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利用轉錄組和蛋白質組測序篩選綿羊多羔基因的研究

發(fā)布時間:2021-10-15 04:41
  產(chǎn)羔數(shù)是一個受微效多基因控制的數(shù)量性狀,很難通過傳統(tǒng)的育種手段來快速提高。因此,尋找與綿羊產(chǎn)羔數(shù)性狀相關的基因和分子標記一直都是育種學家關注的熱點。近年來,隨著生物技術的發(fā)展,轉錄組分析、基因組重測序、蛋白質組學以及代謝組等各種組學技術已經(jīng)成為挖掘綿羊多羔基因的重要工具。目前,關于綿羊產(chǎn)羔數(shù)性狀的研究主要集中在垂體、卵巢和睪丸,然而有關綿羊子宮與產(chǎn)羔數(shù)相關的研究報道甚少。因此,在本研究中以FecB++基因型(無FecB突變)小尾寒羊母羊為研究對象,首先利用子宮RNA-Seq和子宮蛋白質組學技術篩選與綿羊多羔性狀相關的差異表達的mRNA和差異表達的蛋白質;其次利用MassARRAY技術對篩選的候選基因進行質譜分型并與小尾寒羊產(chǎn)羔數(shù)關聯(lián)分析,以期為解析綿羊多羔性狀的分子機制提供理論基礎。主要研究結果如下:1.綿羊子宮轉錄組學研究通過對卵泡期和黃體期的FecB++基因型單、多羔小尾寒羊的子宮組織進行RNA-Seq后,在卵泡期,與單羔組(MG)相比,多羔組(PG)中有166個差異表達的mRNA,其中33個上調、133個下調;473個差異表達的lncRNA,其中242個上調、231個下調;147... 

【文章來源】:甘肅農業(yè)大學甘肅省

【文章頁數(shù)】:123 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

利用轉錄組和蛋白質組測序篩選綿羊多羔基因的研究


LncRNA基因特征和表達分析

靶基因,富集,卵泡期,黃體


甘肅農業(yè)大學2020屆博士學位論文26圖2-2對差異表達的mRNA和差異表達的lncRNA的靶基因進行GO富集分析Fig.2-2GOenrichmentanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandtargetgenesofdifferentiallyexpressedlncRNAs(A)卵泡期的差異表達的mRNA的GO分析;(B)黃體期的差異表達的mRNA的GO分析;(C)卵泡期的差異表達的lncRNA的靶基因的GO分析;(D)黃體期的差異表達的lncRNA的靶基因的GO分析(A)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(B)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthelutealphase;(C)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(D)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthelutealphase.

富集,卵泡期,黃體


利用轉錄組和蛋白質組測序篩選綿羊多羔基因的研究27圖2-3差異表達mRNA和lncRNA的KEGG富集分析Fig.2-3KEGGpathwayanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandlncRNAs(A)卵泡期差異表達mRNA的KEGG富集分析;(B)黃體期差異表達mRNA的KEGG富集分析;(C)卵泡期差異表達lncRNA的KEGG富集分析;(D)黃體期差異表達lncRNA的KEGG富集分析。(A)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthefollicularphase;(B)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthelutealphase;(C)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthefollicularphase;(D)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthelutealphase.

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Analyses of circRNA profiling during the development from pre-receptive to receptive phases in the goat endometrium[J]. Yuxuan Song,Lei Zhang,Xiaorui Liu,Mengxiao Niu,Jiuzeng Cui,Sicheng Che,Yuexia Liu,Xiaopeng An,Binyun Cao.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(03)
[2]6群不同品種(系)綿羊BMPR-IB基因多態(tài)性及與產(chǎn)羔數(shù)的關系研究[J]. 陳勇,雒秋江,李登忠,張亞軍,楊風云,楊菊清,朱文淵.  新疆農業(yè)大學學報. 2008(02)
[3]5個綿羊群體的BMPR-IB基因多態(tài)性分析[J]. 王公金,竇德宇,花衛(wèi)華,聶曉偉,儲國良,徐曉波,趙偉,劉亞柏.  江蘇農業(yè)學報. 2007(05)

博士論文
[1]利用轉錄組測序和蛋白質組學分析篩選綿羊多羔候選基因的研究[D]. 湯繼順.中國農業(yè)科學院 2019
[2]FecB基因影響小尾寒羊繁殖力的分子機制研究[D]. 郭曉飛.中國農業(yè)大學 2018

碩士論文
[1]MGST1基因調控雞胚肝細胞的分子機制研究[D]. 施肇源.合肥工業(yè)大學 2019



本文編號:3437440

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