DHAV-1感染誘導內質網(wǎng)應激反應的信號通路研究
發(fā)布時間:2021-11-27 22:44
1型鴨甲肝病毒(Duck hepatitis A virus type 1,DHAV-1)屬于小RNA病毒科,禽肝病毒屬,主要引起13周齡雛鴨發(fā)生鴨病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH),致死率高達90%。DHAV-1感染雛鴨后引起多個臟器的細胞發(fā)生凋亡,特別是肝臟細胞的大量急性凋亡與特征性肝臟出血性壞死,給養(yǎng)鴨業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟損失。內質網(wǎng)(endoplasmic reticulum,ER)是真核細胞的蛋白工廠,主要負責蛋白的正確折疊與加工,也是病毒復制的主要場所之一。在病毒復制過程中,會產(chǎn)生大量的病毒蛋白,當它們不能被正確的折疊修飾和及時輸出時,可啟動內質網(wǎng)應激反應(ER stress response,ERSR),進而誘導未折疊蛋白反應(unfolded protein response,UPR),恢復其穩(wěn)態(tài)。自噬發(fā)揮類似ERS的補充機制,可降解細胞中的蛋白質和廢物等,維持穩(wěn)態(tài)的細胞過程。ERS在許多病毒感染中發(fā)揮作用,不僅與病毒增殖和細胞凋亡有關,而且還可以調控細胞自噬水平。本研究主要針對DHAV-1感染后誘導的ERS及其介導的自噬、...
【文章來源】:山東農業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:168 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
ER的3條應激通路(Shenetal.,2004)
山東農業(yè)大學博士學位論文17圖1-2UPR分支圖及其與自噬的關系(Jhengetal.,2014)。Figure1-2UPRbranchmapanditsrelationshipwithautophagy注:紅色虛線箭頭表示由病毒感染引起的激活途徑的最終結果,例如細胞凋亡和自噬;而紅色實心箭頭表示UPR路徑Note:Reddashedarrowsindicatetheendresultsofactivationpathwayscausedbyviralinfections,suchasapoptosisandautophagy,whereasredsolidarrowindicatesUPRpathways研究表明通過基孔肯雅病毒(Chikungunyavirus,CHIKV)感染誘導的完全自噬誘導是由內質網(wǎng)和氧化應激途徑的獨立誘導介導的;敲低IRE1或使用ROS抑制劑N乙酰基-1-半胱氨酸抑制處理細胞也抑制自噬體的形成以及LC3-I向LC3-II的轉化,證明經(jīng)IRE1mRNA沉默和用N-乙酰基-1-半胱氨酸處理的細胞會抑制自噬體的形成(Joubertetal.,2012)。研究證實許多與UPR相關的轉錄因子調控Atg表達,ATF4的靶蛋白有LC3、Sequestosome1(p62/SQSTM)和ULK1(B"Chiretal.,2013;Milanietal.,2009;Pikeetal.,2013;Rouschopetal.,2010);CHOP的靶蛋白有ATF5、LC3和p62/SQSTM1(B"Chiretal.,2013;Rouschopetal.,2010;Wangetal.,2014a);ATF6的靶蛋白有死亡相關蛋白激酶1(DeathassociatedproteinKinase1,DAPK1)(Gadeetal.,2012);C/EBPβ的靶蛋白有DAPK1、ATG4B和ULK1(Gadeetal.,2008;Guoetal.,2013;Maetal.,2011);膽固醇調節(jié)元件結合蛋白(Sterolregulatoryelement-bindingproteins,SREBP2)對應的靶蛋白
DHAV-1感染誘導內質網(wǎng)應激反應的信號通路研究30分離。(6)數(shù)據(jù)庫搜索:運用Maxquant(v1.5.2.8)對二級質譜數(shù)據(jù)進行檢索。(7)生物信息學分析:GO分析、蛋白結構域、KEGG通路分析、亞細胞定位等。圖2-1蛋白質組測序流程Figure2-1Procedureofproteomicssequencing2.3.1樣品制備2.3.1.1細胞樣品的準備隨機制備并培養(yǎng)3批次DEF細胞,用10%完全培養(yǎng)基懸浮細胞并接種6cm細胞培養(yǎng)皿中,于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細胞單層鋪滿達70%~90%左右,用PBS輕輕漂洗2次,加入病毒液(以感染復數(shù)(multiplicityofinfection,MOI)為2.0TCID50/細胞接種),37℃吸附2h,吸附結束后用PBS漂洗2次,換入2%的細胞維持液,繼續(xù)培養(yǎng)。同時,設不接種病毒的細胞組為陰性對照,其他處理同病毒感染組。感染48h時,分別收集DHAV-1感染組(簡稱為D)和未感染的DEF細胞(簡稱為N)。每組設立3個生物學重復。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Coxsackievirus B3 Infection Triggers Autophagy through 3 Pathways of Endoplasmic Reticulum Stress[J]. LUO Xiao Nuan,YAO Hai Lan,SONG Juan,SONG Qin Qin,SHI Bing Tian,XIA Dong,HAN Jun. Biomedical and Environmental Sciences. 2018(12)
[2]鴨甲型肝炎病毒1型抗體CLEIA檢測方法的建立[J]. 銀鳳桂,侯力丹,魏艷秋,楊寶芝,李蕓,李晶,張爽,劉文軍,楊利敏. 中國預防獸醫(yī)學報. 2017(06)
[3]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[4]鴨肝炎病毒誘導雛鴨細胞凋亡的研究[J]. 陳志勝,王丙云,潘忠雄,蔡巧奕,顧萬軍. 中國獸醫(yī)學報. 2003(02)
