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宏基因組技術(shù)在抗生素抗性基因篩選中的初步研究

發(fā)布時間:2023-03-23 18:36
  【背景】抗生素被過度濫用的情況十分普遍,細(xì)菌耐藥問題越漸成為人們的焦點(diǎn)!灸康摹繕(gòu)建廣東省珠江淇澳島紅樹林濕地土壤宏基因組文庫并進(jìn)行抗生素抗性基因的功能篩選!痉椒ā坎杉寥罉(biāo)本并提取總DNA構(gòu)建宏基因組文庫,利用梯度平板篩選法篩選新型抗生素抗性基因,對篩選到的基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。【結(jié)果】構(gòu)建了片段多樣性良好、陽性克隆率高、插入片段平均長度為5kb的紅樹林土壤宏基因組文庫。篩選獲得硫酸鏈霉素抗性基因strr719,并對新基因strr719進(jìn)行了生物信息學(xué)分析!窘Y(jié)論】建立起一種可對生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行潛在抗生素抗性基因污染的健康評估手段,為今后對抗生素抗性基因這種新型的污染物進(jìn)行進(jìn)一步的研究奠定了一定的基礎(chǔ),有助于對抗生素抗性基因污染問題的解決。

【文章頁數(shù)】:3 頁

【文章目錄】:
1 背景
2 材料與方法
    2.1 樣品、材料來源
    2.2 土壤基因組的提取
    2.3 宏基因組文庫的構(gòu)建和保存
    2.4 抗生素抗性基因ARGs的篩選
    2.5 測序和序列分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 土壤DNA的提取與純化
    3.2 宏基因組文庫的質(zhì)量驗(yàn)證
    3.3 抗生素抗性基因ARGs的篩選
    3.4 硫酸鏈霉素抗性基因的生物信息學(xué)初步分析
4 結(jié)論



本文編號:3768530

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