樟葉越桔CYP450基因片段克隆與家族分析
發(fā)布時間:2022-02-23 02:08
廣泛存在于生物體內的CYP450具有參與多種內源物質的新陳代謝和解除外源化學物質毒害作用的功能。本研究基于RNA-Seq數據,應用RT-PCR技術首次從樟葉越桔中克隆獲得21個CYP450基因cDNA片段。應用生物信息學技術對21個樟葉越桔CYP450基因進行相似性分析、功能注釋、家族分類以及聚類分析,除2個基因的家族分類不明確外,其余所有基因被分屬于10個不同的CYP450家族中,分別為:CYP71、CYP72、CYP76、CYP81、CYP82、CYP86、CYP94、CYP97、CYP734和CYP735。推測有10個基因參與脂肪族、芳香族碳的羥基化,4個基因參與植物激素細胞分裂素的合成與降解,3個基因參與脂肪酸的羥基化,2個基因參與萜類化合物的合成。而KEGG分析結果顯示2個基因家族未知的樟葉越桔CYP450基因可能參與了K00327途徑。21個樟葉越桔CYP450基因能成功地與24個擬南芥CYP450基因聚類到一起。值得關注的是有2個樟葉越桔CYP450基因CL75.Contig12A(9)和Unigene225702A(14)被歸...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(02)北大核心CSCD
【文章頁數】:11 頁
【文章目錄】:
1 結果與分析
1.1 總RNA提取
1.2 樟葉越桔CYP450基因與引物設計
1.3 樟葉越桔CYP450基因克隆
1.4 序列同源性比對與分析
1.5 樟葉越桔CYP450基因功能注釋與家族分類
1.6 樟葉越桔CYP450家族聚類分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 樟葉越桔CYP450基因挖掘與引物設計
3.4 樟葉越桔CYP450基因克隆
3.5 序列分析與家族聚類
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青海湖裸鯉CYP17a2基因的克隆及表達分析[J]. 張霞,衛(wèi)福磊,張婭,衛(wèi)唯,朱福祥,王玉晴,栗瑞紅,韓步鷹,劉小紅,千康康,吳君,朱世海,李長忠. 基因組學與應用生物學. 2018(05)
[2]刺五加P450基因時空表達差異及與皂苷含量的相關性分析[J]. 吳鵬,谷俊濤,修樂山,邢朝斌. 河北農業(yè)大學學報. 2014(03)
[3]家蠶細胞色素P450基因的研究進展[J]. 艾均文,薛宏,何行健,孟繁利,朱勇,向仲懷. 昆蟲學報. 2011(08)
[4]甜菊醇糖苷生物合成途徑關鍵酶基因KA13H的克隆及序列分析[J]. 郭書巧,束紅梅,鄭卿,倪萬潮. 基因組學與應用生物學. 2010(05)
[5]植物細胞色素P450基因與功能研究進展[J]. 賀麗虹,趙淑娟,胡之璧. 藥物生物技術. 2008(02)
[6]細胞色素P450基因及其在植物改良中的應用[J]. 楊致榮,毛雪,楊致芬,李潤植. 遺傳. 2003(02)
本文編號:3640652
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(02)北大核心CSCD
【文章頁數】:11 頁
【文章目錄】:
1 結果與分析
1.1 總RNA提取
1.2 樟葉越桔CYP450基因與引物設計
1.3 樟葉越桔CYP450基因克隆
1.4 序列同源性比對與分析
1.5 樟葉越桔CYP450基因功能注釋與家族分類
1.6 樟葉越桔CYP450家族聚類分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 樟葉越桔CYP450基因挖掘與引物設計
3.4 樟葉越桔CYP450基因克隆
3.5 序列分析與家族聚類
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青海湖裸鯉CYP17a2基因的克隆及表達分析[J]. 張霞,衛(wèi)福磊,張婭,衛(wèi)唯,朱福祥,王玉晴,栗瑞紅,韓步鷹,劉小紅,千康康,吳君,朱世海,李長忠. 基因組學與應用生物學. 2018(05)
[2]刺五加P450基因時空表達差異及與皂苷含量的相關性分析[J]. 吳鵬,谷俊濤,修樂山,邢朝斌. 河北農業(yè)大學學報. 2014(03)
[3]家蠶細胞色素P450基因的研究進展[J]. 艾均文,薛宏,何行健,孟繁利,朱勇,向仲懷. 昆蟲學報. 2011(08)
[4]甜菊醇糖苷生物合成途徑關鍵酶基因KA13H的克隆及序列分析[J]. 郭書巧,束紅梅,鄭卿,倪萬潮. 基因組學與應用生物學. 2010(05)
[5]植物細胞色素P450基因與功能研究進展[J]. 賀麗虹,趙淑娟,胡之璧. 藥物生物技術. 2008(02)
[6]細胞色素P450基因及其在植物改良中的應用[J]. 楊致榮,毛雪,楊致芬,李潤植. 遺傳. 2003(02)
本文編號:3640652
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