合成生物學是生命科學在二十一世紀剛剛出現的一個正在迅速發(fā)展的分支學科,它與化學、物理學、信息科學、工程科學、計算機等多種學科相結合。基因部件及其內部特征是合成生物學家的主要研究對象,而序列信息是部件及其內部特征的基礎組成�，F有的部件及其特征序列往往是沿用以前的信息,這些信息不全面、不準確,另外對部件及其特征序列的描述、格式都沒有統(tǒng)一的標準,現在的分析數據的方法較為費時,這使得學者對部件內部特征研究困難重重。為了解決這一問題,我們使用新的方法來分析廣泛使用的數據包含超過7000個部件和70000多個特征序列。使用結構化查詢語句（SQL）,使我們獲得全面非冗余的信息從而構成一個完整的數據集。通過對比分析生物部件的內部序列特征,我們?yōu)楹铣缮飳W家提供了構造新的具有特定的功能質粒部件的理論基礎。GenoCAD是合成生物學領域的軟件工具可幫助設計復雜的結構,在GenoCAD平臺上根據個人需求可以設計相應的語法規(guī)則來構造一種DNA分子。邏輯門在各個學科領域都有涉及和廣泛的應用,但在設計構造質粒的方面還未有提及,雜志期刊上已發(fā)表的文章也沒有用邏輯門來構造質粒部件的應用,本文提出了自己在生物部件的構建... 

【文章來源】：陜西師范大學陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】：71 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１雙穩(wěn)態(tài)轉換器的設計??阻遏蛋白１?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒｌ）由｜Ｃ啟動子ｌ（Ｐｒｏｍｏｔｅｒｌ抑制了阻遏蛋白２?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒ２）的轉錄

Ｔ??Ｉｎｄｕｃｅｒ?１??圖１－１雙穩(wěn)態(tài)轉換器的設計??阻遏蛋白１?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒｌ）由｜Ｃ啟動子ｌ（Ｐｒｏｍｏｔｅｒｌ）抑制了阻遏蛋白２?（Ｒｅｐｒｅｓｓｏｒ２）的轉錄。??這個轉換器應用誘導物１或２?（ｉｎｄｕｃｅｒ）可以在穩(wěn)態(tài)之間翻轉。??為了能夠設計較大的和更復雜的基因線路，常用到標準化的生物模塊－生物積??塊（Ｂｉｏｂｒｉｃｋ）?［１７＿＇但由于成分、宿主和合成系統(tǒng)不完全清楚，使其難于預測特??殊宿主內合成網絡的精確行為。??合成生物學是借助設計和構建遺傳路線合成新的生物機體，許多合成生物學??家用生物積塊（ＢｉｏＢｒｉｃｋ）組裝遺傳路徑，ＢｉｏＢｒｉｃｋ中有各種各樣的特征，例如：??啟動子、核糖體結合位點，編碼蛋白質及轉錄終止子等。每個ＢｉｏＢｒｉｃｋ的本質都??是環(huán)狀質粒上的一種物理ＤＮＡ序列。ＢｉｏＢｒｉｃｋ的標準化序列能夠經由限制酶消化??和連接兩個ＢｉｏＢｒｉｃｋ［１８］的組裝，標準組裝涉及用不同的酶消化兩種質粒，留下相??同的黏性末端，其可以一起連接成新的質粒。這種在模塊之間用序列取代限制性??酶切位點

可運行外部程序，可以通過掃描這些程序的輸出得到你感興趣的東西。Ｐｅｒｌ語言也??很容易在許多現代操作系統(tǒng)上編譯和運行，它是高效率的編程語言。從ｉＧＥＭ上??提取數據，我們用語句如圖２－１來實現數據獲取并依據數據類型對對數據分類、分??析以獲得所需信息。??１１??

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3225181