本文關(guān)鍵詞：6q24-25.1區(qū)域新STR基因座及其在法醫(yī)學(xué)和胃癌LOH研究中的應(yīng)用

  更多相關(guān)文章： 6號(hào)染色體 短串聯(lián)重復(fù)序列 聚合酶鏈反應(yīng) 法醫(yī)學(xué) 雜合性缺失 腫瘤抑癌基因 胃癌

【摘要】：背景和目的 STR是廣泛存在于人類基因組中的一類具有高度多態(tài)性的短串聯(lián)重復(fù)序列,又稱為微衛(wèi)星DNA。作為第二代遺傳標(biāo)記,STR己被廣泛地應(yīng)用于個(gè)體識(shí)別、親權(quán)鑒定、精細(xì)遺傳圖的構(gòu)建、連鎖不平衡性分析、腫瘤抑癌基因的雜合性缺失、疾病基因定位和器官移植等領(lǐng)域。在群體遺傳學(xué)中的STR多態(tài)性研究構(gòu)成了法醫(yī)學(xué)應(yīng)用的基礎(chǔ),STR分析極大地拓寬了法醫(yī)物證檢驗(yàn)范圍。腫瘤抑癌基因通常通過(guò)二次打擊機(jī)制而失活,即一個(gè)等位基因發(fā)生了突變,另一個(gè)等位基因發(fā)生了雜合性缺失。雜合性缺失是在大部分實(shí)體瘤的基因組中發(fā)現(xiàn)的一種普遍的遺傳學(xué)改變。非隨機(jī)區(qū)域的雜合性缺失可能意味著在此區(qū)域存在有抑癌基因,它的缺失能促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展,因此它或許有癌變發(fā)生、發(fā)展的預(yù)后征兆的意義。 本課題旨在查找6號(hào)染色體6q24-25.1區(qū)域上新的STR基因座,為法醫(yī)學(xué)和腫瘤學(xué)等各領(lǐng)域的應(yīng)用提供更多可供選擇的STR遺傳標(biāo)記；調(diào)查6q24-25.1區(qū)域上新的STR基因座在河南漢族群體中的遺傳多態(tài)性,評(píng)價(jià)其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價(jià)值。同時(shí)我們用6q24-25.1區(qū)域上的4個(gè)新查找的STR標(biāo)記檢測(cè)了30例胃癌標(biāo)本的LOH情況,以求進(jìn)一步闡明胃癌發(fā)病的分子學(xué)機(jī)制。 方法 尋找人類6號(hào)染色體6q24-25.1區(qū)域中新的STR基因座,選擇重復(fù)單位為四核苷酸的微衛(wèi)星,利用Primer3軟件設(shè)計(jì)引物;應(yīng)用降溫PCR方法對(duì)基因座進(jìn)行擴(kuò)增,電泳分型。優(yōu)化其擴(kuò)增條件,在群體內(nèi)查找不同的等位基因,構(gòu)建等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物。調(diào)查6號(hào)染色體上新發(fā)現(xiàn)的STR基因座在河南漢族群體中的等位基因頻率。利用PowerStats vl.2軟件分析結(jié)果,獲得群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù),計(jì)算個(gè)體識(shí)別概率(PD),非父排除率(PE),多態(tài)信息含量(PIC)、等位基因頻率(frequency)、雜合度(H)等法醫(yī)學(xué)參數(shù)。 選取6q24-25.1區(qū)域上的4個(gè)STR標(biāo)記,對(duì)腫瘤組織和正常對(duì)照組織進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)?PCR)反應(yīng),非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析,以檢測(cè)LOH發(fā)生情況。 結(jié)果 通過(guò)對(duì)6號(hào)染色體DNA序列的查找,我們發(fā)現(xiàn)了14個(gè)新的STR基因座,其中6個(gè)基因座的PD值、H和PIC較高且易于準(zhǔn)確分型,分別命名為：D6SZ2、D6SZ6、D6SZ7、D6SZ8、D6SZ9、D6SZ12,其擴(kuò)增片段分別是219bp、150bp、167bp、234bp、246bp、193bp(參考序列)。在河南漢族群體中這6個(gè)STR基因座分別檢出6、6、7、4、7、5個(gè)等位基因,H值分別為0.555、0.555、0.585、0.712、0.667、0.750,PD值分別是0.857、0.811、0.821、0.803、0.829、0.827,PIC分別是0.65、0.57、0.62、0.60、0.61、0.64。 用其中4個(gè)STR遺傳標(biāo)記對(duì)30例成對(duì)胃癌和正常對(duì)照組織的LOH的結(jié)果發(fā)現(xiàn),30例胃癌樣本中有3份樣本發(fā)生了LOH,其中位于6q24.2的D6SZ7發(fā)生LOH的頻率最高,達(dá)到15.0%,其次為6q24.1的D6SZ2(11.1%),6q24.2的D6SZ8(9.09%),6q24.2的D6SZ9(6.25%) 結(jié)論 利用6q24-25.1區(qū)域上的DNA序列信息,我們查找到了6個(gè)多態(tài)性較好、易于準(zhǔn)確分型的STR基因座,可應(yīng)用于法醫(yī)物證學(xué)檢驗(yàn)和人類遺傳學(xué)研究中。在此區(qū)域上有一個(gè)候選抑癌基因PLAGL1,且在胃癌標(biāo)本中發(fā)生了低頻率的LOH。
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2011
【分類號(hào)】：D919;R735.2

