新疆尼勒克吉仁臺溝口遺址是伊犁河流域一處具有重要研究價值的青銅時代晚期聚落遺址,規(guī)模巨大,布局復雜,出土遺物豐富,它的發(fā)掘為建立伊犁河流域的史前考古學文化序列、了解伊犁河流域青銅時代考古學文化的具體面貌和早期中西文化的交流提供了極為寶貴的資料,對該遺址的全面、詳細的研究有利于我們更好地了解吉仁臺溝口遺址的文化內(nèi)涵�？脊殴ぷ髡咴诩逝_溝口遺址中發(fā)掘出了大量的動物骨骼遺骸,這些古動物遺骸以牛、馬、羊居多,同時也有少量不明種屬的野生動物遺骸,對這些野生動物遺骸的研究有利于我們了解古代居民的飲食結構、狩獵活動、經(jīng)濟模式等重要問題。我們在吉仁臺溝口遺址收集到了9個野生動物遺骸,確切的種屬不確定,需要通過古DNA的方法鑒定它們的種屬。通過對吉仁臺溝口遺址出土的9例不明種屬動物遺骸展開古DNA測序分析,得到了5個理想的線粒體全基因組數(shù)據(jù),并開展了古DNA分析。從Gen Bank數(shù)據(jù)庫下載了42例線粒體全基因組序列,包括盤羊以及其他物種,利用相關軟件將獲得的數(shù)據(jù)與下載數(shù)據(jù)進行系統(tǒng)發(fā)育分析,構建NJ樹、ML樹及bayes樹,系統(tǒng)發(fā)育結果顯示古代樣本與盤羊聚在一支,置信度較高,證明這5例樣本是盤羊（Ovi... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 論文的選題目的及意義
    1.2 新疆吉仁臺溝口遺址
        1.2.1 尼勒克縣自然地理環(huán)境與歷史概況
        1.2.2 吉仁臺溝口遺址的發(fā)掘
        1.2.3 新疆尼勒克吉仁臺溝口遺址的年代及文化意義
    1.3 “黃羊”在中國的分布
    1.4 新疆巖畫中的羊
    1.5 盤羊的種群特征、分布及分類
        1.5.1 盤羊的種群特征
        1.5.2 盤羊在我國的分布
        1.5.3 盤羊的種屬分類
        1.5.4 盤羊瀕危的原因
    1.6 古DNA研究
        1.6.1 古DNA研究對象及特點
        1.6.2 古DNA研究的歷史進程
        1.6.3 DNA測序技術的發(fā)展
第2章 研究材料與方法
    2.1 研究材料
    2.2 實驗試劑、實驗儀器及常用溶液配制
    2.3 實驗方法與流程
        2.3.1 前期處理
        2.3.2 提取DNA
        2.3.3 DNA文庫構建
        2.3.4 建庫后樣本檢驗及測序
        2.3.5 古DNA真實性
    2.4 數(shù)據(jù)分析
        2.4.1 原始數(shù)據(jù)處理
        2.4.2 線粒體基因組的提取
        2.4.3 線粒體基因組的分析
第3章 實驗結果及分析
    3.1 實驗結果
        3.1.1 原始測序數(shù)據(jù)分析
        3.1.2 古DNA損傷
    3.2 線粒體全基因組系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.2.1 鄰接樹
        3.2.2 最大似然樹
        3.2.3 貝葉斯樹
    3.3 盤羊亞種系統(tǒng)發(fā)育樹分析—細胞色素b
    3.4 母系群體歷史分析
第4章 討論
    4.1 盤羊與古代居民的關系
    4.2 關于盤羊母系種群大小變化的討論
    4.3 盤羊保護的建議
第5章 結語
參考文獻
作者簡介及科研成果
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]新疆尼勒克縣吉仁臺溝口遺址2015～2018年考古收獲及初步認識[J]. 王永強,袁曉,阮秋榮.  西域研究. 2019(01)
[2]新疆塔什庫爾干野生動物自然保護區(qū)馬可波羅盤羊種群調(diào)查[J]. 陳強強,李美玲,韓芳,汪沐陽,徐文軒,楊維康.  四川動物. 2018(06)
[3]史前游牧生業(yè)的考古學觀察——新疆西天山史前聚落分析[J]. 賈偉明.  西域研究. 2018(03)
[4]新疆尼勒克縣吉仁臺溝口遺址[J]. 阮秋榮,王永強.  考古. 2017(07)
[5]盤羊國內(nèi)研究現(xiàn)狀及展望[J]. 裴佩.  綠色科技. 2017(08)
[6]2015年新疆尼勒克縣吉仁臺溝口考古工作的新收獲[J]. 王永強,阮秋榮.  西域研究. 2016(01)
[7]東帕米爾高原盤羊分布與棲息地植被覆蓋時空變化[J]. 王玉濤,戴志剛,楊世杰,羅玉柱.  生態(tài)學報. 2016(01)
[8]DNA測序技術的進展和挑戰(zhàn)[J]. 蔡曉靜,朱煌,孔繁琪,馮婕妤,趙立全,牛宗鎮(zhèn).  現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2013(20)
[9]中國家養(yǎng)動物起源的古DNA研究進展[J]. 蔡大偉,孫洋.  邊疆考古研究. 2012(02)
[10]漢代對羊紋金飾片初探[J]. 鄭彤.  考古與文物. 2011(04)

博士論文
[1]青藏高原東北部及其周邊地區(qū)新石器晚期至青銅時代先民利用動物資源的策略研究[D]. 任樂樂.蘭州大學 2017
[2]新疆伊犁河谷史前考古學文化研究[D]. 李溯源.南京大學 2013

碩士論文
[1]內(nèi)蒙古中部戈壁盤羊食性分析研究[D]. 裴佩.內(nèi)蒙古師范大學 2017
[2]新疆尼勒克窮科克巖畫研究[D]. 何軍鋒.西北大學 2005



本文編號：3196265