利用Illumina和Pacbio測(cè)序技術(shù)對(duì)揚(yáng)子鰓蛭（Ozobranchus jantseanus）線粒體基因組全序列進(jìn)行測(cè)序及注釋,并與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中蛭綱（Hirudinea）其他物種的線粒體全序列的排列方式和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了比較,以確定其系統(tǒng)學(xué)地位.結(jié)果顯示:獲得的線粒體基因組序列長(zhǎng)度為14 868 bp,蛋白編碼基因存在2種起始密碼子,分別為ATG和ATT;終止密碼子共有4種,分別為TAA,TAG,TA和T;蛭綱10個(gè)物種的線粒體基因組全序列基因排序可分為2種類型,其差異表現(xiàn)在tRNAs的互換和長(zhǎng)非編碼區(qū)的長(zhǎng)度的不同;揚(yáng)子鰓蛭所屬的吻蛭目（Rhynchobdellida）均為b型,絕大部分無(wú)吻蛭目（Arhynchobdellida）的排列方式為a型.基于蛭綱物種的13個(gè)蛋白編碼基因（PCGs）的Neighbor-Joining（NJ）樹進(jìn)化分析顯示,揚(yáng)子鰓蛭與其他吻蛭目物種聚類. 

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【部分圖文】：

圖１ＰａｃＢｉｏＳｕｂｒｅａｄｓ的長(zhǎng)度分布Ｆｉｇ．１ＬｅｎｇｔｈＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＰａｃＢｉｏＳｕｂｒｅａｄｓ

圖３蛭綱線粒體基因組基因序列差異Ｆｉｇ．３ＤｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓｉｎＧｅｎｅＯｒｄｅｒｉｎｔｈｅＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｓｆｒｏｍｔｈｅＨｉｒｕｄｉｎｅａ

圖４基于線粒體１３個(gè)蛋白編碼基因ＤＮＡ序列構(gòu)建的蛭綱物種的ＮＪ樹Ｆｉｇ．４ＮＪＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃＴｒｅｅｏｆＨｉｒｕｄｉｎｅａＳｐｅｃｉｅｓＢａｓｅｄｏｎ１３ＰＣＧｓ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]線粒體基因組的遺傳與進(jìn)化研究進(jìn)展[J]. 潘寶平,卜文俊.  生物學(xué)通報(bào). 2005(08)
[2]動(dòng)物線粒體假基因的識(shí)別及其在進(jìn)化生物學(xué)中的應(yīng)用[J]. 王繼文.  動(dòng)物學(xué)雜志. 2004(03)
[3]烏龜寄生性鰓蛭病的防治探討[J]. 李良華,邊書京,蔡軍,陳定貴,王維龍,李冬泉.  動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué). 2002(05)

碩士論文
[1]無(wú)吻蛭目五種水蛭線粒體基因組注釋分析[D]. 徐云玲.湖北中醫(yī)藥大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3730646