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基于DNA宏條形碼技術(shù)的浮游植物群落多樣性監(jiān)測研究

發(fā)布時間:2018-02-23 02:38

  本文關(guān)鍵詞: 浮游植物 DNA條形碼 DNA宏條形碼技術(shù) 綜合浮游植物完整性指數(shù) 水生態(tài)健康評價 出處:《南京大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:監(jiān)測水生生物對保護湖泊、河流的水環(huán)境質(zhì)量和生態(tài)功能有重要的意義。浮游植物群落結(jié)構(gòu)的變化不僅反映水質(zhì)的變化,同時產(chǎn)毒藻類的爆發(fā)也會威脅水生態(tài)安全。傳統(tǒng)的浮游植物鑒別耗時耗力,準確性不高,而DNA條形碼物種標識技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)物種的快速鑒別,在水生生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測和健康評估中的應(yīng)用潛力很大。然而適合太湖流域浮游植物監(jiān)測的DNA宏條形碼技術(shù)的開發(fā)尚不完善,本土浮游植物的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的缺失也驗證制約了 DNA宏條形碼技術(shù)的應(yīng)用。同時,如何建立基于分子生物學(xué)的生物指數(shù)方法來評價湖泊水生態(tài)健康狀況,是亟待開展的新興領(lǐng)域。本研究圍繞太湖流域的浮游植物群落,從以下幾個方面展開研究:(1)通過不同基因組區(qū)域的比較,篩選出適合作為太湖流域浮游植物生物多樣性監(jiān)測的引物;(2)選取適合的條形碼,構(gòu)建太湖流域本土浮游植物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫;(3)建立基于DNA多樣性的太湖流域浮游植物生物監(jiān)測宏條形碼技術(shù),并用于太湖浮游植物生物多樣性分析;基于分子生物學(xué)方法,構(gòu)建適合太湖流域水體營養(yǎng)狀態(tài)評價的綜合浮游植物完整性指數(shù),并對太湖水生態(tài)功能分區(qū)的健康狀態(tài)進行分析。主要的研究結(jié)果總結(jié)如下:(1)結(jié)合高通量測序技術(shù)對讀長的要求,從14對引物中篩選出3對適合作為太湖浮游植物監(jiān)測的引物;通過DNA宏條形碼技術(shù)對篩選出的3對引物與傳統(tǒng)顯微鑒別的結(jié)果進行比較,得出以下結(jié)論:ITS更適合在種屬水平上進行監(jiān)測適合構(gòu)建太湖流域浮游植物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫;而V3、V9引物的結(jié)合能夠監(jiān)測到太湖流域常見浮游植物,適合作為DNA宏條形碼技術(shù)對太湖流域浮游植物生物多樣性研究的條形碼區(qū)域。(2)通過太湖浮游植物的分離純化和測序分析,構(gòu)建了太湖流域常見浮游植物ITS DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,包括藻類95種,其中硅藻門11種,綠藻門84種;18SrRNA DNA條形碼區(qū)域12種包括硅藻門1種、金藻門1種,綠藻門10種(其中與ITS條形碼重疊4種);16SrRNADNA條形碼7種,均為藍藻門;三個條形碼區(qū)域結(jié)合共獲得DNA條形碼110種,其中藍藻門7種,硅藻門12種,綠藻門90種,金藻門1種。(3)通過對太湖流樣本點40個評價參數(shù)的分析,最終篩選出4個能夠表征太湖流域營養(yǎng)狀態(tài)的參數(shù),分別為PI-21(mcintosh_d-藍藻),PI-23(margalef-藍藻),PI-31(綠藻門密度(reads%)-真核藻類)和PI-37(小環(huán)藻屬密度(reads%)-真核藻類),并通過比值法進行了篩選后評價參數(shù)的修正,制定了太湖綜合浮游植物完整性指數(shù)PI(∑)。經(jīng)檢驗,綜合浮游植物完整性指數(shù)PI(∑)能夠作為評價太湖水體健康狀態(tài)的新型基于分子生物學(xué)方法的浮游植物指標,并且劃定了太湖水體健康狀態(tài)評價等級。通過對太湖各生態(tài)功能分區(qū)PI(∑)計算分析,其中太湖北部水體健康狀態(tài)較差;太湖南部和太湖東部水體健康狀況一般;而太湖西部和太湖中部水體健康。太湖湖體整體水健康狀態(tài)一般;诜肿由飳W(xué)方法的物種鑒別新技術(shù)為水生態(tài)系統(tǒng)浮游植物生物多樣性監(jiān)測提供了新的機遇;通過DNA條形碼技術(shù)構(gòu)建了太湖本土浮游植物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,是太湖流域甚至我國淡水生生態(tài)系統(tǒng)浮游植物生物多樣性分析的數(shù)據(jù)基礎(chǔ);以及利用分子生物學(xué)方法制定的新型綜合浮游植物完整性指數(shù),該方法快速簡便,準確性高,能夠作為太湖水生態(tài)健康狀態(tài)評價的生物指標。
[Abstract]:This paper studies the biological diversity of phytoplankton in Taihu basin . Based on the analysis of 40 evaluation parameters of Taihu Lake ' s ecological functional zones , four kinds of parameters , namely , PI - 21 ( mcintosh _ d - blue algae ) , PI - 23 ( margalef - blue algae ) , PI - 31 ( green algae gate density ( reads % ) - eukaryotic algae ) and PI - 37 ( Chlorella density ( reads % ) - eukaryotic algae ) were constructed .

【學(xué)位授予單位】:南京大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:Q948.8

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本文編號:1525923

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