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基于連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡的尿酸相關(guān)因素應用研究

發(fā)布時間:2020-11-01 06:19
   目的:研究基于偏相關(guān)的連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習算法,并與離散結(jié)構(gòu)學習算法MMHC進行比較。針對連續(xù)變量的離散化可能導致信息丟失的問題,采用仿真數(shù)據(jù)來檢驗IPCB連續(xù)結(jié)構(gòu)學習算法充分利用數(shù)據(jù)信息準確構(gòu)建網(wǎng)絡框架的能力;利用山西省2015年慢病調(diào)查數(shù)據(jù),分別采用MMHC算法和IPCB算法建立尿酸及其相關(guān)因素的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),從實例上再次驗證IPCB算法可以充分利用連續(xù)變量數(shù)據(jù)提供的信息建立更完整的疾病相關(guān)因素的網(wǎng)絡關(guān)系,可為慢性病影響因素網(wǎng)絡分析提供新的思路。方法:在GeNIe2.4中選取測試網(wǎng)絡,生成不同樣本量的連續(xù)數(shù)據(jù)集和離散數(shù)據(jù)集,分別利用IPCB算法和MMHC算法進行貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習,與原始網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)比較,以錯誤邊數(shù)作為比較算法性能的指標。利用山西省2015年慢性病與營養(yǎng)監(jiān)測數(shù)據(jù),選取可能與尿酸相關(guān)的連續(xù)變量構(gòu)成的數(shù)據(jù)集進行分析,根據(jù)研究內(nèi)容分為代謝指標數(shù)據(jù)集和膳調(diào)戶指標數(shù)據(jù)集。首先對兩個數(shù)據(jù)集進行簡單的統(tǒng)計描述,然后在兩個數(shù)據(jù)集中采用IPCB算法建立尿酸相關(guān)因素的連續(xù)變量貝葉斯網(wǎng)絡,同時將變量離散化后采用MMHC算法建立相應的離散貝葉斯網(wǎng)絡,并與連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡做比較,比較兩種算法建立的尿酸相關(guān)因素貝葉斯網(wǎng)絡的合理性。結(jié)果:(1)通過ASIA和TANK兩個仿真網(wǎng)絡測試研究發(fā)現(xiàn),基于變量離散化的MMHC算法學習貝葉斯網(wǎng)絡可以獲得一部分正確的邊,但不論樣本量大小,丟失邊的情況都比較突出。而IPCB連續(xù)結(jié)構(gòu)學習算法在測試中發(fā)現(xiàn),不論樣本量大小,IPCB算法均能獲得正確完整的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)。(2)從2015年山西省慢性病與營養(yǎng)監(jiān)測數(shù)據(jù)庫中提取與尿酸相關(guān)的連續(xù)變量指標,根據(jù)研究內(nèi)容將數(shù)據(jù)庫分為代謝指標數(shù)據(jù)集和膳調(diào)戶數(shù)據(jù)集兩個數(shù)據(jù)集分析。代謝指標數(shù)據(jù)集選取尿酸、甘油三酯、總膽固醇、低密度脂蛋白膽固醇、高密度脂蛋白膽固醇、空腹血糖、糖化血紅蛋白和年齡共8個連續(xù)變量指標;膳調(diào)戶數(shù)據(jù)集選取與尿酸相關(guān)的身體測量和飲食指標:舒張壓、收縮壓、BMI、腰圍、肉類攝入量、水產(chǎn)品攝入量、食鹽攝入量、食用油攝入量、酒精攝入量、蔬果攝入量,共11個連續(xù)變量指標。兩個數(shù)據(jù)集所選取的指標均不服從正態(tài)分布。(3)IPCB算法在兩個數(shù)據(jù)集上建立的連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡均較MMHC算法所建立的離散貝葉斯網(wǎng)絡完整,能發(fā)現(xiàn)更多與尿酸相關(guān)的指標。代謝指標數(shù)據(jù)集中,MMHC算法建立的離散貝葉斯網(wǎng)絡發(fā)現(xiàn)9條邊,其中僅發(fā)現(xiàn)甘油三酯與尿酸的直接關(guān)系;IPCB算法建立的連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡發(fā)現(xiàn)13條邊,其中發(fā)現(xiàn)年齡、甘油三酯、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白4個指標與尿酸的關(guān)系。膳調(diào)戶數(shù)據(jù)集中,離散貝葉斯網(wǎng)絡共學習到9條邊,其中僅發(fā)現(xiàn)BMI一個指標與尿酸直接相關(guān),未發(fā)現(xiàn)飲食習慣指標與尿酸的關(guān)系;連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡學習到14條邊,發(fā)現(xiàn)了尿酸與BMI及肉類、食用油、食用鹽和蔬果攝入量的直接關(guān)聯(lián)。結(jié)論(1)模擬試驗表明,IPCB算法能充分用數(shù)據(jù)提供的信息,構(gòu)建連續(xù)貝葉斯網(wǎng)絡框架的性能優(yōu)于MMHC算法。(2)IPCB算法建立的尿酸相關(guān)因素貝葉斯網(wǎng)絡發(fā)現(xiàn),與尿酸直接相關(guān)的指標為年齡、甘油三酯、低密度脂蛋白膽固醇、高密度脂蛋白膽固醇、BMI、肉類食用量、蔬果攝入量、食用鹽和食用油的攝入。相比于MMHC離散貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習算法,IPCB算法學習到的網(wǎng)絡關(guān)系更完整。(3)IPCB算法能有效地處理連續(xù)變量,在尿酸相關(guān)因素的研究中獲得較滿意的結(jié)果,可為慢性病相關(guān)因素的研究提供新的思路。
【學位單位】:山西醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2020
【中圖分類】:R195;TP311.13
【部分圖文】:

