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中國象鼻溞屬分子生物地理學研究

發(fā)布時間:2022-01-03 15:56
  象鼻溞(Bosmina)是淡水生態(tài)系統(tǒng)中重要的組成部分。作為一個理想的,象鼻溞已廣泛應用于生態(tài)學、進化生物學、生物毒理學、群體遺傳學、生物地理學以及基因組學等學科的研究中。中國在世界上具有重要的生物地理學位置,但是該區(qū)域幾乎沒有象鼻溞的分類學、生物地理學、進化生物學以及群體遺傳學相關報道,故本論文旨在進行中國大陸象鼻溞的分子系統(tǒng)學鑒定以及生物地理學的初步研究,進而了解歷史因子和環(huán)境因子對象鼻溞的影響。得出以下結論:1、通過測定象鼻溞核基因ITS基因序列,對中國大陸地區(qū)35個水體內(nèi)的象鼻溞進行分子系統(tǒng)學鑒定,揭示了中國象鼻溞的地理分布概況。本次調(diào)查檢測到兩個主要物種:一個是東亞地區(qū)特有的B.fatalis,另一個是在全北極廣泛分布的B.longirostris。除此以外,我們只在廣東省的一個水庫中發(fā)現(xiàn)了B.hagmanni.并且在青藏高原的10個水體中未發(fā)現(xiàn)象鼻溞的任何種類。2、進一步研究分析兩個主要象鼻溞物種(即B.fatalis和B.longirostris)的16S基因堿基組成、序列變異情況、遺傳多樣性及遺傳分化分析;并通過分子鐘計算和種群歷史動態(tài)分析推測地質(zhì)歷史事件對象鼻溞不同物... 

【文章來源】:揚州大學江蘇省

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

中國象鼻溞屬分子生物地理學研究


圖1.1研究技術路線??Figure?1.1?Research?technology?route??..

電泳圖,電泳圖,基因,產(chǎn)物


2.3結果與分析??2.3.1?PCR產(chǎn)物檢測??凝膠電泳結果如圖2.1所示,最右側空白泳道為陰性對照;26號為陽性對照,其DNA??提取自大型潘M為Tiangan公司生產(chǎn)的D2000Marker。從圖中可以看到目的??片段擴增條帶清晰明亮,且無非特異性擴增條帶出現(xiàn)。??圖2.1?ITS基因PCR產(chǎn)物電泳圖??Figure?2.1?Electrophoregram?of?ITS?PCR?production??2.3.2?ITS單倍型檢測??本章研宄的35個群體中,在ITS基因位點共有305個個體測序成功獲得基因序列,??共檢測到12個單一單倍型,結果如附錄三。??2.3.3?ITS系統(tǒng)樹的構建??基于ITS基因的系統(tǒng)發(fā)生進化樹顯示長刺潘復合種主要有9個分支,分別對應5.??longirostris、B.?liederi、B.fatalis、B.freyi、B.?hagmanni、B.?oriens、B.?coi-egoni、B.?longispnia??和5.加7〇如/,如圖2.2所示。中國35個水體中的象鼻潘只有5./〇嘆和??5.?Aagmawz/。在系統(tǒng)發(fā)生進化樹上,中國地區(qū)的5.?與日本以及美洲地區(qū)的象鼻??潘潘親緣關系較近。5.沒有明顯的地域性分布,在泛北區(qū)各地均被發(fā)現(xiàn);而5.??/atote和5.?則有地域性分布

單倍型,網(wǎng)絡圖,水體,網(wǎng)絡表


?1??o.oi??圖2.2基于ITS基因的ML系統(tǒng)樹??Figure?2.2?Phylogenetic?tree?of?ITS?gene?sequence?using?ML?algorithm??2.3.4?ITS單倍型網(wǎng)絡分析??單倍型網(wǎng)絡表明(圖2.3),具有兩個(/型和A型)出現(xiàn)頻率最高的單倍型。5.??為tote?(〇為?26?個水體共有(即?CAH,?DOH,?DTH,GYH,?HZH,?LMH,PYH,?QDH,STR,TAH,??XLH,?XFJR,?YIH,?HLH,?HSH,?CGH,?ELSR,?SHH,?AHR,?CSH,?DIC,?FXH,?HFH,?HLTR,?SCR,??and?YCH),?5.?(/〇為?17?個水體共有(即?CAH,?DPH,?LHR,?LUH,?PYH,?BSTH,HLH,??HSH,KDLH,LJXR,TIC,WLGH,ELSR,SHH,CSH,FXH,and?YCH)。其中,B.?/〇喂,>〇對咕??(/〇為一種頻繁共享的單倍型


本文編號:3566553

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