[5]試驗感染鴨病毒性肝炎雛鴨的組織病理學研究[J]. 胡薛英,程國富,周詩其,熊道煥. 華中農業(yè)大學學報. 2000(01)
[6]鴨病毒性肝炎病毒細胞培養(yǎng)技術的研究[J]. 羅函祿,范文明,張菊英,劉建平. 江蘇農業(yè)科學. 1996(06)
[7]鴨病毒性肝炎的研究——Ⅰ.鴨病毒性肝炎病毒的純化及電鏡觀察[J]. 羅函祿,徐漢祥,范文明,潘乃珍. 中國畜禽傳染病. 1990(03)
博士論文
[1]新型鴨肝炎病毒致病特性及感染鴨肝胰細胞凋亡的研究[D]. 胡薛英.中國農業(yè)大學 2005
本文編號:3523187
【文章來源】:山東農業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:168 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
ER的3條應激通路(Shenetal.,2004)
山東農業(yè)大學博士學位論文17圖1-2UPR分支圖及其與自噬的關系(Jhengetal.,2014)。Figure1-2UPRbranchmapanditsrelationshipwithautophagy注:紅色虛線箭頭表示由病毒感染引起的激活途徑的最終結果,例如細胞凋亡和自噬;而紅色實心箭頭表示UPR路徑Note:Reddashedarrowsindicatetheendresultsofactivationpathwayscausedbyviralinfections,suchasapoptosisandautophagy,whereasredsolidarrowindicatesUPRpathways研究表明通過基孔肯雅病毒(Chikungunyavirus,CHIKV)感染誘導的完全自噬誘導是由內質網(wǎng)和氧化應激途徑的獨立誘導介導的;敲低IRE1或使用ROS抑制劑N乙酰基-1-半胱氨酸抑制處理細胞也抑制自噬體的形成以及LC3-I向LC3-II的轉化,證明經(jīng)IRE1mRNA沉默和用N-乙酰基-1-半胱氨酸處理的細胞會抑制自噬體的形成(Joubertetal.,2012)。研究證實許多與UPR相關的轉錄因子調控Atg表達,ATF4的靶蛋白有LC3、Sequestosome1(p62/SQSTM)和ULK1(B"Chiretal.,2013;Milanietal.,2009;Pikeetal.,2013;Rouschopetal.,2010);CHOP的靶蛋白有ATF5、LC3和p62/SQSTM1(B"Chiretal.,2013;Rouschopetal.,2010;Wangetal.,2014a);ATF6的靶蛋白有死亡相關蛋白激酶1(DeathassociatedproteinKinase1,DAPK1)(Gadeetal.,2012);C/EBPβ的靶蛋白有DAPK1、ATG4B和ULK1(Gadeetal.,2008;Guoetal.,2013;Maetal.,2011);膽固醇調節(jié)元件結合蛋白(Sterolregulatoryelement-bindingproteins,SREBP2)對應的靶蛋白
DHAV-1感染誘導內質網(wǎng)應激反應的信號通路研究30分離。(6)數(shù)據(jù)庫搜索:運用Maxquant(v1.5.2.8)對二級質譜數(shù)據(jù)進行檢索。(7)生物信息學分析:GO分析、蛋白結構域、KEGG通路分析、亞細胞定位等。圖2-1蛋白質組測序流程Figure2-1Procedureofproteomicssequencing2.3.1樣品制備2.3.1.1細胞樣品的準備隨機制備并培養(yǎng)3批次DEF細胞,用10%完全培養(yǎng)基懸浮細胞并接種6cm細胞培養(yǎng)皿中,于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細胞單層鋪滿達70%~90%左右,用PBS輕輕漂洗2次,加入病毒液(以感染復數(shù)(multiplicityofinfection,MOI)為2.0TCID50/細胞接種),37℃吸附2h,吸附結束后用PBS漂洗2次,換入2%的細胞維持液,繼續(xù)培養(yǎng)。同時,設不接種病毒的細胞組為陰性對照,其他處理同病毒感染組。感染48h時,分別收集DHAV-1感染組(簡稱為D)和未感染的DEF細胞(簡稱為N)。每組設立3個生物學重復。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Coxsackievirus B3 Infection Triggers Autophagy through 3 Pathways of Endoplasmic Reticulum Stress[J]. LUO Xiao Nuan,YAO Hai Lan,SONG Juan,SONG Qin Qin,SHI Bing Tian,XIA Dong,HAN Jun. Biomedical and Environmental Sciences. 2018(12)
[2]鴨甲型肝炎病毒1型抗體CLEIA檢測方法的建立[J]. 銀鳳桂,侯力丹,魏艷秋,楊寶芝,李蕓,李晶,張爽,劉文軍,楊利敏. 中國預防獸醫(yī)學報. 2017(06)
[3]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[4]鴨肝炎病毒誘導雛鴨細胞凋亡的研究[J]. 陳志勝,王丙云,潘忠雄,蔡巧奕,顧萬軍. 中國獸醫(yī)學報. 2003(02)
[5]試驗感染鴨病毒性肝炎雛鴨的組織病理學研究[J]. 胡薛英,程國富,周詩其,熊道煥. 華中農業(yè)大學學報. 2000(01)
[6]鴨病毒性肝炎病毒細胞培養(yǎng)技術的研究[J]. 羅函祿,范文明,張菊英,劉建平. 江蘇農業(yè)科學. 1996(06)
[7]鴨病毒性肝炎的研究——Ⅰ.鴨病毒性肝炎病毒的純化及電鏡觀察[J]. 羅函祿,徐漢祥,范文明,潘乃珍. 中國畜禽傳染病. 1990(03)
博士論文
[1]新型鴨肝炎病毒致病特性及感染鴨肝胰細胞凋亡的研究[D]. 胡薛英.中國農業(yè)大學 2005
本文編號:3523187
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