外切酶循環(huán)放大技術(shù)檢測(cè)腫瘤標(biāo)記物及其在分子邏輯門體系中的應(yīng)用研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-01 11:57
本文基于核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)血小板衍生因子(PDGF)和DNA等腫瘤標(biāo)志物高靈敏、高選擇性檢測(cè)檢測(cè),并建立分子邏輯門體系。主要開(kāi)展了以下兩方面的工作:一、核酸外切酶級(jí)聯(lián)循環(huán)放大技術(shù)檢測(cè)血小板衍生因子本文建立了一種核酸外切酶級(jí)聯(lián)循環(huán)放大技術(shù),基于血小板衍生因子(PDGF-BB)與其適體的特異性識(shí)別作用,實(shí)現(xiàn)了對(duì)PDGF-BB的化學(xué)發(fā)光免標(biāo)記高靈敏檢測(cè)。該體系由雙鏈DNA(核酸適體-受體)、兩種發(fā)卡結(jié)構(gòu)DNA分子,以及核酸外切酶組成。通過(guò)核酸適體與PDGF-BB的特異性識(shí)別并結(jié)合,運(yùn)用ExoIII對(duì)雙鏈結(jié)構(gòu)的特異性剪切,實(shí)現(xiàn)核酸外切酶級(jí)聯(lián)循環(huán)放大。反應(yīng)后釋放出大量的DNA酶,其與hemin結(jié)合形成辣根過(guò)氧化物DNA模擬酶(DNAzyme),采用luminol-H2O2化學(xué)發(fā)光反應(yīng)體系檢測(cè),對(duì)PDGF-BB的檢測(cè)限可達(dá)6.8×10-13M。本方法設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單,實(shí)驗(yàn)條件溫和且為均相反應(yīng),免標(biāo)記成本低,效率高。對(duì)于具有適體序列的生物分子具有廣泛適用性。二、核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù)檢測(cè)DNA及其在分子邏輯門體系中的應(yīng)用研究基于核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA的高靈敏檢測(cè),并用于分子邏輯門...
【文章來(lái)源】:青島科技大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Exo-CARA法(循環(huán)IIIIIIII)免標(biāo)記化學(xué)發(fā)光檢測(cè)PDGF-BB的原理圖
進(jìn)而激活Recycle II。即, locker DNA與MB1的3'端互Exo III識(shí)別雙鏈結(jié)構(gòu),進(jìn)而發(fā)生剪切作用。當(dāng)剪切完兩條鏈,其中一條鏈就是blocker DNA,其繼續(xù)與MNA的循環(huán),稱這個(gè)循環(huán)過(guò)程稱為Recycle II,blocker這個(gè)循環(huán)中釋放的另一條鏈命名它為鏈A,其作為,當(dāng)鏈A與MB2的3'端互補(bǔ)結(jié)合,進(jìn)而發(fā)生ExoIII的剪先前的結(jié)構(gòu)分裂成兩條鏈,其中一條鏈就是鏈A,其,稱這個(gè)循環(huán)為Recycle III。這個(gè)循環(huán)中釋放的另一blocker DNA序列,從而引發(fā)Recycle II。如此,三個(gè)B不斷的積累。當(dāng)反應(yīng)完畢后,鏈A和鏈B中的DNAz合,形成HRP模擬酶,采用Luminol-H2O2化學(xué)發(fā)光體發(fā)光信號(hào)。量對(duì)實(shí)驗(yàn)體系影響的研究
后分別檢測(cè)各用量下的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,以此確定Exo如圖2-2所示,在Exo III的用量在0~100U之間變化,度隨著Exo III用量的增加而增加,當(dāng)酶用量大于50U著酶用量而增加。因此,選擇50 U作為最佳Exo III用時(shí)間對(duì)實(shí)驗(yàn)體系影響的研究時(shí)間是影響Luminol-H2O2-DNAzyme化學(xué)發(fā)光體系的Exo III反應(yīng)時(shí)間為 10 min,20 min,30 min,45 m別檢測(cè)不同時(shí)間下的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,以此來(lái)確定Ex影響。如圖2-3所示,體系的反應(yīng)時(shí)間在0~90 min之時(shí),化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度隨著時(shí)間的增強(qiáng)而增強(qiáng),而當(dāng)時(shí)間強(qiáng)度的變化就很不明顯,因此,選擇30 min作為體系
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于DNA/RNA的邏輯門與邏輯運(yùn)算[J]. 俞洋,陸建華,王東方,裴昊,樊春海. 科學(xué)通報(bào). 2013(02)
[2]DNA聚合酶δ與腫瘤的關(guān)系[J]. 阮細(xì)玲,吳瓊,黃怡,李永繼,徐恒. 臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志. 2012(12)
[3]限制性核酸內(nèi)切酶的規(guī)范表達(dá)[J]. 王雪瑩,郭國(guó)慶. 編輯學(xué)報(bào). 2012(03)
[4]真核生物DNA連接酶Ⅲ的功能演化[J]. 靳春艷,盛自章,黃京飛. 中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(04)
[5]肝硬化出血患者血小板4項(xiàng)參數(shù)及凝血因子的動(dòng)態(tài)變化[J]. 洪煒,楊寧,何江英,曲芬,毛遠(yuǎn)麗. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(09)
[6]胃癌及癌旁正常組織中微小RNA表達(dá)譜的檢測(cè)[J]. 陸俊,宋軍,徐溢新,孟松,白津,鄭駿年,徐為. 中華實(shí)驗(yàn)外科雜志. 2011 (08)
