辣椒轉錄因子CaNAC23基因的克隆與表達分析
發(fā)布時間:2021-09-23 02:16
為分析NAC轉錄因子在辣椒發(fā)育及非生物脅迫中的功能,本研究以‘晉尖椒22’為試驗材料,克隆獲得CaNAC23基因全長,該基因全長1 899 bp,編碼632個氨基酸,預測分子量約為72.54 kD,等電點為6.26,無序化區(qū)域有7個。二級結構預測和亞細胞定位預測表明CaNAC23含有一個保守的NAC結構域,定位于細胞核。氨基酸序列比對和進化樹分析表明CaNAC23和擬南芥AT3G03200 (NAC045)同源性較高,進化上在同一分支。CaNAC23基因的組織表達特異性和非生物脅迫下的表達模式結果表明:CaNAC23在葉片中表達量最高,其次是根,暗示CaNAC23基因可能參與辣椒葉片或根發(fā)育相關。CaNAC23能夠被干旱和鹽脅迫誘導表達,推測其參與調控辣椒的非生物脅迫調控。本研究結果為研究NAC轉錄因子在辣椒發(fā)育及非生物脅迫應答中的功能提供了參考依據(jù)。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
CaNAC23 cDNA全長PCR擴增
CaNAC23基因cDNA測序全長序列及氨基酸序列
為了進一步了解該蛋白,對辣椒CaNAC23轉錄因子氨基酸序列進行了理化性質分析,以及蛋白的三級結構預測。氨基酸序列的無序化分析表明:CaNAC23轉錄因子整個氨基酸序列中無序化區(qū)域共有7個,最大無序化區(qū)域是從307位的甘氨酸至444位的絲氨酸共138個氨基酸殘基,其次為46位到124位,174位~227位,560~589位,490~507位,135~148位,484~488位,總無序化氨基酸數(shù)目為338個,無序化占比53.48%(圖4A)。對CaNAC23蛋白組成及親水性進行分析,結果表明CaNAC23蛋白由20種氨基酸組成,其中含量最高的為絲氨酸(Ser),含量為8.1%,含量最低的為半胱氨酸(Cys),含量僅為1.7%。脂肪族系數(shù)(Aliphatic amino acid)為70.79;不穩(wěn)定系數(shù)為43.05;親水性平均系數(shù)為-0.611,表現(xiàn)為親水性(圖4B)。
本文編號:3404826
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
CaNAC23 cDNA全長PCR擴增
CaNAC23基因cDNA測序全長序列及氨基酸序列
為了進一步了解該蛋白,對辣椒CaNAC23轉錄因子氨基酸序列進行了理化性質分析,以及蛋白的三級結構預測。氨基酸序列的無序化分析表明:CaNAC23轉錄因子整個氨基酸序列中無序化區(qū)域共有7個,最大無序化區(qū)域是從307位的甘氨酸至444位的絲氨酸共138個氨基酸殘基,其次為46位到124位,174位~227位,560~589位,490~507位,135~148位,484~488位,總無序化氨基酸數(shù)目為338個,無序化占比53.48%(圖4A)。對CaNAC23蛋白組成及親水性進行分析,結果表明CaNAC23蛋白由20種氨基酸組成,其中含量最高的為絲氨酸(Ser),含量為8.1%,含量最低的為半胱氨酸(Cys),含量僅為1.7%。脂肪族系數(shù)(Aliphatic amino acid)為70.79;不穩(wěn)定系數(shù)為43.05;親水性平均系數(shù)為-0.611,表現(xiàn)為親水性(圖4B)。
本文編號:3404826
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