半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關QTL定位及免疫相關基因篩選和功能分析
發(fā)布時間:2021-12-30 05:14
鲆鰈魚類在形態(tài)學分類上隸屬鰈形目。其中,半滑舌鰨是我國特有的,溫水性近海營底棲生活的海水魚類,主要分布于我國渤海、黃海等沿海地區(qū),在我國具有極高經(jīng)濟價值和較高的科學研究價值。為了更好的適應底棲生活方式,半滑舌鰨進化發(fā)展成為一種具有內(nèi)臟小,運動少,生長快,占用較少的水體生活空間等生物學特性的鲆鰈魚類,加之其肉味鮮美,口感爽滑,蛋白質(zhì)含量高,營養(yǎng)豐富,市場價格高,經(jīng)濟效益好等特點,深受廣大海水養(yǎng)殖者的喜愛,成為我國海水養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟魚類。哈維氏弧菌是半滑舌鰨養(yǎng)殖過程中細菌病的主要病原之一,嚴重影響了半滑舌鰨的經(jīng)濟價值并阻礙了半滑舌鰨養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展。本論文主要通過對半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關基因座進行定位,對免疫相關基因進行初步篩選及對免疫相關基因進行初步功能研究,以期為解析半滑舌鰨抗病機制提供研究基礎。1.半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病QTL定位及抗病免疫相關基因篩選為了方便篩選到與抗病免疫相關的候選基因,在實驗室之前的研究基礎上,對17號染色體(LG18連鎖群)已經(jīng)定位到的抗哈維氏弧菌病相關區(qū)間qE進行加密,在半滑舌鰨加密后的整合(LG18)、雌性(LG18F)、雄性(LG18M)連鎖群上定位到1...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:186 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1技術路線??Fig.?1-1?Technology?roadmap??
?第二章半滑舌鰨抗哈維氏弧菌。眩裕潭ㄎ患翱共∶庖呦嚓P基因篩選???100個微衛(wèi)星標記(SSR)位點并設計了引物進行基因分型,其中有33個標記統(tǒng)??計得到基因分型結果,分別得到整合圖譜(LG18)、雌性圖譜(LG18F)和雄性??圖譜(LG18M),如圖2-1和表2-2所示。??LG18?LG18F?LG18、I??_?〇.〇—Pl—chrl?7-16-17??O.O-H—chr17-12-119?〇.〇—F|—chrl?7-12-119??24.3?a?/-chrl?7-9-51??34.9?A?A-chrl?7-24-7?■??36.3?7r?chrl?7-21-67?F_F,??qK-.516-4^?1^7-18-75?K_,?I?■?,??q?44.9-\1?f/Chrl7-13-102?M?32.8?/?chrl7-18-75?■??45.2?Ap?r?chrl7-20-2?..?...?461?-Al?/r?chrl?7-20-2?33.8?chrl7-13-102??50.2?chrl?7-17-16?卟卜-5?54?5?飛\?廠?/f?chrl?7-13*31?351?^?chrl?7-17-46??52.0?A1?chrl7-13-31?61?9?"ft?ft?chrl7-16-28?37.2—二一?chrl7-13^103??53.6?chrl7-13-103?.?.?.67?4^?/f?chrl7-9-40?38.5?chrl7-20-2??59.6\?-?/chr17-16-28?qh?69.7?Wr?/!?chr17-17-131?40.8?
圖3-2半滑舌鰨必加5的基因組結構和可變剪切示意圖??注:(A)半滑舌鰨的基因組結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods(gsbay & MixP ) Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關微衛(wèi)星標記篩選及QTL定位[J]. 戴歡,劉洋,王文文,位戰(zhàn)飛,高進,高峰濤,李祥孔,劉洋,陳松林. 中國水產(chǎn)科學. 2017(01)
[3]中國大陸尼羅羅非魚引進群體間遺傳關系分析[J]. 唐首杰,楊潔,王成輝,李思發(fā),趙金良. 水生生物學報. 2017(01)
[4]半滑舌鰨CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位戰(zhàn)飛,郭華,李海龍,鄭衛(wèi)衛(wèi),王文文,戴歡,朱穎,劉洋,董忠典,陳松林. 中國水產(chǎn)科學. 2016(05)
[5]野生亞東鮭群體遺傳多樣性及其種質(zhì)來源研究[J]. 戶國,王芳,周建設,潘瑛子,李寶海,谷偉,孫鵬,白慶利,王炳謙. 東北農(nóng)業(yè)大學學報. 2016(01)
[6]半滑舌鰨體表潰瘍病病原的分離鑒定[J]. 徐曉麗,邵蓬,李賀密,姚學良,鄭艷坤,包海巖. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2015(11)
[7]半滑舌鰨腐皮病病原分離鑒定及對中草藥的敏感性實驗(英文)[J]. 高桂生,張艷英,史秋梅,高光平,韓紅升,黃曉媛,繳寶豐,,幀. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗遲緩愛德華菌病家系建立與抗病性能評價[J]. 張英平,陳松林,孫何軍,王磊,范彩霞,于洋,張文婷,楊英明,張永珍,田永勝,鄧寒,陳紅林,劉肖峰,吳婭紅. 水產(chǎn)學報. 2014(11)
[9]半滑舌鰨性別特異微衛(wèi)星標記的SCAR轉(zhuǎn)化及其應用[J]. 劉洋,陳松林,高峰濤,孟亮,胡喬木,宋文濤,邵長偉,呂為群. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2014(06)
[10]我國高附加值海水養(yǎng)殖業(yè)經(jīng)濟分析——以半滑舌鰨為例[J]. 郭鴻鵠,楊正勇. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2013(10)
博士論文
[1]半滑舌鰨和牙鲆變態(tài)相關基因座定位及抗病性狀的基因組選擇[D]. 劉洋.南京農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]半滑舌鰨經(jīng)濟性狀的遺傳評估及基因組選擇初步研究[D]. 劉峰.上海海洋大學 2015
碩士論文
[1]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin2基因的分子克隆、表達模式及其在肌肉發(fā)育過程中功能的初步探究[D]. 楊芳.中國海洋大學 2015
[2]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達分析[D]. 劉田田.中國海洋大學 2015
本文編號:3557547
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:186 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1技術路線??Fig.?1-1?Technology?roadmap??
