共生微生物在宿主的營(yíng)養(yǎng)攝入、生長(zhǎng)發(fā)育、個(gè)體健康和疾病免疫中起著重要作用。并且,在近幾年的研究中共生微生物（如腸道、皮膚微生物等）與環(huán)境因素（如海拔、溫度）之間潛在的協(xié)同進(jìn)化是微生物生態(tài)學(xué)的基本問(wèn)題之一。研究指出,不同海拔下動(dòng)物共生微生物（體表和腸道微生物）在菌群組成以及結(jié)構(gòu)上出現(xiàn)明顯差異。此外,海拔還可以降低宿主的組成多樣性。目前的研究主要側(cè)重獸類(lèi)、哺乳類(lèi)和鳥(niǎo)類(lèi),而關(guān)于兩棲類(lèi)的研究偏少。鑒于這個(gè)有趣的科學(xué)問(wèn)題（宿主及其共生微生物的協(xié)同進(jìn)化）,我們利用高通量測(cè)序技術(shù)（細(xì)菌16S核糖體基因的MISEQ技術(shù)）對(duì)不同海拔地區(qū)的野生兩棲類(lèi)的共生微生物（體表和腸道）進(jìn)行了研究,以期提供一些基礎(chǔ)資料,豐富該研究?jī)?nèi)容。（1）在低海拔地區(qū),我們于2018年5月份在樂(lè)山選取了7個(gè)采樣位點(diǎn),海拔范圍為:360-446米,采集兩棲動(dòng)物5種:中華蟾蜍（Bufo gargarizans）、飾紋姬蛙（Microhyla fissipes）、黑斑側(cè)褶蛙（Pelophylax nigromaculata）、峨眉林蛙（Rana omeimontis）和澤陸蛙（Fejervarya limnocharis）,共獲得155份... 

