帶跳躍行為的自驅(qū)動粒子系統(tǒng)的理論與仿真研究
發(fā)布時間:2021-11-25 21:43
自驅(qū)動粒子系統(tǒng)是研究非平衡態(tài)系統(tǒng)的一類簡單而又富有代表性的模型。這類模型的常用形式就是非對稱排它過程。為了研究人們的日常生活中的交通現(xiàn)象和生物體內(nèi)的物質(zhì)運輸?shù)囊恍┬袨?我們通常將研究對象抽象為粒子,設定不同模擬環(huán)境和粒子運動規(guī)則,建立相應模型來進行模擬研究。為了研究分子馬達實驗中觀測到的粒子運動現(xiàn)象,本文首先提出了一種單向自驅(qū)動粒子跳躍模型,在一維格鏈上,粒子能夠以前進和跳躍兩種方式向前運動,通過計算機模擬得到對應參數(shù)下的系統(tǒng)流率,并通過方程對模型解析,對結(jié)果加以論證,確定模型的準確性。接下來,將單向自驅(qū)動粒子跳躍模型中的粒子前進方式改為可以向左運動和向右運動,并加入粒子交換規(guī)則,用以模擬生物體內(nèi)的分子跨膜運輸時過程,模擬分析得到了交換和跳躍兩個參數(shù)對模型中系統(tǒng)流率的影響效果,得出以下結(jié)論:(1)兩種粒子的比例越接近,系統(tǒng)流率越大。(2)在密度位于中段區(qū)域時(0.3<<0.8),粒子跳躍概率越高,系統(tǒng)流率就越大。(3)對向粒子交換概率越大,系統(tǒng)流率越大,流率-密度曲線由非單調(diào)轉(zhuǎn)變?yōu)閱握{(diào)遞增。(4)該系統(tǒng)沒有回滯現(xiàn)象。最后,將上述兩個模型中邊界條件改為開放性條件,即粒子可以從...
【文章來源】:安慶師范大學安徽省
【文章頁數(shù)】:34 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ASEP模型示意圖
2沒有粒子進出,即系統(tǒng)粒子數(shù)量沒有變化。在開放性邊界條件下,當粒子運動到格鏈端點處時,可以選擇離開系統(tǒng),同時,在端點位置上是空格時,粒子可以從外部進入系統(tǒng)。在系統(tǒng)中的粒子可以選擇向左或者向右運動,當運動方向是單一方向時,我們稱之為完全非對稱簡單排他過程(TotallyAsymmetricSimpleExclusionProcess,TASEP)。圖1-1ASEP模型示意圖(a)周期性邊界條件;(b)開放性邊界條件(摘自[3])1983年,Wolfram提出了著名的“184”號模型[11],這與完全非對稱排他過程相對應。模型中,道路被分解為大小相同的格點,每個格點要么為空(用“0”表示),要么被粒子占據(jù)(用“1”表示)。在每一個時間步,如果粒子前方格點為空,該粒子前進一格,若前方格點被粒子占據(jù),該粒子停止前進。系統(tǒng)中所有粒子的前進方向相同,模型采用周期性邊界,確保粒子數(shù)保持恒定。在此模型中,粒子的運動只由前方和后方格點的狀態(tài)決定,所以可以將粒子所處狀態(tài)分為以下8種:111,110,101,100,011,010,001,000。下一時間步,粒子演化結(jié)果分別為:1,0,1,1,1,0,0,0?梢员硎緸槎M制數(shù)“10111000”,轉(zhuǎn)化為十進制后即“184”!184”模型的規(guī)則簡單,但卻可以模擬得到交通流中的粒子由自由流轉(zhuǎn)變?yōu)槎氯鞯南嘧儸F(xiàn)象,而且模型可以用方程組解析,有助于加深人們的理解和接下來的研究工作。圖1-2Wolfram“184”號模型示意圖
3第三節(jié)ASEP模型的研究現(xiàn)狀ASEP模型的提出到現(xiàn)在已經(jīng)有50多年的歷史,ASEP模型在許多方面的研究中,如蛋白質(zhì)合成研究,交通流理論研究,分子馬達實驗等等都作出了巨大的貢獻。ASEP作為一個可以研究非平衡態(tài)統(tǒng)計模型,其也模擬得到了許多重要物理現(xiàn)象。1.大尺寸粒子ASEP模型在最簡單的ASEP模型中,我們通常設定一個粒子只能占據(jù)一個格點,但在對某些實際現(xiàn)象進行模擬研究時,這樣的設定并不能很好的反映客觀事實,如模擬mRNA上的核糖體運動過程,分子馬達運動,都應該將粒子設置為大尺寸粒子來達到更好的模擬效果。同樣的,在用ASEP模擬城市交通網(wǎng)絡時,道路上有各種大小的車輛,自行車,小汽車,大巴車等等,如果這時仍用一個相同大小的粒子來模擬這些交通工具就不合適了。Lakatos和Shaw等人在這方面作出了研究[12-13],他們設定粒子可以占據(jù)d個格子,每次前進一格,在這樣的設定下分析模擬結(jié)果。圖1-3大尺寸粒子TASEP模型示意圖,摘自[7]2.NS模型(NaSch模型)NS模型[14]于1992年由德國學者Nagel和Schreckenberg首次提出。他們在ASEP模型的基礎上,引入了粒子最大速度的概念?紤]在車輛行駛過程中,司機往往會按照最快的速度駕駛汽車,以及當前方有車輛時的剎車行為。為了模擬這些現(xiàn)象,在NS模型中,粒子可以前進時,粒子能逐漸加速到最大速度,加速過程假設是勻速進行的。當粒子前方被占據(jù)時,考慮兩粒子間距離,粒子可以減速,避免發(fā)生碰撞。在正常行駛的過程中,粒子會以概率p隨機慢化,用以模擬車輛行駛中的一些干擾情況。NS模型模擬得到了實際交通中的堵塞行為和時走時,F(xiàn)象。這啟發(fā)了學者們在以后的研究中,根據(jù)實際情況,加入了其他規(guī)則,得到了其他模型,使得模擬結(jié)果能更好的反映實際情況。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]城市交通擁堵的背景變換分析[J]. 徐東云,張雷,蘭榮娟. 城市問題. 2009(03)