?第二章半滑舌鰨抗哈維氏弧菌。眩裕潭ㄎ患翱共∶庖呦嚓P基因篩選???100個微衛(wèi)星標記(SSR)位點并設計了引物進行基因分型,其中有33個標記統(tǒng)??計得到基因分型結果,分別得到整合圖譜(LG18)、雌性圖譜(LG18F)和雄性??圖譜(LG18M),如圖2-1和表2-2所示。??LG18?LG18F?LG18、I??_?〇.〇—Pl—chrl?7-16-17??O.O-H—chr17-12-119?〇.〇—F|—chrl?7-12-119??24.3?a?/-chrl?7-9-51??34.9?A?A-chrl?7-24-7?■??36.3?7r?chrl?7-21-67?F_F,??qK-.516-4^?1^7-18-75?K_,?I?■?,??q?44.9-\1?f/Chrl7-13-102?M?32.8?/?chrl7-18-75?■??45.2?Ap?r?chrl7-20-2?..?...?461?-Al?/r?chrl?7-20-2?33.8?chrl7-13-102??50.2?chrl?7-17-16?卟卜-5?54?5?飛\?廠?/f?chrl?7-13*31?351?^?chrl?7-17-46??52.0?A1?chrl7-13-31?61?9?"ft?ft?chrl7-16-28?37.2—二一?chrl7-13^103??53.6?chrl7-13-103?.?.?.67?4^?/f?chrl7-9-40?38.5?chrl7-20-2??59.6\?-?/chr17-16-28?qh?69.7?Wr?/!?chr17-17-131?40.8?
圖3-2半滑舌鰨必加5的基因組結構和可變剪切示意圖??注:(A)半滑舌鰨的基因組結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods(gsbay & MixP ) Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關微衛(wèi)星標記篩選及QTL定位[J]. 戴歡,劉洋,王文文,位戰(zhàn)飛,高進,高峰濤,李祥孔,劉洋,陳松林. 中國水產(chǎn)科學. 2017(01)
[3]中國大陸尼羅羅非魚引進群體間遺傳關系分析[J]. 唐首杰,楊潔,王成輝,李思發(fā),趙金良. 水生生物學報. 2017(01)
[4]半滑舌鰨CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位戰(zhàn)飛,郭華,李海龍,鄭衛(wèi)衛(wèi),王文文,戴歡,朱穎,劉洋,董忠典,陳松林. 中國水產(chǎn)科學. 2016(05)
[5]野生亞東鮭群體遺傳多樣性及其種質(zhì)來源研究[J]. 戶國,王芳,周建設,潘瑛子,李寶海,谷偉,孫鵬,白慶利,王炳謙. 東北農(nóng)業(yè)大學學報. 2016(01)
[6]半滑舌鰨體表潰瘍病病原的分離鑒定[J]. 徐曉麗,邵蓬,李賀密,姚學良,鄭艷坤,包海巖. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2015(11)
[7]半滑舌鰨腐皮病病原分離鑒定及對中草藥的敏感性實驗(英文)[J]. 高桂生,張艷英,史秋梅,高光平,韓紅升,黃曉媛,繳寶豐,,幀. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗遲緩愛德華菌病家系建立與抗病性能評價[J]. 張英平,陳松林,孫何軍,王磊,范彩霞,于洋,張文婷,楊英明,張永珍,田永勝,鄧寒,陳紅林,劉肖峰,吳婭紅. 水產(chǎn)學報. 2014(11)
[9]半滑舌鰨性別特異微衛(wèi)星標記的SCAR轉(zhuǎn)化及其應用[J]. 劉洋,陳松林,高峰濤,孟亮,胡喬木,宋文濤,邵長偉,呂為群. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2014(06)
[10]我國高附加值海水養(yǎng)殖業(yè)經(jīng)濟分析——以半滑舌鰨為例[J]. 郭鴻鵠,楊正勇. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2013(10)
博士論文
[1]半滑舌鰨和牙鲆變態(tài)相關基因座定位及抗病性狀的基因組選擇[D]. 劉洋.南京農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]半滑舌鰨經(jīng)濟性狀的遺傳評估及基因組選擇初步研究[D]. 劉峰.上海海洋大學 2015
碩士論文
[1]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin2基因的分子克隆、表達模式及其在肌肉發(fā)育過程中功能的初步探究[D]. 楊芳.中國海洋大學 2015
[2]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達分析[D]. 劉田田.中國海洋大學 2015
本文編號:3557547
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