【文章來(lái)源】：南京師范大學(xué)江蘇省211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：71 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 兩棲動(dòng)物共生微生物的研究概述
    1.2 共生微生物研究技術(shù)—16S rRNA分析
    1.3 影響共生微生物的因素
        1.3.1 宿主的系統(tǒng)發(fā)生地位
        1.3.2 宿主的食物組成
        1.3.3 棲息環(huán)境
        1.3.4 海拔
        1.3.5 其他因素
    1.4 共生微生物與功能
        1.4.1 共生微生物與疾病免疫
        1.4.2 共生微生物與環(huán)境適應(yīng)
    1.5 本研究的目的與意義
第2章 低海拔兩棲動(dòng)物共生微生物(體表和腸道微生物)的多樣性分析
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 微生物樣本采集
        2.2.2 DNA提取
        2.2.3 16S rRNA基因測(cè)序和多樣性分析
    2.3 16S rRNA多樣性分析結(jié)果
        2.3.1 樣品覆蓋度
        2.3.2 同一地點(diǎn)不同物種下共生微生物組成與比較
        2.3.3 同一物種不同地點(diǎn)下共生微生物組成與結(jié)構(gòu)比較
        2.3.4 不同物種下共生微生物α多樣性分析
        2.3.5 不同地點(diǎn)不同物種下共生微生物β多樣性分析
    2.4 討論
        2.4.1 宿主系統(tǒng)發(fā)生地位與兩棲動(dòng)物共生微生物關(guān)聯(lián)分析
        2.4.2 棲息環(huán)境與兩棲動(dòng)物共生微生物關(guān)聯(lián)分析
第3章 高海拔兩棲動(dòng)物共生微生物(體表和腸道微生物)的多樣性分析
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 微生物樣本采集與前處理
        3.2.2 DNA提取
        3.2.3 16S rRNA基因測(cè)序和多樣性分析
        3.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    3.3 16S rRNA多樣性分析結(jié)果
        3.3.1 樣品覆蓋度
        3.3.2 高海拔兩棲物種共生微生物組成與比較
        3.3.3 高海拔兩棲物種共生微生物α多樣性分析
        3.3.4 高海拔兩棲物種共生微生物β多樣性分析
    3.4 討論
        3.4.1 高海拔兩棲動(dòng)物共生微生物組成與環(huán)境適應(yīng)
        3.4.2 宿主系統(tǒng)發(fā)生地位對(duì)兩棲動(dòng)物共生微生物多樣性的影響
第4章 海拔對(duì)兩棲動(dòng)物共生微生物(體表和腸道微生物)的影響
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 微生物樣本采集與前處理
        4.2.2 DNA提取
        4.2.3 16S rRNA基因測(cè)序和多樣性分析
        4.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    4.3 16S rRNA多樣性分析結(jié)果
        4.3.1 樣品覆蓋度
        4.3.2 不同兩棲動(dòng)物共生微生物變化
        4.3.3 高低海拔兩棲物種共生微生物多樣性分析
        4.3.4 共生微生物表型預(yù)測(cè)
        4.3.5 高低海拔兩棲物種共生微生物與環(huán)境微生物的關(guān)聯(lián)性
    4.4 討論
        4.4.1 特定的共生微生物群與高原環(huán)境的選擇性
        4.4.2 高海拔環(huán)境可能會(huì)降低共生微生物群落的α多樣性和β多樣性
        4.4.3 共生菌的特殊表型可能反映了高原環(huán)境的適應(yīng)性
        4.4.4 體表和腸道微生物:生活在不同的生態(tài)位
結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
在讀期間已(待)發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]林蛙屬3物種皮膚的組織結(jié)構(gòu)比較[J]. 米志平,廖文波.  動(dòng)物學(xué)雜志. 2016(05)
[4]中國(guó)兩棲動(dòng)物受威脅現(xiàn)狀評(píng)估[J]. 江建平,謝鋒,臧春鑫,蔡蕾,李成,王斌,李家堂,王杰,胡軍華,王燕,劉炯宇.  生物多樣性. 2016(05)
[5]四種水體微生物總DNA提取方法的比較[J]. 賴(lài)樹(shù)錦,郭佳,陶新園,李陽(yáng),楊振飛,陳鑫,李曉華.  湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(10)
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[7]金線側(cè)褶蛙和黑斑側(cè)褶蛙皮膚顯微結(jié)構(gòu)[J]. 王麗,徐珂,李晏宇,班悅,魏博,崔蘊(yùn)博,陳曉虹.  河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(06)
[8]林蛙腸道中乳酸菌的分離及鑒定[J]. 王開(kāi)艷,朱明秋,李艷茹,張宗植,周末,白雪梅,李太元.  水產(chǎn)科學(xué). 2009(08)
[9]甘孜和涼山地區(qū)兩棲類(lèi)和爬行類(lèi)動(dòng)物多樣性研究[J]. 謝偉,樊華,陳俊華,隆廷倫,劉興良,蔡小虎,何亞平,何飛,劉偉,張綿躍.  四川林業(yè)科技. 2009(03)
[10]基于16S RNA序列的哺乳仔豬和斷奶仔豬回腸微生物多樣性分析（英文）[J]. 王升平,柏美娟,孔祥峰,吳信,黃瑞林,李鐵軍,印遇龍.  Animal Husbandry and Feed Science. 2009(Z1)

博士論文
[1]高原土著動(dòng)物適應(yīng)性進(jìn)化分子機(jī)制探討[D]. 周太成.云南大學(xué) 2015
[2]藏雞高原低氧適應(yīng)生理機(jī)制及其雜交利用研究[D]. 張浩.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]四川省樂(lè)山市生態(tài)環(huán)境遙感動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)[D]. 漆小英.成都理工大學(xué) 2008
[2]若爾蓋濕地3種兩棲類(lèi)的種間競(jìng)爭(zhēng)及畜牧業(yè)對(duì)其食性的影響[D]. 張晉東.中國(guó)科學(xué)院研究生院（成都生物研究所） 2006



本文編號(hào)：3641158