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我國圈養(yǎng)小熊貓種群遺傳多樣性分析與親權(quán)鑒定

發(fā)布時(shí)間:2020-08-05 09:03
【摘要】:小熊貓(Ailurus fulgens)是亞洲特有的珍稀動(dòng)物。目前,野生小熊貓正受到棲息地減少,片斷化和人類活動(dòng)干擾等威脅,屬于瀕危物種。小熊貓?jiān)谥袊延?0年的圈養(yǎng)歷史,曾經(jīng)有47個(gè)機(jī)構(gòu)飼養(yǎng)過小熊貓,圈養(yǎng)種群現(xiàn)存數(shù)量約300多只。關(guān)于圈養(yǎng)小熊貓種群遺傳多樣性僅有成都大熊貓基地等少數(shù)群體有過研究報(bào)道,中國大部分地區(qū)圈養(yǎng)小熊貓的遺傳多樣性狀況不明。國際小熊貓譜系于1978年建立,中國小熊貓譜系于1998年建立。由于后代父權(quán)不清、原始記錄不詳實(shí)、個(gè)體標(biāo)識缺失,部分個(gè)體來源不明等原因?qū)е轮袊⌒茇堊V系不完整。因此,亟須加強(qiáng)我國圈養(yǎng)小熊貓種群遺傳多樣性評價(jià)及譜系鑒定工作。微衛(wèi)星標(biāo)記由于具有多態(tài)性豐富,呈孟德爾共顯性遺傳方式等特性被廣泛用于瀕危動(dòng)物的遺傳學(xué)研究。本研究對現(xiàn)有的小熊貓微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行廣泛篩選,最終確定了能夠用于小熊貓的遺傳多樣性研究的微衛(wèi)星位點(diǎn)。分別采集中國境內(nèi)11個(gè)小熊貓圈養(yǎng)群體(福州大熊貓研究中心,無錫動(dòng)物園,上海動(dòng)物園、北京動(dòng)物園、番禺長隆香江野生動(dòng)物園、廣州動(dòng)物園、重慶動(dòng)物園、大足飼養(yǎng)場、四川冕寧飼養(yǎng)場、黃山動(dòng)物園、溫嶺動(dòng)物園)的116只個(gè)體樣本,約占現(xiàn)有圈養(yǎng)種群數(shù)量的三分之一。應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記對它們進(jìn)行遺傳多樣性評估及遺傳結(jié)構(gòu)分析,并對福州群體進(jìn)行親權(quán)鑒定的研究,構(gòu)建福州圈養(yǎng)小熊貓的種群遺傳譜系圖。主要研究結(jié)果如下:1.圈養(yǎng)種群(N=116)平均等位基因數(shù)、期望雜合度、觀察雜合度分別為9.3、0.730、0.719,胡義波等人研究的野生群體(N=105)分別為9.2、0.719、0.679,二者同樣具有較高的遺傳多樣性。11個(gè)圈養(yǎng)群體都具有較高的遺傳多樣性,平均基因豐富度3.05(北京)-4.026(冕寧),期望雜合度0.631(黃山)~0.782(溫嶺),其中福州和無錫群體極顯著偏離Hardy-Weinberg平衡。圈養(yǎng)小熊貓的遺傳管理重點(diǎn)不是引進(jìn)野生個(gè)體充實(shí)圈養(yǎng)種群,而是應(yīng)制定科學(xué)的繁殖計(jì)劃,避免近交,從而維持圈養(yǎng)種群的遺傳多樣性。2.所有種群內(nèi)各個(gè)亞群體固定系數(shù)(FST)為0.055,表明11個(gè)群體遺傳分化水平低,僅有5.5%的變異來自于種群間,94.5%的變異來自于種群內(nèi)部個(gè)體間。3.以微衛(wèi)星為基礎(chǔ)的聚類分析將11個(gè)群體聚為兩簇,福州部分個(gè)體聚為獨(dú)立一簇。4.應(yīng)用Cervus軟件處理基因型數(shù)據(jù),親權(quán)模擬(Simulation)來評估在母子關(guān)系確實(shí)的情況下的可信度,19個(gè)基因座位的聯(lián)合父權(quán)排除概率為0.99999968,置信度為95%;利用6個(gè)已知雙親的后代檢驗(yàn)19個(gè)基因座位的可信度,后代與雙親的基因型完全符合孟德爾遺傳定律,僅需要其中7個(gè)座位就能夠有效確認(rèn)小熊貓的親權(quán)關(guān)系,成功鑒定出15個(gè)后代的生物學(xué)父親。5.親權(quán)鑒定的結(jié)果顯示同一窩小熊貓均來自單一父權(quán)。基因型比對結(jié)果表明7對雙胞均屬于異卵雙生。福州群體的后代中除920#和921#外,其余均源于487#或898#兩只雄性,表明不同個(gè)體參與繁殖的機(jī)會不均等。因此,加強(qiáng)瀕危野生動(dòng)物種群管理,科學(xué)制定繁殖計(jì)劃具有積極的現(xiàn)實(shí)意義。
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S865.3
【圖文】:

分布圖,小熊貓,分布圖,物種


圖1-1小熊貓?jiān)谌虻姆植紙D(陰彰部分)twFig.l-l邋Global邋山S任化山ions邋(Shaded邋area)邋of邋化e邋化d邋panda[i*]逡逑的溯危引起國際社會的高度關(guān)注。1994年榦危動(dòng)植物物種國熊貓列為附錄I物種;2000年,國際自然及自然資源保護(hù)同

個(gè)體基因型,分型,位點(diǎn),產(chǎn)物


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個(gè)體基因型,分型,位點(diǎn),產(chǎn)物


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本文編號:2781328

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