目前,世界衛(wèi)生組織已將環(huán)境雌激素列為第1類(lèi)致癌物,由其造成的污染已經(jīng)成為全球性的第三大環(huán)境問(wèn)題,嚴(yán)重威脅人類(lèi)健康和生態(tài)安全。治理雌激素污染迫在眉睫,也日益成為社會(huì)關(guān)注的熱點(diǎn)問(wèn)題。利用微生物降解代謝過(guò)程進(jìn)行雌激素生物降解,是去除環(huán)境中雌激素最環(huán)保、最經(jīng)濟(jì)的有效方法,在雌激素污染治理中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,日益受到人們的重視。本文從某生產(chǎn)雌激素藥廠附近土壤樣品中篩選分離得到一株能夠高效降解類(lèi)固醇雌激素的菌株,命名為DH-S01。形態(tài)學(xué)觀察顯示,菌落呈圓形,邊緣整齊,有光澤,呈橙紅色或紫紅色,菌體易挑起,呈桿狀,無(wú)鞭毛。生理生化實(shí)驗(yàn)確定為革蘭氏染色陰性細(xì)菌,能夠代謝葡萄糖、麥芽糖、蔗糖等。結(jié)合分子生物學(xué)鑒定,確定菌株DH-S01為沙雷氏菌（Serratia）。降解實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,菌株DH-S01能夠利用類(lèi)固醇雌激素雌酮和17β-雌二醇為唯一碳源進(jìn)行生長(zhǎng)傳代培養(yǎng),實(shí)驗(yàn)周期內(nèi)的雌酮和17β-雌二醇的生物降解率都在90%以上。為了深入了解該菌株的基因組結(jié)構(gòu)與功能信息和其雌激素降解機(jī)制,基于PacBio測(cè)序平臺(tái),對(duì)菌株進(jìn)行全基因組測(cè)序及分析。菌株DH-S01基因組由一個(gè)大小為5256558bp的環(huán)狀染色... 

【文章頁(yè)數(shù)】：75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 沙雷氏菌
    1.2 類(lèi)固醇雌激素
    1.3 微生物基因組學(xué)
    1.4 研究?jī)?nèi)容與意義
    1.5 技術(shù)路線
第二章 降解菌的分離及降解特性研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器和藥品
        2.1.2 樣品采集和培養(yǎng)基配制
        2.1.3 菌株的分離
        2.1.4 菌株生長(zhǎng)曲線的繪制
        2.1.5 檢測(cè)方法與標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
        2.1.6 菌株的形態(tài)學(xué)分析
        2.1.7 菌株的生理生化分析
        2.1.8 菌株的分子生物學(xué)分析
        2.1.9 菌株生長(zhǎng)降解條件的優(yōu)化
        2.1.10 類(lèi)固醇雌激素降解實(shí)驗(yàn)
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 菌株的鑒定與保藏
        2.2.2 DH-S01生長(zhǎng)與類(lèi)固醇雌激素降解
    2.3 本章小結(jié)
第三章 DH-S01全基因組測(cè)序及分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器
        3.1.2 DNA提取與檢測(cè)
        3.1.3 全基因組測(cè)序和組裝
        3.1.4 全基因組基因注釋
        3.1.5 平均核苷酸相似性分析
    3.2 結(jié)果和討論
        3.2.1 提取DNA及檢測(cè)
        3.2.2 測(cè)序質(zhì)控與組裝
        3.2.3 基因組組分分析
        3.2.4 DH-S01平均核苷酸相似性分析
        3.2.5 基因功能注釋
    3.3 本章小結(jié)
第四章 DH-S01類(lèi)固醇雌激素降解相關(guān)基因研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 應(yīng)用數(shù)據(jù)庫(kù)
        4.1.2 實(shí)驗(yàn)材料、試劑和儀器
        4.1.3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
        4.1.4 反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 類(lèi)固醇雌激素降解相關(guān)基因注釋
        4.2.2 類(lèi)固醇雌激素降解相關(guān)基因PCR分析
        4.2.3 類(lèi)固醇雌激素降解相關(guān)基因RT-PCR分析
    4.3 本章小結(jié)
第五章 DH-S01比較基因組學(xué)分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.2 共線性分析
        5.1.3 共有基因和特有基因分析
    5.2 結(jié)果與討論
        5.2.1 基因組共線性分析
        5.2.2 基因組Venn圖分析
    5.3 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
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本文編號(hào)：3690861