珍珠作為一種有機寶石廣泛用于飾品、化妝品等領域,而其仿生學材料的研發(fā)也是當前的研究熱點。珍珠質量的決定因素包括顏色、大小、形狀、光澤、光潔度、有核珍珠珠層厚度等6個方面,其中,顏色是決定珍珠質量的重要因素,不同顏色的珍珠價格相差較大。同時,根據幾丁質在珍珠質有機基質中所起的關鍵作用,以及幾丁質合成酶抑制后的貝殼形成情況,可以推測幾丁質與珍珠的大小、形狀、光澤等相關。與顏色決定、幾丁質形成等珍珠質量有關的分子機制仍不完全清楚,但均與珍珠形成過程密切相關。本研究利用三角帆蚌紫色和白色貝殼珍珠質顏色品系,應用羅氏454測序技術,開展轉錄組學研究,篩選與珍珠形成有關,特別是與珍珠質量有關的基因,篩查與珍珠質不同顏色有關的差異表達基因,研究幾丁質合成途徑的重要基因,豐富對淡水珍珠質量形成機制的認識。1.三角帆蚌外套膜c DNA文庫的構建和珍珠形成相關基因分析采用羅氏454測序技術從分泌紫色和白色珍珠質的三角帆蚌外套膜中獲得了981,302個高質量EST序列。從分泌紫色珍珠質的三角帆蚌外套膜c DNA文庫中獲得了541,268條序列,平均長度為298 bp;從分泌白色珍珠質的三角帆蚌外套膜c DN... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數】：108 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

受體蚌和供體蚌手術植片示意圖

分子功能一類中，大部分為具有結合功能的基因，占27.1%，其次為代謝活性（占16.2%）和蛋白結合（占15.9%）；細胞的生物學過程一類中主要為細胞過程和代謝過程，分別占20.4%和16.3%。具體的分類見圖2-2。圖2-2 根據推導的蛋白質序列的GO分類Fig 2-2 Gene Ontology classification of deduced protein sequences采用KEGG方法，共有5,023條推導的蛋白序列被歸類為特定的生物過程蛋白。在所有推導的蛋白質序列中，參與代謝過程的蛋白序列占24.7%，主要包括以下三種：糖類代謝、脂類代謝和氨基酸代謝。其他參與生物過程的蛋白序列有遺傳信息過程（15.5%）、細胞過程（11.5%）、生物系統(tǒng)（17.5%）、人類疾�。�16.7%）和環(huán)境信息過程（7.9%）等（圖2-3）。結構域是蛋白質分子中能獨立存在具有明顯功能或結構的功能單位，是重復出現的序列或結構單位，可能存在于多種生物或者多條序列中。在分子進化過程中，結構域作為一種可移動“積木”通過在基因中不同排列從而調節(jié)蛋白的功能。保守結構域數據庫（CDD）是NCBI Entrez查詢和檢索系統(tǒng)的一部分，CDD提供了帶有保守結構域足跡定位和從這些足跡中推斷的功能位點的蛋白質序列注釋[172]。通過COG搜索真核生物完整基因組數據庫，所有推導的蛋白序列均被注釋（E-value >1e-3）。共有23,727條蛋白序列參與信號傳導機制

上海海洋大學博士論文19圖2-3 推導的蛋白質的KEGG分類Fig 2-3 KEGG classification of deduced protein sequences

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3611069