[7]使用DNA分子實(shí)現(xiàn)邏輯門操控[J]. 戴聞. 物理. 2011(05)
[8]肝病患者凝血因子、血小板參數(shù)檢測(cè)及臨床意義[J]. 張秀琴. 現(xiàn)代診斷與治療. 2011(02)
[9]腫瘤標(biāo)記物在消化系統(tǒng)腫瘤診斷中的研究進(jìn)展[J]. 劉慶峰,王濤,劉貴建. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(05)
[10]微小RNA與腫瘤相關(guān)性研究[J]. 程文,高建平,張征宇. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2011(02)
碩士論文
[1]基于核酸外切酶Ⅲ輔助信號(hào)放大的化學(xué)發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移體系高靈敏檢測(cè)核酸[D]. 陳春.陜西師范大學(xué) 2013
本文編號(hào):3315483
【文章來(lái)源】:青島科技大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Exo-CARA法(循環(huán)IIIIIIII)免標(biāo)記化學(xué)發(fā)光檢測(cè)PDGF-BB的原理圖
進(jìn)而激活Recycle II。即, locker DNA與MB1的3'端互Exo III識(shí)別雙鏈結(jié)構(gòu),進(jìn)而發(fā)生剪切作用。當(dāng)剪切完兩條鏈,其中一條鏈就是blocker DNA,其繼續(xù)與MNA的循環(huán),稱這個(gè)循環(huán)過(guò)程稱為Recycle II,blocker這個(gè)循環(huán)中釋放的另一條鏈命名它為鏈A,其作為,當(dāng)鏈A與MB2的3'端互補(bǔ)結(jié)合,進(jìn)而發(fā)生ExoIII的剪先前的結(jié)構(gòu)分裂成兩條鏈,其中一條鏈就是鏈A,其,稱這個(gè)循環(huán)為Recycle III。這個(gè)循環(huán)中釋放的另一blocker DNA序列,從而引發(fā)Recycle II。如此,三個(gè)B不斷的積累。當(dāng)反應(yīng)完畢后,鏈A和鏈B中的DNAz合,形成HRP模擬酶,采用Luminol-H2O2化學(xué)發(fā)光體發(fā)光信號(hào)。量對(duì)實(shí)驗(yàn)體系影響的研究
后分別檢測(cè)各用量下的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,以此確定Exo如圖2-2所示,在Exo III的用量在0~100U之間變化,度隨著Exo III用量的增加而增加,當(dāng)酶用量大于50U著酶用量而增加。因此,選擇50 U作為最佳Exo III用時(shí)間對(duì)實(shí)驗(yàn)體系影響的研究時(shí)間是影響Luminol-H2O2-DNAzyme化學(xué)發(fā)光體系的Exo III反應(yīng)時(shí)間為 10 min,20 min,30 min,45 m別檢測(cè)不同時(shí)間下的化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度,以此來(lái)確定Ex影響。如圖2-3所示,體系的反應(yīng)時(shí)間在0~90 min之時(shí),化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度隨著時(shí)間的增強(qiáng)而增強(qiáng),而當(dāng)時(shí)間強(qiáng)度的變化就很不明顯,因此,選擇30 min作為體系
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于DNA/RNA的邏輯門與邏輯運(yùn)算[J]. 俞洋,陸建華,王東方,裴昊,樊春海. 科學(xué)通報(bào). 2013(02)
[2]DNA聚合酶δ與腫瘤的關(guān)系[J]. 阮細(xì)玲,吳瓊,黃怡,李永繼,徐恒. 臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志. 2012(12)
[3]限制性核酸內(nèi)切酶的規(guī)范表達(dá)[J]. 王雪瑩,郭國(guó)慶. 編輯學(xué)報(bào). 2012(03)
[4]真核生物DNA連接酶Ⅲ的功能演化[J]. 靳春艷,盛自章,黃京飛. 中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(04)
[5]肝硬化出血患者血小板4項(xiàng)參數(shù)及凝血因子的動(dòng)態(tài)變化[J]. 洪煒,楊寧,何江英,曲芬,毛遠(yuǎn)麗. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(09)
[6]胃癌及癌旁正常組織中微小RNA表達(dá)譜的檢測(cè)[J]. 陸俊,宋軍,徐溢新,孟松,白津,鄭駿年,徐為. 中華實(shí)驗(yàn)外科雜志. 2011 (08)
[7]使用DNA分子實(shí)現(xiàn)邏輯門操控[J]. 戴聞. 物理. 2011(05)
[8]肝病患者凝血因子、血小板參數(shù)檢測(cè)及臨床意義[J]. 張秀琴. 現(xiàn)代診斷與治療. 2011(02)
[9]腫瘤標(biāo)記物在消化系統(tǒng)腫瘤診斷中的研究進(jìn)展[J]. 劉慶峰,王濤,劉貴建. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(05)
[10]微小RNA與腫瘤相關(guān)性研究[J]. 程文,高建平,張征宇. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2011(02)
碩士論文
[1]基于核酸外切酶Ⅲ輔助信號(hào)放大的化學(xué)發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移體系高靈敏檢測(cè)核酸[D]. 陳春.陜西師范大學(xué) 2013
本文編號(hào):3315483
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