海洋是地球上最大的生態(tài)系統(tǒng),海洋微生物在海洋生態(tài)系統(tǒng)和地球生物化學(xué)循環(huán)中起著極其重要的作用。幾丁質(zhì)是海洋中含量最豐富的有機(jī)碳,海洋微生物對(duì)幾丁質(zhì)的降解代謝,是海洋物質(zhì)循環(huán)的重要推動(dòng)力。海洋中能夠降解幾丁質(zhì)的微生物有很多,但絕大多數(shù)海洋微生物降解幾丁質(zhì)的機(jī)制仍不清楚。假交替單胞菌屬是海洋特有細(xì)菌,其廣泛分布于全球海洋中,并具有相對(duì)較高的豐度。最近,基于生物信息學(xué)分析,有研究表明較高比例的假交替單胞菌中含有幾丁質(zhì)降解基因簇（CDC）,預(yù)示著假交替單胞菌屬可能是海洋中重要的幾丁質(zhì)降解細(xì)菌類群。但是,到目前為止,關(guān)于假交替單胞菌的幾丁質(zhì)降解能力的研究還較少,缺少在屬水平開展假交替單胞菌降解幾丁質(zhì)的系統(tǒng)研究,假交替單胞菌在海洋幾丁質(zhì)降解中的貢獻(xiàn)還不清楚。假交替單胞菌降解幾丁質(zhì)的機(jī)制也不清楚。幾丁質(zhì)酶等糖苷水解酶在海洋幾丁質(zhì)的微生物降解中發(fā)揮重要作用,其能將幾丁質(zhì)水解成幾丁寡糖或單糖。GH18家族幾丁質(zhì)酶因其分布廣泛及對(duì)結(jié)晶幾丁質(zhì)的高效降解,一直以來是該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。GH18家族中,相比于對(duì)外切幾丁質(zhì)酶的廣泛研究,對(duì)內(nèi)切幾丁質(zhì)酶的研究還較少,GH18家族內(nèi)切幾丁質(zhì)酶的催化機(jī)制到目前為止還不清楚。... 

【文章來源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

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圖１－４假交替單胞菌屬產(chǎn)色素菌株和不產(chǎn)色素菌株的糖苷水解酶多維酶譜??分析（Ｐａｕｌｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ．?２０１９）??

?山東大學(xué)博士學(xué)位論文???（ｃｈｉｃ）??著魯暑魯暑暑魯暑暑魯暑暑暑署暑暑魯暑眷暑ＭＭ４ＩＭ??圖１－６粘質(zhì)沙雷氏菌中的幾丁質(zhì)降解酶（ＩｔｏｈａｎｄＫｉｍｏｔｏ２０１９）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－６?Ｃｈｉｔｉｎｏｌｙｔｉｃ?ｅｎｚｙｍｅｓ?ｏｆ?Ｓｅｒｒａｔｉａ?ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ．?Ｔｈｅ?ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ｄｏｍａｉｎｓ??ｏｆ?５．?ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅｓ?（ＣｈｉＡ，?ＣｈｉＢ，?ａｎｄ?ＣｈｉＣ）?ｂｅｌｏｎｇ?ｔｏ?ＧＨ１８．?ＣｈｉＡａｎｄ?ＣｈｉＢ??ａｒｅ?ｐｒｏｃｅｓｓｉｖｅ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅｓ?ｔｈａｔ?ｂｉｎｄ?ｃｌｏｓｅｌｙ?ｔｏ?ｔｈｅ?ｅｎｄｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｄｅｔａｃｈｅｄ?ｃｈｉｔｉｎ?ｃｈａｉｎ?ａｎｄ??ｒｅｌｅａｓｅ?（ＧｌｃＮＡｃ）２．?ＣｈｉＣ?ｗｏｒｋｓ?ａｓ?ａｎ?ｅｎｄｏ－ａｃｔｉｎｇ?ｎｏｎ－ｐｒｏｃｅｓｓｉｖｅ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅ．?ＣＢＰ２１?ｉｓ??ａｎ?ＡＡ１０?ＬＰＭＯ?ａｎｄ?ｂｒｅａｋｓ?ｃｈｉｔｉｎ?ｃｈａｉｎ?ｂｙ?ｏｘｉｄａｔｉｖｅ?ｃｌｅａｖａｇｅｓ?（Ｉｔｏｈ?ａｎｄ?Ｋｉｍｏｔｏ??２０１９）．??細(xì)菌（Ｓｕｇｉｎｔａ?ｅｔ?ａｌ．?２０１６）、真菌（Ｔａｋａｙａ?ｅｔ?ａｌ．?１９９８）和植物（Ｃａｖａｄａ?ｅｔ?ａｌ．?２００６）中廣??泛分布。幾丁質(zhì)酶對(duì)自然界中兒丁質(zhì)的降解和循環(huán)起著至關(guān)重要的作用。在碳水??化合物活性酶數(shù)據(jù)庫（ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ－ａｃｔｉｖｅ?ｅｎｚｙｍｅｓ，?ＣＡＺｙＸ?ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃａｚｙ．ｏｒｇ／）??中，細(xì)菌幾丁質(zhì)酶主要分布于糖苷水解酶第３、５、１８、１９、２０、２３、４８

