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基于分子模擬與微衛(wèi)星的微生物酶解木質素機制及基因組特征研究

發(fā)布時間:2024-03-31 06:17
  微生物與環(huán)境保護及人類健康的關系是當前研究的熱點。自然界中的微生物可劃分為與污染物降解有關的微生物及與污染物降解無關的微生物。與污染物降解有關的微生物可直接應用于污染物的分解。一些與污染物降解無關的微生物例如大腸桿菌(Escherichia coli)可用于環(huán)境監(jiān)測,而另外一些例如人類免疫缺陷病毒1型(Human Immunodeficiency Virus Type1,HIV-1)和丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)威脅人類的健康。研究微生物酶解污染物的機制、微生物基因組或其小RNA的組織規(guī)律或序列差異,可以從根本上提高我們對污染物降解進程、微生物基因組進化和調控的理解,對微生物降解污染物效率的提高、環(huán)境監(jiān)測過程中微生物的鑒定及微生物引發(fā)的疾病的治療、控制都具有非常重要的意義。 木質素是一種極難降解的生物高聚物。它的累積引發(fā)了嚴重的環(huán)境污染問題。微生物可通過分泌木質素降解酶分解木質素廢物。該降解能力與木質素降解酶與木質素之間的相互作用有關。木質素降解酶主要包括漆酶(laccase,Lac)、木質素過氧化物酶(lignin peroxidase, LiP)和錳過...

【文章頁數(shù)】:154 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1本研究技術路線圖

圖1.1本研究技術路線圖

博士學位論文率較高,而CG/GC,CGA/AGC,AAC/CAA和GCT/TCG極少出現(xiàn)文結構與主要內容題背景界中的微生物分為兩類:與污染物降解有關的微生物及與污染物降物。自然界中與污染物降解有關的微生物種類繁多,有的與木質素的與纖維素降解有關,有的與農藥降解有關,有....


圖2.1底物在最優(yōu)的Lac-lignin,LiP-lignin和MnP-lignin復合物中的結合口袋及結合取向

圖2.1底物在最優(yōu)的Lac-lignin,LiP-lignin和MnP-lignin復合物中的結合口袋及結合取向

或Lac-lignin的可比。特別地,無論標準是基于MolDock評分函數(shù)還是Re-Ranking評分函數(shù),復合物LiP-lignin和MnP-lignin的分值比復合物Lac-lignin更低。Lac的對接取向與LiP和MnP的對接取向不同(圖2.1)。在復合物Lac-li....


圖2.2木質素降解酶與底物之間結合模式的3D模型(顏色:綠色,木質素降解酶;藍色,底物)

圖2.2木質素降解酶與底物之間結合模式的3D模型(顏色:綠色,木質素降解酶;藍色,底物)

-28-2.2.2相互作用分析和分子動力學模擬底物與三個木質素降解酶的最佳結合模式如圖2.2所示。不同的木質素降解酶降解木質素的能力存在差異[8]。該差異在一定程度上與木質素降解酶和木質素之間不同的相互作用有關[9]。復合物Lac-lignin,LiP-lignin和MnP....


圖2.3木質素降解酶與底物之間聯(lián)系的數(shù)量Figure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninandMnP-lignincomplexes.Analyzedligand–proteincontactsincludehydrogenbonding(Hb),

圖2.3木質素降解酶與底物之間聯(lián)系的數(shù)量Figure2.3Numberoflignin-enzymecontactsinthebestdockingLac-lignin,LiP-ligninandMnP-lignincomplexes.Analyzedligand–proteincontactsincludehydrogenbonding(Hb),

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本文編號:3943577

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