窄吉丁亞科分子系統(tǒng)發(fā)育研究
發(fā)布時間:2023-03-19 11:49
窄吉丁亞科Agrilinae隸屬于鞘翅目Coleoptera吉丁總科Buprestoidea吉丁科Buprestidae,已知4族23亞族200屬。前人對窄吉丁亞科的研究主要集中在傳統(tǒng)分類學研究,涉及分子系統(tǒng)發(fā)育研究的報道較少。目前,窄吉丁亞科的分類系統(tǒng)存在較多爭議,且窄吉丁亞科系統(tǒng)發(fā)育關系不清楚。本文首次對窄吉丁亞科分子系統(tǒng)學進行研究,選用了吉丁亞科Bupretinae 4屬4種和筒吉丁亞科Polycestinae 1屬1種作為外群,窄吉丁亞科4族13亞族20屬69種作為內群,基于線粒體基因和核基因聯(lián)合序列(COI、Cytb、18Sr DNA和28Sr DNA)運用最大似然法和貝葉斯法構建系統(tǒng)發(fā)育樹,對窄吉丁亞科內的族級系統(tǒng)進行了探討。本文通過測序獲得窄吉丁亞科COI基因序列51條、Cytb基因序列57條、18Sr DNA序列41條和28Sr DNA序列31條,共計180條序列。研究發(fā)現(xiàn),四基因序列聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹比三基因序列聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹的拓撲結構更穩(wěn)定,置信度更高,貝葉斯樹(BI)和最大似然樹(ML)更相似。在所構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,BI樹和ML樹基部拓撲結構不同,多數端...
【文章頁數】:73 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 窄吉丁亞科昆蟲概述
1.1.1 窄吉丁亞科昆蟲形態(tài)特征
1.1.2 窄吉丁亞科高級階元分類系統(tǒng)發(fā)展
1.2 分子標記的運用
1.2.1 分子系統(tǒng)學概述
1.2.2 線粒體DNA(mt DNA)
1.2.3 細胞核DNA(r DNA)
1.3 研究進展
1.4 存在問題及研究目的和意義
1.4.1 存在的問題
1.4.2 本研究的目的和意義
第2章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 標本收集和保存
2.1.2 主要實驗儀器和試劑
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 引物設計與合成
2.2.3 不同基因片段的PCR擴增與測序
2.3 數據處理和分析
2.3.1 測序數據的處理和序列拼接及對比
2.3.2 序列的組成分析
2.3.3 遺傳距離分析
2.3.4 飽和性分析
2.3.5 模型選擇
2.3.6 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建
2.3.7 系統(tǒng)發(fā)育樹的處理
第3章 結果與分析
3.1 序列特征分析
3.1.1 序列組成成分分析
3.1.2 遺傳距離分析
3.1.3 堿基替換飽和性分析
3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.1 三基因聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.2.2 基于18Sr DNA、28Sr DNA、COI和 Cytb四基因聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.3 不同方法所構建的系統(tǒng)發(fā)育樹的比較
第4章 討論
4.1 窄吉丁亞科的單系性
4.2 窄吉丁亞科族間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3 窄吉丁亞科部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.1 潛吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.2 頭吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.3 紋吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.4 窄吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
第5章 結論
第6章 本文的創(chuàng)新點
第7章 本文的不足
第8章 展望
參考文獻
附錄
致謝
在學期間的科研情況
本文編號:3765197
【文章頁數】:73 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 窄吉丁亞科昆蟲概述
1.1.1 窄吉丁亞科昆蟲形態(tài)特征
1.1.2 窄吉丁亞科高級階元分類系統(tǒng)發(fā)展
1.2 分子標記的運用
1.2.1 分子系統(tǒng)學概述
1.2.2 線粒體DNA(mt DNA)
1.2.3 細胞核DNA(r DNA)
1.3 研究進展
1.4 存在問題及研究目的和意義
1.4.1 存在的問題
1.4.2 本研究的目的和意義
第2章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 標本收集和保存
2.1.2 主要實驗儀器和試劑
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 引物設計與合成
2.2.3 不同基因片段的PCR擴增與測序
2.3 數據處理和分析
2.3.1 測序數據的處理和序列拼接及對比
2.3.2 序列的組成分析
2.3.3 遺傳距離分析
2.3.4 飽和性分析
2.3.5 模型選擇
2.3.6 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建
2.3.7 系統(tǒng)發(fā)育樹的處理
第3章 結果與分析
3.1 序列特征分析
3.1.1 序列組成成分分析
3.1.2 遺傳距離分析
3.1.3 堿基替換飽和性分析
3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.1 三基因聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.2.2 基于18Sr DNA、28Sr DNA、COI和 Cytb四基因聯(lián)合構建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.3 不同方法所構建的系統(tǒng)發(fā)育樹的比較
第4章 討論
4.1 窄吉丁亞科的單系性
4.2 窄吉丁亞科族間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3 窄吉丁亞科部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.1 潛吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.2 頭吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.3 紋吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
4.3.4 窄吉丁族部分亞族間、屬間的系統(tǒng)發(fā)育關系
第5章 結論
第6章 本文的創(chuàng)新點
第7章 本文的不足
第8章 展望
參考文獻
附錄
致謝
在學期間的科研情況
本文編號:3765197
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教材專著