間:2024-03-20 20:13
  鴨疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer,RA)是嚴(yán)重危害鴨、鵝等禽類健康的重要病原,長(zhǎng)期使用抗菌藥物進(jìn)行防治,帶來了耐藥性增加等防治及公共衛(wèi)生問題。耐藥節(jié)結(jié)化細(xì)胞分化(Resistance nodulation division,RND)家族外排泵的表達(dá)是造成細(xì)菌多重耐藥重要原因之一,圍繞RA的基因組是否編碼具有RND外排泵、是怎樣介導(dǎo)RA耐藥等科學(xué)問題開展系列試驗(yàn)研究,主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:1鴨疫里默氏菌B7390873介導(dǎo)RA氨基糖苷類和去污劑類化合物耐藥對(duì)本實(shí)驗(yàn)室完成測(cè)序的RA-CH-1株的基因組進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)B7390781、B7390873和B7391785三個(gè)基因的編碼蛋白具有11-12個(gè)跨膜區(qū)(TM D),在TMD 1-2和TMD 6-7之間分別有一個(gè)小大約300 aa的周質(zhì)環(huán),且三個(gè)蛋白都位于細(xì)胞質(zhì)膜,他們的相鄰基因中,B7390782、B7390872和B7391783編碼膜融...

【文章頁(yè)數(shù)】:124 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
常用英文縮寫詞匯
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 鴨疫里默氏菌耐藥的研究概況
        1.1 鴨疫里默氏菌的耐藥現(xiàn)狀
        1.2 鴨疫里默氏菌耐藥相關(guān)因子的研究
    2 革蘭氏陰性菌RND外排泵的研究概況
        2.1 RND外排泵的基本特性
        2.2 RND外排泵的作用機(jī)制
    3 選題目的及意義
第二章 鴨疫里默氏菌B7390873的尋找及其功能鑒定
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        1.3 引物
        1.4 試劑
        1.5 儀器設(shè)備
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 生物信息學(xué)分析
        2.2 缺失株RA-CH-1ΔB7390873的構(gòu)建
        2.3 回補(bǔ)株RA-CH-1ΔB7390873pLMF03::B7390873的構(gòu)建
        2.4 生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
        2.5 體外競(jìng)爭(zhēng)能力的測(cè)定
        2.6 MIC的測(cè)定
        2.7 LD50的測(cè)定
    3 試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 RA-CH-1株RND外排泵基因的尋找
        3.2 缺失株RA-CH-1ΔB7390873的構(gòu)建
        3.3 回補(bǔ)株RA-CH-1ΔB7390873pLMF03::B7390873的構(gòu)建
        3.4 生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
        3.5 體外競(jìng)爭(zhēng)能力的測(cè)定
        3.6 MIC的測(cè)定
        3.7 LD50的測(cè)定
    4 討論
第三章 鴨疫里默氏菌B7390873工作能量來源的研究
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 菌株
        1.2 試劑
        1.3 儀器設(shè)備
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 適宜CCCP使用濃度的篩選
        2.2 加入CCCP后不同RA菌株的MIC檢測(cè)
        2.3 不同RA菌株對(duì)慶大霉素?cái)z入累積量的檢測(cè)
    3 試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 適宜CCCP使用濃度的測(cè)定
        3.2 加入CCCP后不同RA菌株MIC的測(cè)定
        3.3 不同RA菌株慶大霉素的累積能力的測(cè)定
    4 討論
第四章 鴨疫里默氏菌B7390873蛋白必需氨基酸位點(diǎn)研究
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        1.3 引物
        1.4 試劑
        1.5 儀器設(shè)備
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 序列比對(duì)
        2.2 氨基酸的突變?cè)瓌t
        2.3 突變片段B7390873X的PCR擴(kuò)增
