鈣依賴型蛋白激酶（calcium-dependent protein kinases,CDPKs）是高等植物細(xì)胞中重要的鈣離子信號受體,在植物抵御逆境脅迫過程中發(fā)揮著重要作用。該研究以地黃為材料,設(shè)計特異引物,克隆地黃RgCDPK基因全長序列,并使用在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析,采用熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行組織特異性分析。結(jié)果表明:（1）克隆得到的地黃CDPK基因長度為1 770 bp,編碼589個氨基酸;（2）多序列比對和結(jié)構(gòu)分析顯示,該蛋白含有鈣依賴蛋白激酶典型結(jié)構(gòu)域絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶區(qū)及EF-手性區(qū)。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明其與擬南芥AtCDPK28的同源關(guān)系最近,因此命名為RgCDPK（Genbank登錄號為MT024235）;（3）組織特異性分析得出RgCDPK在地黃葉中表達(dá)量最高。該研究成功克隆出地黃CDPK基因,且發(fā)現(xiàn)該基因在不同組織中的表達(dá)存在差異,為以后深入研究CDPK在地黃連作障礙等生物及非生物脅迫中的分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。 

【文章來源】：廣西植物. 2020,40(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

Rg CDPK基因克隆

使用NPSA server在線軟件預(yù)測Rg CDPK的二級結(jié)構(gòu)，結(jié)果表明Rg CDPK蛋白由41.94%的α-螺旋、12.05%的延伸鏈、6.62%的β-轉(zhuǎn)角和39.39%的無規(guī)卷曲組成。使用Swiss-model在線軟件預(yù)測地黃Rg CDPK的三級結(jié)構(gòu)。同源建模結(jié)果顯示(圖2),Rg CDPK與擬南芥CDPK (SMTL ID:3q5i.1)相似度為33.94%，具有較高可信度(>30%)。圖3 Rg CDPK蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹

圖2 Rg CDPK蛋白的三級結(jié)構(gòu)通過在線軟件對地黃Rg CDPK蛋白進(jìn)行磷酸化位點(diǎn)預(yù)測，結(jié)果顯示，Rg CDPK蛋白整個多肽鏈有71個磷酸化位點(diǎn)(>0.5)，其中，絲氨酸42個，蘇氨酸23個，酪氨酸6個。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]蔬菜連作障礙原因與防治措施[J]. 王剛,景煒明,陳永利.  西北園藝(綜合). 2019(04)
[2]甘藍(lán)SI相關(guān)基因BoCDPK14的克隆與分析[J]. 白曉璟,廉小平,王玉奎,張賀翠,劉倩瑩,左同鴻,張以忠,謝琴琴,胡燈科,任雪松,曾靜,羅紹蘭,蒲敏,朱利泉.  作物學(xué)報. 2019(12)
[3]茶樹鈣依賴性蛋白激酶基因CsCDPK17的鑒定及表達(dá)分析[J]. 雷蕾,王璐,姚麗娜,郝心愿,曾建明,丁長慶,王新超,楊亞軍.  茶葉科學(xué). 2019(03)
[4]地黃鈣信號體系相關(guān)基因的鑒定及其在連作條件下響應(yīng)特征分析[J]. 楊楚韻,李鑫宇,李明杰,馮法節(jié),古力,張寶,陳淑強(qiáng),陳愛國,張重義.  藥學(xué)學(xué)報. 2017(12)
[5]鐵皮石斛DoCDPK6基因及啟動子的克隆與表達(dá)分析[J]. 盛況,高燕會,斯金平,朱玉球,劉京晶.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2017(04)
[6]過表達(dá)天山雪蓮SikCDPK1基因提高轉(zhuǎn)基因煙草耐低溫能力的機(jī)制初探[J]. 田曉涵,龐學(xué)兵,祝建波,朱新霞.  中國煙草學(xué)報. 2016(06)
[7]地黃藥理作用和臨床應(yīng)用概況[J]. 李慧芬.  藥學(xué)研究. 2014(06)
[8]地黃連作障礙中鈣信號系統(tǒng)的異常變化分析[J]. 郭冠瑛,李明杰,王鵬飛,王豐青,何華勤,李娟,鄭紅艷,陳新建,張重義.  中國中藥雜志. 2013(10)
[9]龍血樹DCDPK2基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 張浩,蔡文偉,張樹珍,楊學(xué),劉琳,楊本鵬.  熱帶作物學(xué)報. 2010(07)
[10]地黃連作障礙因素及解除措施研究[J]. 劉紅彥,王飛,王永平,魯傳濤.  華北農(nóng)學(xué)報. 2006(04)

碩士論文
[1]玉米CDPK基因家族的克隆、表達(dá)分析及ZmCPK12功能初探[D]. 張毓露.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]小麥基因組中鈣依賴型蛋白激酶家族的生物信息學(xué)分析[D]. 王晨.華中科技大學(xué) 2008



本文編號：3586017