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16S rDNA高通量測(cè)序分析肉芽腫性小葉性乳腺炎的菌群特征

發(fā)布時(shí)間:2021-07-11 04:09
  目的:探討改進(jìn)肉芽腫性小葉性乳腺炎病灶中細(xì)菌檢測(cè)的方法,評(píng)估比較肉芽腫性小葉性乳腺炎中的肉芽腫和病灶旁組織中的菌群分布差異,進(jìn)一步研究肉芽腫性小葉性乳腺炎與細(xì)菌感染的關(guān)系。方法:收集2018年6月2020年4月于湖南省人民醫(yī)院初治新發(fā)的46例經(jīng)病理確診的肉芽腫性小葉性乳腺炎患者的病例資料,選擇術(shù)前2周內(nèi)未進(jìn)行抗感染治療的14例患者作為研究對(duì)象,于手術(shù)室無(wú)菌條件下收取每例患者的肉芽腫病灶、病灶旁組織(介于正常組織和病灶之間的組織,且距離病灶至少12cm)以及膿液樣本各1份,共取得36份樣本(其中膿液樣本9份,肉芽腫樣本14份,病灶旁組織樣本13份),將收集到的9份膿液樣本及時(shí)接種于培養(yǎng)基中,進(jìn)行微生物培養(yǎng)與鑒定。另將收集到的14份肉芽腫組織樣本設(shè)置為RY組,13份病灶旁組織樣本設(shè)置為ZF組,提取兩組樣本的DNA,應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)RY及ZF組菌群進(jìn)行16S rDNA測(cè)序,并利用QIIME等軟件將測(cè)序結(jié)果與16S數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)進(jìn)行物種注釋,根據(jù)物種豐度信息進(jìn)行物種分類(lèi)與豐度分析、Alpha多樣性分析及Beta多樣性分析,進(jìn)一步對(duì)肉芽腫性小葉性乳腺... 

【文章來(lái)源】:湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

16S rDNA高通量測(cè)序分析肉芽腫性小葉性乳腺炎的菌群特征


樣本稀釋曲線

曲線圖,物種,樣本,碩士學(xué)位


物種累積箱型圖

分析圖,分析圖,大校,相異系數(shù)


碩士學(xué)位論文14兩個(gè)指標(biāo),以衡量?jī)蓚(gè)樣本間的相異系數(shù),在物種多樣性方面,其數(shù)值大小反映了這兩個(gè)樣本間存在的差異大校并基于Unifrac進(jìn)行主坐標(biāo)分析(PCoA,PrincipalCo-ordinatesAnalysis),見(jiàn)圖6、圖7。圖6基于WeightedUnifrac距離的PCoA分析圖圖7基于UnweightedUnifrac距離的PCoA分析圖

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]肉芽腫性小葉性乳腺炎300例臨床病理學(xué)分析[J]. 陳玲,張曉云,王延文,趙秋楓,丁華野.  中華病理學(xué)雜志. 2019 (03)
[2]乳腺炎性病變臨床診治[J]. 徐紅,王雋婕.  武警醫(yī)學(xué). 2019(01)
[3]非哺乳期乳腺炎病因?qū)W研究進(jìn)展[J]. 屠道遠(yuǎn),甄林林,李振,趙瑞鵬,劉敏敏,厲芝.  中華乳腺病雜志(電子版). 2018(01)
[4]16S rDNA基因序列分析在非哺乳期乳腺炎病原菌檢測(cè)中的應(yīng)用價(jià)值[J]. 周飛,劉璐,劉麗媛,王斐,于理想,相玉娟,馬忠兵,余之剛.  山東大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(01)
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[6]Aetiology of idiopathic granulomatous mastitis[J]. Fatih Altintoprak,Taner Kivilcim,Orhan Veli Ozkan.  World Journal of Clinical Cases. 2014(12)
[7]非哺乳期乳腺炎的免疫學(xué)研究進(jìn)展[J]. 張超杰,孔成.  大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(04)
[8]非哺乳期乳腺炎的現(xiàn)代研究進(jìn)展[J]. 肖薔,張超杰.  醫(yī)學(xué)與哲學(xué)(B). 2013(03)
[9]動(dòng)態(tài)磁共振成像在肉芽腫性乳腺炎手術(shù)評(píng)估中的應(yīng)用價(jià)值[J]. 張超杰,范培芝,劉鵬,張志功.  中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2012(21)
[10]非哺乳期乳腺炎27例原因分析與治療體會(huì)[J]. 谷云芝,宋德余.  中國(guó)誤診學(xué)雜志. 2010(28)

碩士論文
[1]初步分析肉芽腫小葉性乳腺炎影響因素及分類(lèi)治療效果[D]. 朱耀華.湖南師范大學(xué) 2018
[2]華南地區(qū)肉芽腫性小葉性乳腺炎的細(xì)菌學(xué)研究[D]. 王業(yè)勝.廣東藥科大學(xué) 2017
[3]CD68、CD163、CD57、IgG4在肉芽腫性乳腺炎中的表達(dá)及其臨床意義[D]. 孔成.湖南師范大學(xué) 2016



本文編號(hào):3277306

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