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大豆對大豆疫霉菌侵染響應的轉錄組學和代謝組學研究

發(fā)布時間:2021-11-08 18:33
  大豆[Glycine max(L.)Merr]廣泛栽培于世界各地,是重要的糧食作物之一,同時也是重要的植物蛋白質來源及食用油的原料。大豆種植過程中經常因為病害導致產量損失,品質降低,從而導致經濟損失。其中大豆疫霉根腐。≒hytophthora root rot,簡稱PRR)是最嚴重的病害之一。大豆疫霉根腐病是由土傳卵菌大豆疫霉菌(Phytophthora sojae Kaufmann&Gerdemann,簡稱P.sojae)引起的具有毀滅性的病害,在世界各地大豆種植區(qū)廣泛發(fā)生,造成大量的經濟損失。利用抗耐品種是防治大豆疫霉根腐病最有效最環(huán)保方法。為此研究人員進行了大量的抗源篩選和抗性基因發(fā)掘工作并定位到了大量抗性基因(Rps)旨在培育新的抗病品種。然而,對于已定位到的Rps基因的分離克隆、Rps基因介導的分子抗病機制、育種應用等研究還尚少。了解Rps基因介導的分子抗病機制能夠為后續(xù)的功能研究工作指明方向并為育種工作提供新的思路從而加速育種進程,同時也利于克服完全抗性基因有效時間短、可能造成減產等局限性從而培育具有更持久更光譜抗性且穩(wěn)產的品種。本研究利用RNA-Seq和GC-M... 

【文章來源】:南京農業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

大豆對大豆疫霉菌侵染響應的轉錄組學和代謝組學研究


圖1-3?1999至2017年代謝組學相關的文獻數(shù)量統(tǒng)計(中文文獻數(shù)據(jù)源自CNKI數(shù)據(jù)庫,??英文文獻數(shù)據(jù)源自ScienceDirect數(shù)據(jù)庫)??

流程圖,流程,技術,色譜技術


^?^?f?NMR?^?f—監(jiān)督:?i據(jù)庫:??動物f組織?蛋白質沉淀?GC-MS?PC?A?HMDB??細胞?去除大顆粒物質?LC-MS?HCA?METLIN??飭峰物體液?萃取代謝物?CE-MS?非監(jiān)督:?KEGG??L培養(yǎng)液?衍生化?IR?ANN?ARM??V?J?V?J?HPLC?PLS-DA?NIST??HPCE?OPLS-DA?HumanC\c??CE-UV???LipidBank??v???J?v???J??圖1-4代謝組學研究通用流程??Figurel-4?Overview?of?metabolomics/metabonomics?studies?flowchart?and?data?analysis??NMR能迅速、準確地提供分子的化學結構信息,從而成為物質結構和理化性質??表征分析的常規(guī)技術手段。NMR技術中主要應用的有氫譜^H-NMR)、碳譜(13C-??NMR)和磷譜(31?P-NMR),其中1?H-NMR因其對含氫化合物均有響應,能完成樣品??中大多數(shù)化合物的檢測所以應用最為廣泛(許國旺等,2007)。NMR有一個別的技術??無法比擬的優(yōu)勢,即NMR能在不破壞樣本且不需樣品前處理的前提下完成檢測,??因此NMR在臨床診斷方面應用較多。除了無創(chuàng)性,NMR檢測還具有無偏向性,較??好的客觀性和重現(xiàn)性,操作簡易,較高的通量和較低成本等優(yōu)勢。但是同時也有著??不足之處:要求待測物質含有具核磁矩的核素,與質譜法相比檢測靈敏度相對較??低、動態(tài)范圍小等。這些缺陷決定了?NMR對于復雜的植物代謝組學研究適用性較??低。目前,色譜技術主要有氣相色譜和液

分布圖,錯誤率,測序,堿基


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【參考文獻】:
期刊論文
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[2]華南大豆種質對疫霉根腐病的抗性分析[J]. 程艷波,馬啟彬,牟英輝,譚志遠,吳鴻,年海.  中國農業(yè)科學. 2015(12)
[3]代謝組學技術及其在中醫(yī)藥研究中的應用[J]. 趙珊,王鵬程,馮健,陳自力,王秋紅,匡海學.  中草藥. 2015(05)
[4]第三代測序技術及其應用[J]. 張得芳,馬秋月,尹佟明,夏濤.  中國生物工程雜志. 2013(05)
[5]轉錄組與RNA-Seq技術[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀志賓,王建民.  生物技術通報. 2012(12)
[6]Identification, Genetic Analysis and Mapping of Resistance to Phytophthora sojae of Pm28 in Soybean[J]. WU Xiao-ling1, 2, ZHANG Bao-qiang1, SUN Shi1, ZHAO Jin-ming1, YANG Feng2, GUO Na1, GAI Jun-yi1 and XING Han1 1 Soybean Research Institute, Nanjing Agricultural University/National Center for Soybean Improvement/National Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Nanjing 210095, P.R.China 2 College of Agriculture, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, P.R.China.  Agricultural Sciences in China. 2011(10)
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[8]代謝組學及其分析技術[J]. 王斯婷,李曉娜,王皎,凌笑梅.  藥物分析雜志. 2010(09)
[9]大豆品種早熟18抗疫霉根腐病基因的SSR分子標記[J]. 姚海燕,王曉鳴,武小菲,肖炎農,朱振東.  植物遺傳資源學報. 2010(02)
[10]大豆品種豫豆25抗疫霉根腐病基因的鑒定[J]. 范愛穎,王曉鳴,方小平,武小菲,朱振東.  作物學報. 2009(10)

博士論文
[1]向日葵響應黃萎病菌侵染的轉錄組分析及抗病相關基因挖掘[D]. 郭樹春.內蒙古大學 2017
[2]大豆疫霉根腐病抗源篩選及抗性基因定位[D]. 孫聚濤.南京農業(yè)大學 2014
[3]大豆疫霉根腐病抗性評價、基因定位及抗性相關基因的篩選[D]. 武曉玲.南京農業(yè)大學 2009
[4]大豆疫霉根腐病抗性的遺傳分析及基因定位的初步研究[D]. 孫石.南京農業(yè)大學 2008

碩士論文
[1]大豆對大豆疫霉根腐病的抗源篩選、基因定位及抗病相關基因表達分析[D]. 胡冠軍.南京農業(yè)大學 2013
[2]大豆疫霉侵染過程的分子細胞學研究[D]. 陶愷.南京農業(yè)大學 2012
[3]大豆對大豆疫霉根腐病的抗源篩選及抗性遺傳分析[D]. 張寶強.南京農業(yè)大學 2010



本文編號:3484005

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