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 常云峰;蔡繼峰;楊立;文繼舫;;2個(gè)STR基因座變異親子鑒定1例[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2011年03期

2 歐雪玲;孫宏鈺;陸惠玲;張敏紅;吳鴻彬;;有父系血緣關(guān)系但排除同父異母半同胞鑒定1例[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2011年03期

3 齊漫龍;張媛媛;劉曉亮;何蓉;趙彥艷;;QF-PCR在染色體異常男性不育癥診斷中的應(yīng)用[J];遺傳;2011年08期

4 ;[J];;年期

5 ;[J];;年期

6 ;[J];;年期

7 ;[J];;年期

8 ;[J];;年期

9 ;[J];;年期

10 ;[J];;年期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 丁浩強(qiáng);葉欣;徐秀章;陳揚(yáng)凱;;廣東漢族人群2號(hào)染色體上2個(gè)STR位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性分析[A];中國(guó)輸血協(xié)會(huì)第五屆輸血大會(huì)論文專集（摘要篇）[C];2010年

2 張丹妍;張丹媚;萬(wàn)玲;呂靜;陳曉星;趙樂(lè)天;李練兵;;親子鑒定中Identifiler~(TM)系統(tǒng)15個(gè)STR基因座基因突變分析[A];經(jīng)濟(jì)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變與自主創(chuàng)新——第十二屆中國(guó)科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)年會(huì)（第三卷）[C];2010年

3 焦宇飛;;22q13.31 LOH與胃癌侵襲性的關(guān)系[A];第九屆全國(guó)腫瘤轉(zhuǎn)移學(xué)術(shù)大會(huì)暨2011年黑龍江省醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)年會(huì)報(bào)告集[C];2011年

4 朱宇寧;沈鳳賢;李帥;周麗琴;陳雁;馬裕;呂時(shí)銘;;浙江省漢族人群21號(hào)染色體上11個(gè)STR基因座的遺傳多態(tài)性分析[A];2011年浙江省檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2011年

5 黃艷梅;楊保勝;;中國(guó)北方漢族群體9個(gè)STR基因座的遺傳多態(tài)性[A];中國(guó)的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動(dòng)中國(guó)西部經(jīng)濟(jì)與社會(huì)發(fā)展——2011年中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)大會(huì)論文摘要匯編[C];2011年

6 胡曉華;彭煜;;遲發(fā)性性腺功能減退癥(LOH)診療進(jìn)展[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)第十一屆男科學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2011年

7 黃曉寧;;基于STR的工作流流程定義[A];第二十二屆中國(guó)數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集（技術(shù)報(bào)告篇）[C];2005年

8 袁麗;魯滌;楊雪;;國(guó)產(chǎn)STR熒光復(fù)合試劑盒DNAtyper15應(yīng)用結(jié)果分析[A];第二屆全國(guó)法醫(yī)DNA檢驗(yàn)技術(shù)研討會(huì)論文專輯[C];2004年

9 張麗杰;鞏在武;;氣候變化對(duì)糧食單產(chǎn)的影響分析——以南京為例[A];第四屆中國(guó)科學(xué)學(xué)與科技政策研究會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集（Ⅱ）[C];2008年

10 高樹輝;喬可;李生斌;;使用化學(xué)銀染技術(shù)研究云南怒族3個(gè)X-STR位點(diǎn)遺傳多態(tài)性[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第二十五屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集（上冊(cè)）[C];2006年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 李爽;STR獲得中國(guó)計(jì)量認(rèn)證[N];中國(guó)包裝報(bào);2009年

2 國(guó)家人口計(jì)生委科研所男性臨床研究室主任 谷翊群 馬丹蕊整理;中老年男性 請(qǐng)關(guān)注LOH[N];健康報(bào);2009年

3 湖南 劉春華;西普STR電動(dòng)機(jī)軟啟動(dòng)器控制電路及檢修(二)[N];電子報(bào);2010年

4 本報(bào)記者 高穎;網(wǎng)站愛(ài)財(cái) 取之有道[N];計(jì)算機(jī)世界;2001年

5 記者王義偉;歐盟進(jìn)口商聲援中國(guó)節(jié)能燈[N];中華工商時(shí)報(bào);2002年

6 謝少常;網(wǎng)亭互聯(lián)網(wǎng)上尋找新商機(jī)[N];中國(guó)信息報(bào);2001年

7 李昂;攜程模式羽翼漸豐[N];中國(guó)旅游報(bào);2002年

8 本報(bào)記者 薛中卿;打開生命本源的“金鑰匙”[N];無(wú)錫日?qǐng)?bào);2009年

9 王傳超 李士林 周懷谷 平原 李輝 復(fù)旦大學(xué)現(xiàn)代人類學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；上海市公安局法醫(yī)物證學(xué)現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用技術(shù)公安部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；復(fù)旦大學(xué)—上海市公安局人類生物學(xué)與法醫(yī)現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用技術(shù)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室;將DNA鑒定技術(shù)正確應(yīng)用于司法實(shí)踐[N];中國(guó)社會(huì)科學(xué)報(bào);2011年

10 本報(bào)記者 王峻峰;旅游網(wǎng)絡(luò)業(yè)還能給我們什么驚喜？[N];江蘇經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 裴黎;毒品原植物大麻DNA檢測(cè)技術(shù)的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2007年

2 石美森;Y染色體STR和SNP復(fù)合檢測(cè)方法的研究[D];四川大學(xué);2005年

3 張U，

本文編號(hào)：1210611