慢性腎病（Chronic kidney disease,CKD）是一種被定義為腎臟結構、功能或兩者持續(xù)改變的綜合癥,而血清肌酐（serum creatinine,Scr）是臨床上評價腎臟功能的重要指標。近年來,全世界慢性腎病的患病率達到7%-12%。目前,全基因組關聯(lián)研究（Genome-wide association studies,GWAS）已經鑒定出許多與慢性腎病相關的重要遺傳變異。但是,從GWAS鑒定出的遺傳變異中,真正對慢性腎病發(fā)揮作用的功能基因仍然未知。本研究采用基于匯總數據的孟德爾隨機化（Summary data-based Mendelian randomization,SMR）分析方法來鑒定影響慢性腎病的因果基因。該方法使用與基因表達相關性最顯著的SNP作為工具變量,研究基因表達與慢性腎病和血清肌酐之間的因果關系;并使用蛋白-蛋白相互作用網絡探索由鑒定到的基因所產生的蛋白之間的功能相互作用;同時,使用IPA（Ingenuity Pathway Analysis）來分析基因之間的通路關系;使用差異表達分析找出慢性腎病組和健康對照中有表達差異的基因。結果顯示:1、SMR方... 

【文章來源】：湖南師范大學湖南省 211工程院校

【文章頁數】：51 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
1.文獻綜述
    1.1 慢性腎病簡介
    1.2 慢性腎病的全基因組關聯(lián)分析
    1.3 孟德爾隨機化
    1.4 SMR在其他疾病上的應用
2.材料與方法
    2.1 GWAS匯總數據
    2.2 eQTL匯總數據
    2.3 基于匯總數據的孟德爾隨機化分析
    2.4 異質性檢驗
    2.5 蛋白-蛋白相互作用網絡
    2.6 IPA分析
    2.7 差異表達分析
3.結果與分析
    3.1 e GFRcrea的 SMR與異質性檢驗結果
    3.2 CKD的 SMR與異質性檢驗結果
    3.3 蛋白-蛋白相互作用網絡結果
    3.4 IPA分析結果
    3.5 差異表達分析結果
4.討論
5.研究結論與創(chuàng)新性
    5.1 結果
    5.2 本研究的創(chuàng)新性
參考文獻
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]G蛋白信號轉導調節(jié)因子4在腎癌組織中的表達及意義[J]. 安豐,楊繼宏,崔振宇,師曉強,劉明鍇,郭景陽,王洪福.  山東醫(yī)藥. 2017(14)



本文編號：3163123