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細胞周期因子Geminin對CRISPR/Cas9編輯效率的影響

發(fā)布時間:2024-05-20 03:01
  [目的]旨在探究細胞周期因子Geminin對Cas9在細胞基因組中的編輯效率是否有影響。[方法]將Geminin的前40個氨基酸序列對應的cDNA序列克隆到含靶向COSMC基因的sgRNA的pX459質(zhì)粒pX459-COSMC-Cas9(wtCas9)上得到能在Cas9蛋白N端融合表達Geminin片段的pX459-COSMC-Geminin-Cas9質(zhì)粒(Geminin-Cas9)。在人胚胎腎細胞HEK293T或人結(jié)腸癌細胞HT29細胞中同時表達wtCas9和Geminin-Cas9蛋白質(zhì),檢測并比較細胞中Cas9的表達水平和Cas9編輯COSMC基因的效率。[結(jié)果]Western Blotting檢測發(fā)現(xiàn)相比wtCas9質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染Geminin-Cas9質(zhì)粒的細胞中Cas9表達水平更低,Geminin-Cas9載體對COSMC基因的編輯效率在編輯前期也相對較低,但隨著編輯時間的延長,兩者的編輯效率趨于一致。[結(jié)論]細胞周期因子Geminin的存在能降低Cas9在細胞中的總體表達水平,在編輯前期會在一定程度上降低Cas9的編輯效率,而延長編輯時間又能消除這一影響。

【文章頁數(shù)】:9 頁

【部分圖文】:

圖1編輯細胞基因組中COSMC基因的過程示意圖

圖1編輯細胞基因組中COSMC基因的過程示意圖

將HEK293T細胞種在12孔板中,在細胞融合度達到60~70%時同時瞬時轉(zhuǎn)染等量的wtCas9和Geminin-Cas9質(zhì)粒(具體操作按Lipo3000轉(zhuǎn)染試劑說明書),轉(zhuǎn)染24h后將培養(yǎng)基換成帶有2.5μg/mL嘌呤霉素的培養(yǎng)基,篩選48h后將細胞傳代除去死去的細胞。在....


圖2Geminin-Cas9質(zhì)粒的構(gòu)建

圖2Geminin-Cas9質(zhì)粒的構(gòu)建

在HEK293T細胞和HT29細胞中同時瞬時轉(zhuǎn)染等量的wtCas9和Geminin-Cas9質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染24h后加入終濃度5μg/mL或10μg/mL的cycloheximide(CHX),在不同時間收集細胞樣品,通過WesternBlotting方法去檢測Cas9蛋白質(zhì)在....


圖3wtCas9和Geminin-Cas9在細胞中Cas9表達水平的比較

圖3wtCas9和Geminin-Cas9在細胞中Cas9表達水平的比較

在HEK293T細胞中瞬時轉(zhuǎn)染同等量的wtCas9和Geminin-Cas9質(zhì)粒后,在不同時間收集細胞提取基因組DNA檢測并比較其編輯效率。收集細胞提取細胞基因組后,通過基因組PCR擴增得到包含靶序列的一段COSMC基因片段(圖4A),將PCR產(chǎn)物送測序。從測序結(jié)果圖可見,與sg....


圖4wtCas9和Geminin-Cas9在細胞中編輯效率的比較

圖4wtCas9和Geminin-Cas9在細胞中編輯效率的比較

將測序文件放入TIDE網(wǎng)站測得Cas9在不同時間點對COSMC基因的編輯效率,結(jié)果表明在HEK293T細胞中,在前面幾天Geminin-Cas9的編輯效率比wtCas9更低,但隨著時間的推移,兩者的編輯效率均逐漸升高,到傳代后4d左右編輯效率會基本持平(圖4D)。這可能是由于....



本文編號:3978855

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