真核生物基因組極其復雜,不僅能夠產生編碼能力的m RNA同時還存在大量的非編碼RNA,真核生物基因組內大約98%的區(qū)域是非編碼RNA區(qū)域。過去十年時間對于非編碼RNA的研究主要集中于短的非編碼RNA,例如micro RNAs、small interfering RNAs和Piwi-associated RNAs。隨著高通量測序技術的發(fā)展,一類新型的非編碼RNA長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lnc RNA)被逐漸發(fā)現(xiàn)。植物中研究發(fā)現(xiàn)lnc RNA能夠調控植物的抗病、開花、產量和果實發(fā)育等重要的生物學過程。沙棘果實發(fā)育成熟過程受到多種調節(jié)因子的協(xié)同作用,通過對參與沙棘果實成熟發(fā)育過程的關鍵調節(jié)基因以及功能元件的進一步研究,能夠幫助研究人員更好的理解沙棘果實發(fā)育成熟過程中的分子調控機制,從而更好的進行沙棘的培育和育種工作。因此,本研究以內蒙古磴口縣種植的雜交種‘紅棘’沙棘的三個不同發(fā)育時期果實為試驗材料進行全轉錄組測序,通過建立生物信息學分析流程在全基因組水平上鑒定出高可信度沙棘長鏈非編碼RNA。對獲得的沙棘長鏈非編碼RNA進行了序列特征、染色體分布特征和表達特征分...

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【學位級別】：博士

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圖1-1miRNA經典和非經典合成途徑[28]

第一章緒論6合成途徑包括四種，包括經典的miRNA合成途徑、DroshaandDGCR8非依賴性途徑、TUTase依賴性途徑和Dicer非依賴性途徑[28]。如圖1-1所示，經典的合成途徑是在細胞核內miRNA基因首先由RNA聚合酶II催化轉錄生成pri-miRNA，隨之Dros....

圖1-2lncRNA分類[60]

第一章緒論161.1.3.1長鏈非編碼RNA（lncRNA）簡介長鏈非編碼RNA（Longnon-codingRNA，lncRNA）是一類長度超過200nt、缺乏蛋白編碼能力的內源性非編碼RNA分子[56]。通常情況下，在結構上大部分lncRNA都具有帽子結構和polyA尾。此外....

圖1-3lncRNA作用機制[65]

第一章緒論19圖1-3lncRNA作用機制[65]Fig.1-3lncRNAfunctionalmechanism[65]注：（A）lncRNA介導的順式基因調控（B）lncRNA位點的轉錄產生的表達調控影響（C）lncRNA位點處的DNA調控元件Note：(A)lncRNA-m....

圖1-4lncRNA作為內源模擬靶標發(fā)揮功能示意圖[75]

第一章緒論21圖1-4lncRNA作為內源模擬靶標發(fā)揮功能示意圖[75]Fig.1-4FunctiondiagramoflncRNAasanendogenoussimulatedtarget[75]注：（A）miRNA的一般機制：靶mRNA結合（B）miRNA：TM結合的一般機制....

本文編號：3891449