珠子參作為一種珍稀藥用植物,可以為我們提供珍貴的藥物資源,而作為高等植物中最大轉(zhuǎn)錄因子之一的WRKY轉(zhuǎn)錄因子在珠子參中的研究鮮有報(bào)道。主要分析珠子參WRKY轉(zhuǎn)錄因子序列,首先從珠子參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選出長度大于500 bp的WRKY基因,然后進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域分析,同時(shí)用這些序列與珠子參所含成分相似的人參屬植物人參、三七、西洋參的WRKY轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行多序列比對(duì),可以預(yù)測序列之間的結(jié)構(gòu)和功能,然后做系統(tǒng)發(fā)育分析,分析序列之間的同源關(guān)系,最后將具有WRKY保守結(jié)構(gòu)域的序列與珠子參莖節(jié)與節(jié)間總差異表達(dá)中篩選出交集,將交集基因及其差異表達(dá)數(shù)據(jù)繪制出熱圖,可以得到各差異表達(dá)基因的關(guān)系及基因表達(dá)水平。結(jié)果顯示,72條珠子參WRKY轉(zhuǎn)錄因子序列中共有45條序列具有WRKY保守結(jié)構(gòu)域,其中包含8個(gè)I組WRKY轉(zhuǎn)錄因子、2個(gè)III組WRKY轉(zhuǎn)錄因子、32個(gè)II組WRKY轉(zhuǎn)錄因子,剩余3個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)缺失的WRKY轉(zhuǎn)錄因子。從進(jìn)化關(guān)系來看,其中有6個(gè)珠子參WRKY轉(zhuǎn)錄因子跟人參、西洋參、三七的親緣關(guān)系比較近。從差異表達(dá)基因來看,大多數(shù)WRKY基因在珠子參的根莖的莖節(jié)中的表達(dá)水平較高,而在根莖的節(jié)間中WRKY基因表達(dá)...

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【文章目錄】：
1 引言
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 珠子參WRKY基因篩選
        2.2.2 保守結(jié)構(gòu)域分析
        2.2.3 多序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.2.4 WRKY差異表達(dá)基因模式分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 珠子參WRKY基因
    3.2 WRKY基因保守結(jié)構(gòu)域氨基酸比對(duì)結(jié)果
    3.3 WRKY基因同源性分析結(jié)果
    3.4 WRKY差異表達(dá)基因模式分析結(jié)果
4 結(jié)論與討論



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