目的:藥物過敏性猝死的法醫(yī)學(xué)診斷是法醫(yī)病理學(xué)界的一大難題,尋找精準(zhǔn)、客觀的實(shí)驗(yàn)室診斷指標(biāo)是法醫(yī)病理學(xué)者目前亟待解決的問題。通過研究分析藥物過敏死者與免疫正常人之間的DNA甲基化差異,尋找藥物過敏相關(guān)DNA甲基化差異位點(diǎn)、為藥物過敏性猝死的法醫(yī)學(xué)鑒定提供精準(zhǔn)、客觀的實(shí)驗(yàn)室診斷指標(biāo)。方法:1.免疫正常人（6例）和藥物過敏性猝死者（18例）,使用Illumina Methylation EPIC芯片檢測全血DNA甲基化。2.芯片數(shù)據(jù)分析:R語言ChAMP包進(jìn)行甲基化DMP、DMR差異分析、基因注釋和基因關(guān)聯(lián)分析;R語言R-topGO、R-KOBAS軟件包進(jìn)行GO及KEGG功能富集分析。3.基于基因組關(guān)聯(lián)分析、GO及KEGG功能富集分析的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步進(jìn)行藥物過敏相關(guān)DNA甲基化位點(diǎn)（區(qū)域）功能的研究。4.基于DMP、DMR差異分析和基因關(guān)聯(lián)分析,進(jìn)行選藥物過敏性猝死DNA甲基化診斷指標(biāo)的篩選。結(jié)果:1.HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOB、HLA-DPA1、HLA-DPB1基因的甲基化水平與藥物過敏猝死顯著關(guān)聯(lián);2.頭孢菌素類藥物所致過敏性猝死與趨化因子CCL5基因啟動(dòng)子區(qū)域的DN... 

【文章來源】：山西醫(yī)科大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】：49 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

所有樣本的CpG分布圖

山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文8圖2.所有樣本的探針密度圖此次樣本檢測共使用三張EPIC芯片，使用SVD分析評估，發(fā)現(xiàn)三次檢測存在批次效應(yīng)；使用champ.runCombat()函數(shù)去除批次效應(yīng)，結(jié)果見圖3。去除批次效應(yīng)后SVD分析p值不顯著，批次效應(yīng)消除。圖3.SVD分析圖注：左為去除批次效應(yīng)前，右為去除批次效應(yīng)后

山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文8圖2.所有樣本的探針密度圖此次樣本檢測共使用三張EPIC芯片，使用SVD分析評估，發(fā)現(xiàn)三次檢測存在批次效應(yīng)；使用champ.runCombat()函數(shù)去除批次效應(yīng)，結(jié)果見圖3。去除批次效應(yīng)后SVD分析p值不顯著，批次效應(yīng)消除。圖3.SVD分析圖注：左為去除批次效應(yīng)前，右為去除批次效應(yīng)后

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]寶塔紅在過敏性猝死尸檢中的應(yīng)用初探[J]. 譚曉輝,陳娜,羅寶英,曾嘉敏,李佳,王慧君.  中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]Mast cell tryptase and carboxypeptidase A expression in body fluid and gastrointestinal tract associated with drug-related fatal anaphylaxis[J]. Xiang-Jie Guo,Ying-Yuan Wang,Hao-Yue Zhang,Qian-Qian Jin,Cai-Rong Gao.  World Journal of Gastroenterology. 2015(47)



本文編號(hào)：3418178