概率分布,變量,情況,條件獨立


山西醫(yī)科大學碩士學位論文71.1.4條件獨立設隨機變量X,Y和Z,x,y和z分別是三個隨機變量的任意取值,如果滿足下列條件:(|=,=)=(|=)且(=,=)>0(1-3)則在給定Z時,稱X和Y相互條件獨立,用(,|)表示。即在已知Z的條件下,Y的取值不會影響X的概率分布。1.1.5d-分隔在貝葉斯網(wǎng)絡中,d-分隔也叫有向分隔,對應于概率的條件獨立。貝葉斯網(wǎng)絡存在三種特殊的節(jié)點連接:順連(頭對尾)、分連(尾對尾)和匯連(頭對頭、碰撞V結(jié)構(gòu))。圖1-1。圖1-1變量X和Y通過Z間接相連的情況設Z為某節(jié)點集合,X和Y是不在Z中的兩個節(jié)點,考慮X和Y之間的一條通路a,如果滿足下面條件之一,則稱a被Z所阻塞:(1)通路a上有一個順連節(jié)點在Z中;(2)通路a上有一個分連節(jié)點在Z中;(3)通路a上有一個匯連節(jié)點W,它和它的后代節(jié)點均不在Z中.上述3種情況如圖1-2所示.

算法,數(shù)據(jù)集中,樣本,樣本量


山西醫(yī)科大學碩士學位論文162.2測試結(jié)果與分析(1)ASIA網(wǎng)絡測試:ASIA原始網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)如圖2-1。圖2-1Asia原始網(wǎng)絡執(zhí)行算法后發(fā)現(xiàn),IPCB算法在Asia網(wǎng)絡的不同樣本數(shù)據(jù)集中均能獲取與原網(wǎng)絡一致的網(wǎng)絡。而MMHC算法獲取的網(wǎng)絡存在不同程度的錯誤數(shù),不能獲得與原網(wǎng)絡一致的網(wǎng)絡;圖2為樣本量為500時MMHC算法得到的網(wǎng)絡,獲得的4條邊均正確,但缺失了4條邊,結(jié)構(gòu)錯誤數(shù)為4;圖3,樣本量為1000/2000/10000時得到的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)一致,得到的5條邊均正確,缺失3條邊,結(jié)構(gòu)錯誤數(shù)為3;樣本量為5000時,獲得的6條邊均正確,缺失2條邊,結(jié)構(gòu)錯誤數(shù)為2。結(jié)果見表1,可見在節(jié)點數(shù)較少,網(wǎng)絡較為稀疏時,MMHC可以學習到正確的邊,無錯誤定向的邊,但缺失邊情況比較明顯。見圖2-2、2-3、2-4和表2-1。圖2-2Asia-500-MMHC

算法,樣本量


Asia-5000-MMHC表2.1Asia網(wǎng)絡不同樣本量IPCB與MMHC算法的結(jié)構(gòu)錯誤
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本文編號:2865143

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