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7種雞形目鳥(niǎo)類線粒體基因組的比較及譜系基因組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2016-12-20 09:09

  本文關(guān)鍵詞:7種雞形目鳥(niǎo)類線粒體基因組的比較及譜系基因組學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


7種雞形目鳥(niǎo)類線粒體基因組的比較及譜系基因組學(xué)研究

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內(nèi)容提示:雞形目是鳥(niǎo)類中一個(gè)重要類群,與人類生活關(guān)系密切。雖然已有很多學(xué)者采用不同類型數(shù)據(jù)對(duì)雞形目的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了研究,但是由于該類群部分分支經(jīng)歷了快速的適應(yīng)輻射,雞形目?jī)?nèi)部的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系仍存在爭(zhēng)議。近年來(lái),,線粒體基因組序列被廣泛運(yùn)用到雞形目多個(gè)層面的研究中,并被認(rèn)為是重建雞形目系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和進(jìn)化歷史的一個(gè)有效工具。本研究測(cè)定了7種雞形目物種(海南山鷓鴣、中華鷓鴣、斑尾榛雞、褐馬雞、白馬雞、灰山鶉和暗腹雪雞)的線粒體基因組序列,聯(lián)合數(shù)據(jù)庫(kù)已有的其他雞形目鳥(niǎo)類線粒體基因組序列,采用比較基因組學(xué)、譜系基因組學(xué)方法對(duì)雞形目各類群進(jìn)行了分析。得到的主要結(jié)論如下: 1. 7種雞形目鳥(niǎo)類線粒體基因組長(zhǎng)度介于16658-16730bp之間,編碼37個(gè)基因(13個(gè)蛋白編碼基因,2個(gè)rRNA基因和22個(gè)tRNA基因),外加1個(gè)控制區(qū)。線粒體基因組組成和基因排序與其他已發(fā)表的雞形目鳥(niǎo)類一致。 2. 雞形目山鷓鴣屬、榛雞屬、馬雞屬、山鶉屬和雪雞屬的屬內(nèi)比較研究發(fā)現(xiàn),同一屬內(nèi)物種的線粒體基因組堿基組成、偏向性、密碼子使用頻率、RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)、控制區(qū)結(jié)構(gòu)等方面類似。除馬雞屬部分基因外,其他屬蛋白編碼基因的Ka/Ks值均小于1,顯示出受到了純化選擇作用。 3. 雞形目鳥(niǎo)類的線粒體基因組長(zhǎng)度介于16658-16841bp之間,平均長(zhǎng)度為16705b

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本文編號(hào):220721

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