博士論文
[1]交通流元胞自動機模型的解析和模擬研究[D]. 袁耀明.中國科學技術(shù)大學 2009
本文編號:3518849
【文章來源】:安慶師范大學安徽省
【文章頁數(shù)】:34 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ASEP模型示意圖
2沒有粒子進出,即系統(tǒng)粒子數(shù)量沒有變化。在開放性邊界條件下,當粒子運動到格鏈端點處時,可以選擇離開系統(tǒng),同時,在端點位置上是空格時,粒子可以從外部進入系統(tǒng)。在系統(tǒng)中的粒子可以選擇向左或者向右運動,當運動方向是單一方向時,我們稱之為完全非對稱簡單排他過程(TotallyAsymmetricSimpleExclusionProcess,TASEP)。圖1-1ASEP模型示意圖(a)周期性邊界條件;(b)開放性邊界條件(摘自[3])1983年,Wolfram提出了著名的“184”號模型[11],這與完全非對稱排他過程相對應。模型中,道路被分解為大小相同的格點,每個格點要么為空(用“0”表示),要么被粒子占據(jù)(用“1”表示)。在每一個時間步,如果粒子前方格點為空,該粒子前進一格,若前方格點被粒子占據(jù),該粒子停止前進。系統(tǒng)中所有粒子的前進方向相同,模型采用周期性邊界,確保粒子數(shù)保持恒定。在此模型中,粒子的運動只由前方和后方格點的狀態(tài)決定,所以可以將粒子所處狀態(tài)分為以下8種:111,110,101,100,011,010,001,000。下一時間步,粒子演化結(jié)果分別為:1,0,1,1,1,0,0,0?梢员硎緸槎M制數(shù)“10111000”,轉(zhuǎn)化為十進制后即“184”!184”模型的規(guī)則簡單,但卻可以模擬得到交通流中的粒子由自由流轉(zhuǎn)變?yōu)槎氯鞯南嘧儸F(xiàn)象,而且模型可以用方程組解析,有助于加深人們的理解和接下來的研究工作。圖1-2Wolfram“184”號模型示意圖
3第三節(jié)ASEP模型的研究現(xiàn)狀ASEP模型的提出到現(xiàn)在已經(jīng)有50多年的歷史,ASEP模型在許多方面的研究中,如蛋白質(zhì)合成研究,交通流理論研究,分子馬達實驗等等都作出了巨大的貢獻。ASEP作為一個可以研究非平衡態(tài)統(tǒng)計模型,其也模擬得到了許多重要物理現(xiàn)象。1.大尺寸粒子ASEP模型在最簡單的ASEP模型中,我們通常設定一個粒子只能占據(jù)一個格點,但在對某些實際現(xiàn)象進行模擬研究時,這樣的設定并不能很好的反映客觀事實,如模擬mRNA上的核糖體運動過程,分子馬達運動,都應該將粒子設置為大尺寸粒子來達到更好的模擬效果。同樣的,在用ASEP模擬城市交通網(wǎng)絡時,道路上有各種大小的車輛,自行車,小汽車,大巴車等等,如果這時仍用一個相同大小的粒子來模擬這些交通工具就不合適了。Lakatos和Shaw等人在這方面作出了研究[12-13],他們設定粒子可以占據(jù)d個格子,每次前進一格,在這樣的設定下分析模擬結(jié)果。圖1-3大尺寸粒子TASEP模型示意圖,摘自[7]2.NS模型(NaSch模型)NS模型[14]于1992年由德國學者Nagel和Schreckenberg首次提出。他們在ASEP模型的基礎上,引入了粒子最大速度的概念?紤]在車輛行駛過程中,司機往往會按照最快的速度駕駛汽車,以及當前方有車輛時的剎車行為。為了模擬這些現(xiàn)象,在NS模型中,粒子可以前進時,粒子能逐漸加速到最大速度,加速過程假設是勻速進行的。當粒子前方被占據(jù)時,考慮兩粒子間距離,粒子可以減速,避免發(fā)生碰撞。在正常行駛的過程中,粒子會以概率p隨機慢化,用以模擬車輛行駛中的一些干擾情況。NS模型模擬得到了實際交通中的堵塞行為和時走時,F(xiàn)象。這啟發(fā)了學者們在以后的研究中,根據(jù)實際情況,加入了其他規(guī)則,得到了其他模型,使得模擬結(jié)果能更好的反映實際情況。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]城市交通擁堵的背景變換分析[J]. 徐東云,張雷,蘭榮娟. 城市問題. 2009(03)
博士論文
[1]交通流元胞自動機模型的解析和模擬研究[D]. 袁耀明.中國科學技術(shù)大學 2009
本文編號:3518849
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