生長(zhǎng)、屠宰及肉品質(zhì)性狀是肉雞產(chǎn)業(yè)重點(diǎn)關(guān)注的性狀,生長(zhǎng)速度、產(chǎn)肉性能及肉品質(zhì)直接影響產(chǎn)業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益。隨著科技的飛速發(fā)展,傳統(tǒng)育種方法與現(xiàn)代生物技術(shù)相結(jié)合,將大大縮短育種周期,這也成為當(dāng)前育種工作的重點(diǎn)。目前關(guān)于肉雞生長(zhǎng)發(fā)育規(guī)律和經(jīng)濟(jì)性狀遺傳機(jī)理的研究越來(lái)越多,研究的成果正逐步解析這些性狀形成的分子奧秘。因此,針對(duì)雞復(fù)雜的性狀選擇合適的研究方法成為科研工作者突破創(chuàng)新必經(jīng)之路。RNA-seq技術(shù)在轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方面,具有高效快捷、精確度高、技術(shù)成本相對(duì)較低的優(yōu)點(diǎn),可對(duì)任意物種的任意細(xì)胞類(lèi)型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行全局性檢測(cè),它不僅能夠分析轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)和表達(dá)模式,而且還能精確識(shí)別cSNP（編碼序列單核苷酸多態(tài)性）以及可變剪接位點(diǎn),因此,被認(rèn)為是研究復(fù)雜性狀最有效的工具之一。本研究以金茅黑雞（A系）為試驗(yàn)動(dòng)物,在生長(zhǎng)期采取2周齡、6周齡、10周齡（接近生長(zhǎng)拐點(diǎn)）和14周齡（上市日齡）胸肌樣本,利用RNA-seq測(cè)序和基因共表達(dá)研究方法,探索金茅黑雞生長(zhǎng)過(guò)程中全基因組范圍內(nèi)基因表達(dá)的變化情況,篩選出不同生長(zhǎng)階段特異性基因;在14周齡對(duì)金茅黑雞進(jìn)行群體屠宰,采取胸肌組織,測(cè)定體重、屠宰性狀和肉品質(zhì)性狀并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組關(guān)... 

【文章來(lái)源】：揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁(yè)數(shù)】：102 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖２－８各樣品ＦＰＫＭ密度分布對(duì)比圖??

終采用ＦＤＲ作為差異表達(dá)基因篩選的關(guān)鍵指標(biāo)�；鹕綀D（Ｖｏｌｃａｎｏ?Ｐｌｏｔ）可以快速地查看基??因在兩個(gè)（組）樣品中表達(dá)水平的差異，以及差異的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性。４組兩兩比較形成的表??達(dá)火山圖（圖２－９）。??Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ??１?＾?Ｉ?ｒｎ?１?＿??Ｉ?－?Ｉ?－?｜?＝??？?－?．．??ｌ°ｇ２，ＦＣ，?呦阢丨?Ｉ０Ｑ２，ＦＣ）??Ｗ２＿ｖｓ＿Ｗ６?Ｗ２＿ｖｓ＿ＷＩ（）?Ｗ２?ｖｓ?ＷＩ４??Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ??？?ｉｔｑｎｉｔＫｍ?５?Ｓ＜〇ｍｎｃａｎｉ?ｇ?Ｓｔ〇ｎＨｔＭ〇ｉ??ｓ?ｆｔＬＳｉ?５?＾?ｓ??＾?＾?ＴｆｔＵＣ?ａ?ＴＢｕｔ??ｉ〇〇２｜ＦＣ｜?ｌ〇８２｜ＦＣ）?ｌ〇〇２（ＦＣ）??Ｗ６?＿ｖｓ＿ＷＩ０?Ｗ６＿ｖｓ＿ＷＩ４?ＷＩＯ?ｖｓ?ＷＩ４??圖２－９差異表迗基因的火山圖??Ｆｉｇ．２－９?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｏｆ?ｖｏｌｃａｎｉｃ??

ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅ，ＧＳ）和模塊成員（ＭＭ）值之間的相關(guān)性，我們鑒定金茅黑雞胸肌生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程??中的階段特異性模塊，計(jì)算了每個(gè)模塊中所有基因的基因顯著性（ＧＳ）和模塊關(guān)系值??圖２－１１）。ＧＳ定義為基因與生長(zhǎng)階段之間的相關(guān)性的絕對(duì)值，ＭＭ值則定義為模塊??基因表達(dá)模式第一主成分與基因表達(dá)模式之間的相關(guān)性。如果模塊中基因ＧＳ值與ＭＭ值??之間高度相關(guān)（Ｐ＜〇．〇５），則說(shuō)明基因與性狀顯著相關(guān)，或者說(shuō)這些基因可能為階段特異性??模塊中的重要因子。此外，我們以ＭＥ值代表每個(gè)模塊中基因的表達(dá)水平，來(lái)計(jì)算每個(gè)模??塊表達(dá)水平與不同生長(zhǎng)階段之間的相關(guān)性（圖２－１２）。本研究中具有高度相關(guān)的ＧＳ和ＭＭ??值（Ｐ值＜０．０５）和ｃｏｒ（相關(guān)系數(shù)）＞０．８的的模塊被確定為不同生長(zhǎng)階段特定模塊［９４１。ＧＳ＞０．２??和ＭＭ＞０．８的基因在相應(yīng)模塊中被鑒定為樞紐基因。最終，共鑒定出４個(gè)階段特異型模??塊，每個(gè)生長(zhǎng)階段（Ｗ２，Ｗ６，Ｗ１０，Ｗ１４）鑒定出一個(gè)最顯著的模塊，分別為粉色（Ｗ２）、??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]我國(guó)肉雞產(chǎn)業(yè)市場(chǎng)狀態(tài)轉(zhuǎn)換及產(chǎn)業(yè)鏈價(jià)格非對(duì)稱(chēng)傳導(dǎo)研究——基于MS-VAR模型分析[J]. 鄭燕,馬驥.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(社會(huì)科學(xué)版). 2018(01)
[2]影響畜禽肌肉肌苷酸含量的因素及其相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J]. 李仲玉,劉培峰,李佳凝,劉洋,任海輪,陳盈霖,王超,徐良梅.  中國(guó)飼料. 2017(03)
[3]雙歧桿菌對(duì)雛雞腸道杯狀細(xì)胞數(shù)量及黏蛋白2含量的影響[J]. 張美曦,隋欣,劉超男,呂曉萍,鄭世民,高雪麗.  中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2016(12)
[4]雞腳重性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 陳則東,王文浩.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(10)
[5]雞IGF2基因外顯子1的多態(tài)性及其與生產(chǎn)性能的相關(guān)性[J]. 陳則東,沈曉鵬,穆洪云.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(06)
[6]EDAR參與綿羊毛發(fā)性狀與生長(zhǎng)的調(diào)節(jié)[J]. 劉寧,曹靖,衛(wèi)盼瑩,于秀菊,高淑媛,程笳琪,張昱,申艷,王海東,牛姝,赫曉燕.  中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2016(02)
[7]京海黃雞體組成性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 張濤,樊慶燦,張向前,張跟喜,王金玉,顧玉萍.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(09)
[8]烏珠穆沁羊生長(zhǎng)過(guò)程中骨骼肌MyHC基因變化[J]. 馮青輝,斯琴其木格,蘇和,朝格賽,薛寶玲,格日勒?qǐng)D.  肉類(lèi)研究. 2015(07)
[9]EDA基因及其信號(hào)通路在動(dòng)物皮膚毛囊發(fā)育中作用研究進(jìn)展[J]. 王小佳,賀建寧,柳楠.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(07)
[10]京海黃雞體重性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 張濤,王文浩,張跟喜,王金玉,薛倩,顧玉萍.  遺傳. 2015(08)

博士論文
[1]肉雞肌內(nèi)脂肪形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及相關(guān)基因研究[D]. 崔煥先.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[2]豬IGF-Ⅱ基因變異對(duì)豬生長(zhǎng)性狀及肌肉發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 虞德兵.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[3]雞肉肌苷酸和肌內(nèi)脂肪含量遺傳規(guī)律及相關(guān)候選基因的研究[D]. 陳繼蘭.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004

碩士論文
[1]CCDC152的功能研究[D]. 萬(wàn)娟.陜西師范大學(xué) 2016
[2]胚胎期至生長(zhǎng)早期雞肌肉發(fā)育及肌內(nèi)脂肪沉積蛋白質(zhì)組研究[D]. 王紅楊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]Plekhs1在小鼠子宮接受態(tài)轉(zhuǎn)變過(guò)程中的表達(dá)與調(diào)節(jié)[D]. 馬珍子.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]優(yōu)質(zhì)雞PRKAG3基因單核苷酸多態(tài)性與屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關(guān)研究[D]. 周娜娜.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[5]京海黃雞MC4R基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性的研究[D]. 李國(guó)輝.揚(yáng)州大學(xué) 2008
[6]野豬、家豬ACSL4基因的克隆、表達(dá)及多態(tài)性研究[D]. 郭麗娟.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]不同品種雞的肌纖維發(fā)育規(guī)律及其與肉質(zhì)的關(guān)系[D]. 劉冰.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號(hào)：3577557