中國(guó)西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性及分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-07 02:24
目的:1.基于16S rRNA基因建立分布于中國(guó)西南喀斯特地域淡水蟹物種的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),探討與確立中國(guó)淡水蟹類地理區(qū)劃分區(qū)單元與西南喀斯特地貌的關(guān)系。2.基于作者采集和南昌大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院淡水十足目甲殼動(dòng)物與并殖吸蟲研究室標(biāo)本庫(kù)所保藏的西南八省區(qū)的31屬129物種合計(jì)640個(gè)淡水蟹類個(gè)體,由此構(gòu)建西南喀斯特地域淡水蟹類地理信息系統(tǒng)(GIS),旨在尋找喀斯特地貌與淡水蟹類物種的分布方式及物種多樣性間可能存在的內(nèi)在規(guī)律。3.測(cè)定中國(guó)西南喀斯特地貌溪蟹科下7屬7種淡水蟹線粒體基因組,并進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析以及比較線粒體基因組學(xué)研究,嘗試?yán)迩逯袊?guó)西南喀斯特地貌淡水蟹類的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,推演該地域淡水蟹類屬、種可能的分化年代。方法:1.基于對(duì)西南喀斯特地域淡水蟹類形態(tài)分類及其分子親緣的初步研究,樣點(diǎn)的選擇以淡水蟹類“種”為基準(zhǔn),依據(jù)喀斯特地貌特征來(lái)確定標(biāo)本的具體采集地點(diǎn),作者與研究團(tuán)隊(duì)按照課題計(jì)劃前往擬定的地點(diǎn)進(jìn)行標(biāo)本采集,并統(tǒng)計(jì)研究室標(biāo)本庫(kù)歷年已在西南喀斯特地域采集保存的淡水蟹類標(biāo)本一同用于本項(xiàng)目研究。對(duì)所選取的標(biāo)本在與模式標(biāo)本比對(duì)的基礎(chǔ)上進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定,記錄標(biāo)本采集樣點(diǎn)的經(jīng)緯度等,并對(duì)其是否處于喀...
【文章頁(yè)數(shù)】:123 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 中國(guó)西南喀斯特地域特征概況
1.1.1 西南喀斯特的分布及特征
1.1.2 生物喀斯特
1.1.3 西南喀斯特的生物多樣性
1.2 中國(guó)西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性
1.3 中國(guó)大陸淡水蟹類的研究進(jìn)展
1.3.1 形態(tài)學(xué)方面的分類研究
1.3.2 分子水平的分類研究
1.3.3 短尾類系統(tǒng)發(fā)生分析概況
1.3.4 線粒體基因組在短尾類中的研究概況
1.4 地理信息系統(tǒng)(GIS)研究概況
第二章 中國(guó)西南喀斯特淡水蟹類的分布格局的探討及地理信息系統(tǒng)(GIS)的構(gòu)建與初步應(yīng)用
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 樣本采集與保存
2.1.2 形態(tài)學(xué)分類與鑒定
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器和設(shè)備
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 DNA的提取
2.2.2 PCR擴(kuò)增
2.2.3 數(shù)據(jù)選擇與分析
2.2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.2.5 地理信息系統(tǒng)分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 形態(tài)學(xué)分類鑒定
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.3.3 基于地理信息系統(tǒng)分析淡水蟹類的分布格局
2.4 討論
第三章 中國(guó)西南喀斯特地域7屬7種淡水蟹線粒體全基因組分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 測(cè)序、組裝和注釋線粒體基因組
3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.2.3 分歧時(shí)間估算
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 凱里龍溪蟹Longpotamon kenliense
3.3.2 茂蘭中國(guó)溪蟹Chinapotamon maolanense
3.3.3 相似非擬溪蟹Aparapotamon similium
3.3.4 鏡頭華石蟹Sinolapotamon patellifer
3.3.5 興安內(nèi)陸溪蟹Neilupotamon xinganense
3.3.6 靈川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense
3.3.7 寬腹小石蟹安順亞種Tenuilapotamon latilum anshunense
3.3.8 線粒體基因組組成及分析
3.3.9 基因重排分析
3.3.10 系統(tǒng)發(fā)生的分析
3.3.11 分歧時(shí)間估算
3.4 討論
第四章 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
參考文獻(xiàn)
本文編號(hào):3810058
【文章頁(yè)數(shù)】:123 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 中國(guó)西南喀斯特地域特征概況
1.1.1 西南喀斯特的分布及特征
1.1.2 生物喀斯特
1.1.3 西南喀斯特的生物多樣性
1.2 中國(guó)西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性
1.3 中國(guó)大陸淡水蟹類的研究進(jìn)展
1.3.1 形態(tài)學(xué)方面的分類研究
1.3.2 分子水平的分類研究
1.3.3 短尾類系統(tǒng)發(fā)生分析概況
1.3.4 線粒體基因組在短尾類中的研究概況
1.4 地理信息系統(tǒng)(GIS)研究概況
第二章 中國(guó)西南喀斯特淡水蟹類的分布格局的探討及地理信息系統(tǒng)(GIS)的構(gòu)建與初步應(yīng)用
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 樣本采集與保存
2.1.2 形態(tài)學(xué)分類與鑒定
2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器和設(shè)備
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 DNA的提取
2.2.2 PCR擴(kuò)增
2.2.3 數(shù)據(jù)選擇與分析
2.2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.2.5 地理信息系統(tǒng)分析
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 形態(tài)學(xué)分類鑒定
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.3.3 基于地理信息系統(tǒng)分析淡水蟹類的分布格局
2.4 討論
第三章 中國(guó)西南喀斯特地域7屬7種淡水蟹線粒體全基因組分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 測(cè)序、組裝和注釋線粒體基因組
3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.2.3 分歧時(shí)間估算
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 凱里龍溪蟹Longpotamon kenliense
3.3.2 茂蘭中國(guó)溪蟹Chinapotamon maolanense
3.3.3 相似非擬溪蟹Aparapotamon similium
3.3.4 鏡頭華石蟹Sinolapotamon patellifer
3.3.5 興安內(nèi)陸溪蟹Neilupotamon xinganense
3.3.6 靈川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense
3.3.7 寬腹小石蟹安順亞種Tenuilapotamon latilum anshunense
3.3.8 線粒體基因組組成及分析
3.3.9 基因重排分析
3.3.10 系統(tǒng)發(fā)生的分析
3.3.11 分歧時(shí)間估算
3.4 討論
第四章 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
參考文獻(xiàn)
本文編號(hào):3810058
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