目的:基于形態(tài)和分子特征對腐食酪螨(Tyrophagus putrescentiae)進(jìn)行物種鑒定,測定其線粒體基因組并與粉螨亞目其他螨類進(jìn)行比較和分析,同時(shí)測定腐食酪螨的轉(zhuǎn)錄組,預(yù)測出腐食酪螨變應(yīng)原基因,并進(jìn)一步探究居室空調(diào)濾塵網(wǎng)灰塵中是否存在腐食酪螨變應(yīng)原,為防治腐食酪螨及其引起的過敏性疾病奠定理論基礎(chǔ)。方法:采集面粉樣本中的腐食酪螨并進(jìn)行純培養(yǎng)后,于光鏡和掃描電鏡下對腐食酪螨進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察,同時(shí)采用PCR法擴(kuò)增其COX1和ITS基因片段,結(jié)合形態(tài)特征進(jìn)行物種鑒定,采用高通量測序法測定腐食酪螨線粒體基因組,分析其基因結(jié)構(gòu)、堿基組成、蛋白質(zhì)編碼基因、密碼子使用情況、rRNA基因和t RNA基因等,并與粉螨亞目其他螨類進(jìn)行比較和分析。進(jìn)一步采用高通量測序法對腐食酪螨卵、幼螨、若螨、成螨進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,通過NR、GO、KOG等數(shù)據(jù)庫比對后進(jìn)行注釋和分析,找出不同發(fā)育階段的腐食酪螨轉(zhuǎn)錄組的差異表達(dá)基因,篩選出變應(yīng)原基因。進(jìn)一步采用PCR法擴(kuò)增安徽4個(gè)城市居室空調(diào)濾塵網(wǎng)灰塵中腐食酪螨1類、2類變應(yīng)原基因的表達(dá)。結(jié)果:(1)光鏡下腐食酪螨成螨螨體呈橢圓形,表皮光滑,半透明,螯肢和足略帶棕色,幼...

【文章頁數(shù)】：104 頁

【學(xué)位級別】：碩士

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摘要
Abstract
前言
第一部分 腐食酪螨的形態(tài)和分子特征鑒定
    1 研究目的
    2 材料與方法
        2.1 主要儀器和試劑
        2.2 樣本采集
        2.3 形態(tài)特征觀察
        2.4 分子標(biāo)記擴(kuò)增及測序
    3 結(jié)果
        3.1 腐食酪螨光鏡下形態(tài)特征
        3.2 腐食酪螨電鏡下形態(tài)特征
        3.3 腐食酪螨COX1基因及其同源性比較分析
        3.4 腐食酪螨ITS基因及其同源性比較分析
    4 討論
第二部分 腐食酪螨線粒體基因組測序及分析
    1 研究目的
    2 材料與方法
        2.1 主要儀器和試劑
        2.2 樣本采集
        2.3 基因組DNA提取
        2.4 高通量測序
        2.5 序列處理及分析
        2.6 粉螨亞目螨類線粒體全序列的比較和分析
    3 結(jié)果
        3.1 腐食酪螨的線粒體基因組全序列
        3.2 粉螨亞目螨類的線粒體基因組序列比較
    4 討論
第三部分 腐食酪螨轉(zhuǎn)錄組測序與分析
    1 研究目的
    2 材料與方法
        2.1 主要儀器和試劑
        2.2 腐食酪螨不同發(fā)育階段采集
        2.3 腐食酪螨不同發(fā)育階段RNA提取
        2.4 高通量測序
        2.5 生物信息學(xué)分析
        2.6 基因表達(dá)差異分析
        2.7 過敏原基因的篩選
    3 結(jié)果
        3.1 腐食酪螨不同發(fā)育階段轉(zhuǎn)錄組高通量測序與組裝
        3.2 腐食酪螨轉(zhuǎn)錄組unigenes功能注釋
        3.3 腐食酪螨KEGG代謝通路分析
        3.4 腐食酪螨編碼區(qū)的預(yù)測
        3.5 腐食酪螨不同生長發(fā)育階段差異表達(dá)基因分析
        3.6 腐食酪螨過敏原基因的比對
    4 討論
第四部分 居室空調(diào)濾塵網(wǎng)腐食酪螨變應(yīng)原檢測
    1 研究目的
    2 材料與方法
        2.1 主要試劑和儀器
        2.2 樣本采集
        2.3 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增
        2.4 序列處理與分析
    3 結(jié)果
        3.1 Derf1、Derp1和Tyrp1 基因擴(kuò)增結(jié)果
        3.2 Derf1、Derp1和Tyrp1 基因比對結(jié)果
        3.3 不同地區(qū)空調(diào)濾塵網(wǎng)灰塵Derf1、Derp1和Tyrp1 檢測結(jié)果
    4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
作者簡介及讀研期間主要科研成果
致謝



本文編號：3829282