隨著全基因組測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,目前己獲得了大量的序列信息�；蚪M序列的絕大部分是非編碼序列,極少部分是編碼序列,而這些非編碼序列的生物學(xué)信息和功能已經(jīng)受到越來(lái)越多研究者們的關(guān)注。不少研究結(jié)果顯示這些非編碼序列可能在生命活動(dòng)中起著非常重要的作用。內(nèi)含子作為斷裂基因的非編碼序列,它的生物學(xué)意義和功能已成為生物學(xué)熱點(diǎn)課題。相關(guān)研究表明,環(huán)狀RNA在基因的表達(dá)及一些疾病的起源中起著非常重要的作用,而部分環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)的形成與內(nèi)含子之間的成環(huán)匹配息息相關(guān)。我們選取了家鼠基因組中核糖體蛋白基因序列作為研究對(duì)象,采用Smith-Waterman局域比對(duì)法研究了內(nèi)含子序列之間的成環(huán)匹配特征,具體研究?jī)?nèi)容如下:1.選取家鼠基因組中核糖體蛋白基因序列作為研究對(duì)象,提取了所有核蛋白基因序列,對(duì)于每一條基因序列,按照內(nèi)含子序列位置的不同,分別整理出第一內(nèi)含子、第二內(nèi)含子……等不同位置內(nèi)含子組。以此為基礎(chǔ),統(tǒng)計(jì)了每一組內(nèi)含子序列的長(zhǎng)度、GC含量分布等特征,結(jié)果表明,家鼠核糖體蛋白基因中,多數(shù)內(nèi)含子序列長(zhǎng)度集中在98bp和1200bp左右,多數(shù)內(nèi)含子的GC含量處于43%

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

本文編號(hào)：3880078