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甜瓜GRF轉(zhuǎn)錄因子的全基因組鑒定和分析

發(fā)布時(shí)間:2023-02-05 17:42
  生長(zhǎng)調(diào)節(jié)因子(growth-regulating factor, GRF)在調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)和發(fā)育方面起到重要的調(diào)控作用,在擬南芥中研究發(fā)現(xiàn),GRF家族蛋白具有正向調(diào)控莖和葉生長(zhǎng)發(fā)育的生物學(xué)功能,并且不同植物間、同一物種的不同成員間其生物學(xué)功能又存各異。本研究應(yīng)用生物信息學(xué)方法,在甜瓜全基因組中鑒定得到7個(gè)GRF家族成員,命名為CmGRF1~CmGRF7,對(duì)理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、保守基序及進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果表明,CmGRF基因均含有3~4個(gè)不同的內(nèi)含子,進(jìn)化分析將GRF蛋白分為2種不同的類型(ClassⅠ, ClassⅡ),甜瓜與黃瓜的GRF蛋白聚類在一起并且在同一組聚類中具有非常高的自舉值,WRC和QLQ是GRF蛋白特有的保守基序,在所有的預(yù)測(cè)蛋白中鑒定得到。通過(guò)甜瓜GRFs基因家族的系統(tǒng)分析,為進(jìn)一步闡明甜瓜中GRF蛋白結(jié)構(gòu)及功能提供科學(xué)依據(jù)和有價(jià)值的資料。

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 甜瓜GRFs基因家族成員的鑒定
    1.2 甜瓜GRF基因的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)的分析
    1.3 甜瓜GRFs基因家族的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)和基序分析
    1.4 GFR家族基因表達(dá)譜構(gòu)建結(jié)果與分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 甜瓜GRF家族基因的搜索及鑒定
    3.2 甜瓜GRF基因的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)的分析
    3.3 甜瓜GRF家族基因的進(jìn)化及基序分析
    3.4 甜瓜GRF家族基因的表達(dá)譜構(gòu)建
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào):3735406

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