目的:研究流式細(xì)胞術(shù)檢測小鼠骨髓造血干祖細(xì)胞分析方法,探索建立使用流式細(xì)胞術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)分析小鼠造血干祖細(xì)胞的新方法,為實(shí)驗(yàn)血液學(xué)研究提供基礎(chǔ)。方法:使用流式細(xì)胞儀進(jìn)行小鼠骨髓造血干祖細(xì)胞流式分析;使用FlowJo軟件對造血干祖細(xì)胞結(jié)果應(yīng)用t-分布鄰域嵌入算法（t-distributed stochastic neighbor embedding,t SNE）、統(tǒng)一流形逼近與投影（uniform manifold approximation and projection,UMAP）和流式自組織特征映射（flow selforganizing feature map,FlowSOM）分析,并對分析結(jié)果進(jìn)行比較,探索通過生物信息學(xué)降維方式分析小鼠造血干祖細(xì)胞流式結(jié)果的新方法。結(jié)果:t SNE、UMAP和FlowSOM分析可以通過降維直觀地反映群體細(xì)胞的抗原表達(dá)水平,并對細(xì)胞進(jìn)行分群和聚類。其分析結(jié)果與傳統(tǒng)流式分析所得細(xì)胞群比例相符。結(jié)論:流式細(xì)胞術(shù)結(jié)合FlowJo軟件建立的小鼠骨髓造血干祖細(xì)胞分析方法可以很好地評價造血干祖細(xì)胞各群分布和比例,具有較好的穩(wěn)定性和評價能力。 

【文章來源】：醫(yī)療衛(wèi)生裝備. 2020,41(02)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

小鼠骨髓造血干祖細(xì)胞流式細(xì)胞分析結(jié)果

小鼠骨髓造血干祖細(xì)胞流式細(xì)胞t SNE分析結(jié)果

如圖5所示，100個單細(xì)胞以抗原表達(dá)情況為依據(jù)，形成聚類分析結(jié)果。標(biāo)識顏色越相近、所在位置越相近的細(xì)胞，其抗原表達(dá)和細(xì)胞類型越接近。著色的扇形標(biāo)識表示該抗原表達(dá)強(qiáng)弱情況，扇形標(biāo)識越大，該抗原表達(dá)越多。由圖5(c）可見，主要細(xì)胞群包括3個，細(xì)胞比例最高的一群為ST-HSC（綠色），其CD34表達(dá)為陽性，CD16/32表達(dá)為陰性。細(xì)胞比例次之的為LT-HSC（紅色），其CD34和CD16/32表達(dá)均為陰性。細(xì)胞比例第三的為MPP（藍(lán)色），其CD34和CD16/32表達(dá)均為陽性。聚類分析結(jié)果與3種細(xì)胞的細(xì)胞群比例相符，呈依次降低關(guān)系（58.3%、22.0%、12.6%）。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3511707