都含有ＧＨ１８家族經(jīng)典的�。幔�?ＴＩＭ－桶折疊結(jié)構(gòu)的催化結(jié)構(gòu)域ｃａｔａｌｙｔｉｃ??ｄｏｍａｉｎｓ，?ＣａＤ），即含有８?jìng)�(gè)ｐ－ｓｈｅｅｔｓ和８?jìng)�(gè)ａ－ｈｅｌｉｃｓ折疊回旋組成桶狀結(jié)構(gòu)??（Ｐｅｒｒａｋｉｓｅｔａｌ．?１９９４；Ｍａｔｓｕｍｏｔｏｅｔａｌ．?１９９９）。目前，已報(bào)道的細(xì)菌來源的幾丁質(zhì)酶??大多屬于ＧＨ１８家族Ａ亞家族，而對(duì)Ｂ和Ｃ亞家族的研宄較少。??１ＣＴＮ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ａ）?４Ｉ１ＭＣ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｂ）?２ＤＳＫ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｃ）??圖１－７ＧＨ１８家族Ａ、Ｂ和Ｃ亞家族幾丁質(zhì)酶的結(jié)構(gòu)??Ｆｉｇｕｒｅ?１－７?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ?ｏｆ?ＧＨ１８?ｓｕｂｆａｍｉｌｉｅｓ?Ａ，?Ｂ?ａｎｄ?Ｃ．?（Ａ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ??ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ａ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?ＣｈｉＡ?（ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?ＩＣＴＮ）?（Ｈｏｒｎ?ｅｔ?ａｌ．?２００６）?ｆｒｏｍ??Ｓｅｒｒａｔｉａ?ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ．?（Ｂ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｂ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?Ａ／ｍＣｈｉ６０??（ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?４ＨＭＣ）?（Ｍａｌｅｃｋｉ?ｅｔ?ａｌ．?２０１３）?ｆｒｏｍ?Ｍｏｒｉｔｅｌｌａ?ｍａｒｉｎａ．?（Ｃ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ??ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ｄｏｍａｉｎ?（ＡＤ２ｐＦ＿ｃｈｉＡ，ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?２ＤＳＫ）?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｃ??ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?ＰＦ－ＣｈｉＡ?（Ｎａｋａｍｕｒａ?ｅｔ?ａｌ．?２００７）?ｆｒｏｍ?Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ?ｆｕｒｉｏｓｕ

【參考文獻(xiàn)】：
博士論文
[1]海洋細(xì)菌屬假交替單胞菌屬全基因組測(cè)序及比較基因組學(xué)研究[D]. 榮金誠.山東大學(xué) 2016
[2]海洋細(xì)菌DL-6幾丁質(zhì)酶和幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白的生化性質(zhì)與功能研究[D]. 王曉輝.大連理工大學(xué) 2016

碩士論文
[1]基于基因組學(xué)的假交替單胞菌屬不同種的多糖降解和代謝途徑的比較研究[D]. 劉敏.山東大學(xué) 2017



本文編號(hào)：3443783