豬流行性腹瀉（Porcine epidemic diarrhea,PED）是由豬流行性腹瀉病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）引起的,主要癥狀以嘔吐、腹瀉和脫水為主的急性腸道傳染病。各年齡豬均可感染PEDV,但主要在仔豬中有較高的死亡率。近年來(lái),PEDV的不斷變異給PED的防控帶來(lái)了許多問(wèn)題。本研究圍繞PEDV的分子流行病學(xué)和新出現(xiàn)的S1基因N端區(qū)域大片段缺失毒株展開(kāi)研究,分析了PEDV的遺傳變異特征、建立了鑒別檢測(cè)PEDV經(jīng)典株和變異株的雙重TaqMan RT-qPCR方法并探究了PEDV S1蛋白N端區(qū)域的致病機(jī)制,取得了以下結(jié)果:1.檢測(cè)了從2014年7月至2015年7月收集的129份來(lái)自中國(guó)中部地區(qū)17個(gè)城市的仔豬腹瀉樣本。基于S糖蛋白[Spike,1-789個(gè)氨基酸（aa）]的S1亞基和ORF3基因,我們對(duì)來(lái)自11個(gè)城市21個(gè)豬場(chǎng)的21個(gè)代表性PEDV毒株進(jìn)行了遺傳變異分析。通過(guò)RT-PCR方法進(jìn)行PEDV的檢測(cè),通過(guò)DNAMAN 8軟件Clustal W方法分析S1和ORF3基因序列,并使用MEGA 6軟件鄰近法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)... 

【文章來(lái)源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

PEDV在冠狀病毒中的分類地位Fig.1-1TaxonomicstatusofPEDVinCoronaviruses

1-2 PEDV CV777 毒株(GenBank 登錄號(hào) AF353511)基因組示意圖(引自 Song and Park, 20. 1-2 Schematic representation of the PEDV genome based on the CV777 (GenBank accessionAF353511) strain(Song and Park, 2012)DV 蛋白特征制酶蛋白聚合體DV 的復(fù)制酶基因位于 5′端，長(zhǎng)度約占整個(gè)基因組的 2/3，含有兩個(gè)開(kāi)放閱讀別為 ORF1a 和 ORF1b(Woo et al., 2010)。這兩個(gè) ORFs 通過(guò)核糖體移位編碼兩制酶蛋白體 pp1a 和 pp1ab，進(jìn)而通過(guò)編碼的 nsp3 和 nsp5 蛋白酶活性加工成構(gòu)蛋白（nsps）。在 nsp1-nsp16 中，nsp1 是N末端的第一個(gè)切割產(chǎn)物(Ziebuhr, 200結(jié)構(gòu)蛋白的功能是合成多種核糖核酸并對(duì) PEDV 基因組所編碼的的蛋白進(jìn)行其中 nsp3 蛋白中含有兩個(gè)木瓜樣蛋白酶肽段（PLP），nsp5 中含有 3C 樣蛋白R(shí)O)，它們可以對(duì) ORF1a/b 的翻譯產(chǎn)物進(jìn)行自切割(Richard and Tulasne, 2012是 RNA 依賴的 RNA 聚合酶，nsp13 是解旋酶(Xu et al., 2011)。究發(fā)現(xiàn)(Zhang et al., 2016)，在 16 種 nsps 中，nsp1、nsp3、nsp7、nsp14、ns

第一章 豬流行性腹瀉病毒研究進(jìn)展 合活性，而已知 S1B結(jié)構(gòu)域作為大多數(shù)冠狀病毒的蛋白質(zhì)受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域起hultze et al., 1991; Schultze et al., 1996; Hofmann et al., 2005; Walls et al., 2016a; Wa 2016b)。相對(duì)于 S1 亞基，S2 亞基在氨基酸序列中更保守，并且包含有 I 類病毒中發(fā)現(xiàn)的典型結(jié)構(gòu)特征，包括疏水性融合肽（FP），七肽重復(fù)區(qū)（HR1 和 HR2端跨膜的 TM 區(qū)域（圖 1-3 a）。對(duì)于所有 I 類融合蛋白，通過(guò)將 FP 暴露并插入開(kāi)始膜融合，之后融合蛋白插入使得反平行的 HR1 和 HR2 區(qū)域形成穩(wěn)定的六構(gòu)。在這種轉(zhuǎn)變過(guò)程中，融合肽和跨膜結(jié)構(gòu)域緊密靠近，使病毒和細(xì)胞膜融合(E Kim, 2001)。

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
[1]豬傳染性胃腸炎和流行性腹瀉二聯(lián)核酸疫苗免疫效力研究[D]. 孟凡丹.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號(hào)：3645095