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非小細胞肺癌腫瘤進展預測建模研究

發(fā)布時間:2020-09-25 22:39
   自20世紀80年代起,肺癌已成為目前世界范圍內發(fā)病率及死亡率最高的惡性腫瘤。圍繞腫瘤進展的建模研究能輔助醫(yī)生了解病情、選擇治療方式,具有較重要科研和臨床意義,已成為廣大醫(yī)療工作者和科研人員的重要研究課題。 首先從基于橫截面、縱向數據兩個方面介紹建模研究現(xiàn)狀并闡述醫(yī)學數據的特點。本課題收集到的患者數據主要為縱向數據,因此以縱向數據為重點進行建模研究,針對不同的研究問題提出不同的建模方案,然后設計了診療輔助管理原型系統(tǒng)(DTAMS)并開發(fā)部分模塊。最后對研究工作進行總結和展望。本文的探索和研究內容如下: (1)在調研和數據特點分析基礎上,本文提出腫瘤進展建模的整體研究方案,介紹本課題的工作流程與所涉及的關鍵問題,并對本課題涉及到的醫(yī)學數據的特點進行描述,同時對數據進行初步的篩選與處理。 (2)針對非小細胞肺癌中晚期患者的生存質量問題利用多層線性模型進行建模研究。以時變的隨訪次數與不隨時間變化的患者個體特征為輸入,以患者不同次檢查的FACT評分為輸出,研究FACT評分隨時間的變化趨勢,并利用患者個體特征(如性別、年齡等特征)研究不同患者的FACT評分變化趨勢間的差異。通過建立該模型,可以幫助醫(yī)生全面了解目前治療人群的生存質量評分的變化趨勢,并針對不同個體特征人群采取不同的治療方案提高其生存質量。 (3)利用變系數模型研究時變的腫瘤大小進展情況。利用變系數模型探索時變的檢測指標項與時變的腫瘤大小之間的映射關系,同時利用本文提出的B樣條估計與Adaptive-Lasso懲罰最小二乘結合的兩步迭代法,對各個指標項進行系數估計與變量選擇,并分析哪些變量對輸出為時變效應,哪些變量對輸出為常數效應,哪些變量為零效應,從而指導醫(yī)生針對影響系數較大的指標項采取合理的控制手段,間接抑制腫瘤的進一步發(fā)展。同時可以根據本次檢查的指標項與估計出的系數對腫瘤大小進行預測,輔助醫(yī)生對腫瘤大小的變化趨勢有更直觀的了解。 (4)除了以腫瘤大小來反映腫瘤的進展情況外,我們將腫瘤的復發(fā)、擴大、轉移以及新腫瘤的出現(xiàn)結合起來判斷腫瘤是否發(fā)生進展,該指標項為二分類型數據,有進展為1,無進展為0。變系數模型不能直接用于分析二分類型輸出的數據,因此考慮用Logistic變系數模型對腫瘤有無進展項進行建模研究。每個患者每次檢測的腫瘤有無進展情況不同,其也為縱向數據。我們擬探索時變的檢測指標項與時變的腫瘤有無進展項之間的映射關系,在對系數的估計中,我們首先對系數進行B樣條逼近,利用B樣條基引入時間因素使其適用于處理縱向數據,然后利用極大似然法對各個系數進行估計,并且可以根據本次檢查的指標項計算本次腫瘤發(fā)生進展的概率,當腫瘤發(fā)生進展的概率大于50%時,則認為腫瘤將會發(fā)生進展。 本課題還完成了診療輔助管理原型系統(tǒng)中的腫瘤進展建模模塊的開發(fā)與設計,在一定程度上推動了課題組對腫瘤進展建模研究工作的深入開展。
【學位單位】:北京工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2013
【中圖分類】:R734.2;N945.12
【部分圖文】:

均勻分布,零系,樣條逼近,常系數


圖 4-3cz 計算流程圖Figure 4-3 Calculation flow chart ofcz 法稱之為 IVSM(Iterative Variable S Wang,Li 于 2008 年將 B 樣條逼近行比較,BSCAD 也適用于處理縱向性能,但是無法分離常系數與零系面,將兩種方法進行比較。隨機產10i 0 k1( )= ( ) ( ) ( )ij ij ij ik ij ijkY u u u X u e ~ (0,1)iu U , ~ (0,1)ikX N ,0 (t ) sin()=-1,5 (u )=1,k (u )=0, k =6, 10,e ~i2 2 2 ,0.2 ,0.4代表不同的模型誤差水平,均勻分布在(0,1)之間的 20 個時

模型圖,變系數,模型


圖 4-5 估計出的變系數Figure 4-5 Estimated varying coefficient最終,我們得到如下模型0{1,2,3,5,6,7,8,9,10,12,14, {1113}15,16,17,18,19,20,23,24}( ) ( ) ( ) ( ) ( )i ij ij k ij k ij k k ij ijk kY u u u X u X u ,(4-39)在式(4-39)中,第一項為截距,第二項為變系數部分,第三項為常系數部分,其中所有系數的估計值見表 4-3 和圖 4-5。我們可以將不同檢測次數的檢測指標與估計出的系數代入上述模型,從而計算出當次的腫瘤大小。從圖 4-5 中,可以看出,大多數變量的系數均為時變系數,說明不同時間的觀測變量對腫瘤大小的影響總是變化的,截距0 (t )的變化趨勢可以看出,0 (t )在第四次治療時達到最大值,隨著時間的推移逐漸變小,說明患者經過醫(yī)院的治療,腫瘤病灶有明顯減小或者消失的趨勢。在所有變量中,血紅蛋白、神疲乏力、食欲不振、便秘、癥候這些變量估計出的系數為 0,則從模型中剔除,說明這些變量對腫瘤大小的變化無關,可以提示醫(yī)生這些癥狀對結果影響不大,后期的治療中可以忽視這些變量。癌胚抗原、

曲線,模型,截距,通用模型


第 4 章 變系數模型對腫瘤進展的建模研究表 4-4 與表 4-5 可以看出,系數的估計結果與通用模型的估計結果,在這里不再展示每個系數的估計值,僅將其模型的截距0 的估來,如下圖 4-6,4-7 所示,可以明顯看出,不同嚴重程度的人群型的截距明顯不同,但截距的變化曲線與通用模型的截距變化趨勢第三次或者第五次治療時達到最大值,然后有明顯的下降趨勢,說效果顯著。20 21 22 23 24 25 26 值0 0 0 V V 0 0

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