        2.4 突變重組質(zhì)粒pLMF03::B7390873X的構(gòu)建與鑒定
        2.5 點(diǎn)突變回補(bǔ)株RA-CH-1ΔB7390873pLMF03::B7390873X鑒定
        2.6 點(diǎn)突變回補(bǔ)株的MIC檢測(cè)
        2.7 兔抗B7390873截段蛋白多克隆抗體的制備
        2.8 Western-blot檢測(cè)點(diǎn)突變回補(bǔ)株中B7390873X蛋白的表達(dá)
    3 試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 B7390873保守氨基酸的尋找
        3.2 突變片段B7390873X的PCR擴(kuò)增
        3.3 突變重組質(zhì)粒pLMF03::B7390873X的構(gòu)建
        3.4 點(diǎn)突變回補(bǔ)株RA-CH-1ΔB7390873pLMF03::B7390873X篩選
        3.5 點(diǎn)突變回補(bǔ)株MIC的測(cè)定
        3.6 兔抗B7390873截?cái)嗟鞍锥嗫寺】贵w的制備
        3.7 點(diǎn)突變回補(bǔ)株中B7390873X的表達(dá)
    4 討論
第五章 鴨疫里默氏菌B7390873功能需要B7390872參與
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.2 引物
        1.3 試劑
        1.4 儀器設(shè)備
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 B7390872和B7390873共轉(zhuǎn)錄的檢測(cè)
        2.2 雙缺失株RA-CH-1ΔB7390872ΔB7390873的構(gòu)建
        2.3 雙缺失回補(bǔ)株的構(gòu)建
        2.4 雙缺失株和雙缺失株回補(bǔ)株的MIC檢測(cè)
        2.5 重組表達(dá)質(zhì)粒pBAD24::B7390872、pBAD24::B7390873和pBAD24::B7390872-B7390873的構(gòu)建
        2.6 重組表達(dá)質(zhì)粒pBAD24::B7390872、pBAD24::B7390873 和p BAD24::B7390872-B7390873 的誘導(dǎo)表達(dá)
        2.7 化學(xué)交聯(lián)作用
        2.8 Western-blot
    3 試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 B7390872和B7390873共表達(dá)
        3.2 雙缺失株RA-CH-1ΔB7390872ΔB7390873的構(gòu)建
        3.3 雙缺失回補(bǔ)株的構(gòu)建
        3.4 雙缺失株和雙缺失株回補(bǔ)株MIC的測(cè)定
        3.5 重組表達(dá)質(zhì)粒pBAD24::B7390872、pBAD24::B7390873和pBAD24::B7390872-B7390873的構(gòu)建
        3.6 Western-blot檢測(cè)B7390872和B7390873的表達(dá)
    4 討論
第六章 鴨疫里默氏菌B7390870對(duì)B7390873調(diào)節(jié)作用研究
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.2 引物
        1.3 試劑
        1.4 儀器設(shè)備
    2 試驗(yàn)方法
        2.1 RA-CH-1株B7390873基因的誘導(dǎo)表達(dá)
        2.2 同源性分析
        2.3 缺失株RA-CH-1ΔB7390870的構(gòu)建
        2.4 B7390870、B7390871和B7390872共轉(zhuǎn)錄的檢測(cè)
        2.5 過表達(dá)株RA-CH-1pLMF03::B7390870的構(gòu)建
        2.6 RT-PCR
        2.7 過表達(dá)株RA-CH-1pLMF03::B7390870MIC的檢測(cè)
    3 試驗(yàn)結(jié)果
        3.1 RA-CH-1株B7390873基因的誘導(dǎo)表達(dá)
        3.2 B7390870核苷酸序列的同源性分析
        3.3 缺失株RA-CH-1ΔB7390870的構(gòu)建
        3.4 B7390870、B7390871和B7390872共轉(zhuǎn)錄的檢測(cè)
        3.5 過表達(dá)株RA-CH-1pLMF03::B7390870的構(gòu)建
        3.6 RT-PCR
        3.7 過表達(dá)株RA-CH-1pLMF03::B7390870MIC的測(cè)定
    4 討論
結(jié)論
本文的創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷



本文編號(hào):3933241

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