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細(xì)胞分化的DNA復(fù)制時(shí)序和染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)調(diào)控

發(fā)布時(shí)間:2021-09-18 14:41
  真核生物細(xì)胞周期是一個(gè)復(fù)雜而又高度有序的過(guò)程。包括細(xì)胞的生長(zhǎng)、遺傳物質(zhì)的復(fù)制,以及將復(fù)制產(chǎn)生的染色體分離到其子細(xì)胞等過(guò)程。DNA復(fù)制是該過(guò)程的核心事件。細(xì)胞分化是單一細(xì)胞系經(jīng)過(guò)復(fù)雜生命活動(dòng)產(chǎn)生一系列結(jié)構(gòu)功能有明顯差異細(xì)胞系的過(guò)程。在分化過(guò)程中基因的選擇性表達(dá)需要特異性的轉(zhuǎn)錄程序,而DNA的復(fù)制時(shí)序與基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控存在密切聯(lián)系。細(xì)胞在分化過(guò)程中通過(guò)改變DNA復(fù)制時(shí)序使得分化后細(xì)胞的生物功能順利實(shí)現(xiàn),這一動(dòng)態(tài)變化可能與染色質(zhì)的序列、表觀(guān)特征以及結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。為了驗(yàn)證這一假設(shè),我們利用染色體構(gòu)像捕獲(Hi-C)等實(shí)驗(yàn)技術(shù)得到的高通量測(cè)序數(shù)據(jù),根據(jù)胚胎干細(xì)胞與體細(xì)胞間復(fù)制時(shí)序的差異將基因組分為4類(lèi):在5類(lèi)細(xì)胞中復(fù)制時(shí)序保守的早復(fù)制域,稱(chēng)為CE;5類(lèi)細(xì)胞中復(fù)制時(shí)序保守的晚復(fù)制域,稱(chēng)為CL;在干細(xì)胞中晚復(fù)制而在4類(lèi)體細(xì)胞中早復(fù)制的區(qū)域,稱(chēng)為L(zhǎng)toE;在干細(xì)胞中早復(fù)制而在4類(lèi)體細(xì)胞中晚復(fù)制的區(qū)域,稱(chēng)為EtoL。我們從染色質(zhì)的序列特征、表觀(guān)特征和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)特征三方面分析在分化中復(fù)制時(shí)序改變和保守區(qū)域的染色質(zhì)特性。首先在染色質(zhì)序列特征層面上,保守的復(fù)制域表現(xiàn)出與其復(fù)制時(shí)序相對(duì)應(yīng)的染色質(zhì)特征:早復(fù)制域是基... 

【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

細(xì)胞分化的DNA復(fù)制時(shí)序和染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)調(diào)控


細(xì)胞周期中DNA復(fù)制起點(diǎn)的空間結(jié)構(gòu)變化(Rivera-MuliaandGilbert2016)

全基因組,實(shí)驗(yàn)流程,熒光激活細(xì)胞分選,目標(biāo)時(shí)間


華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文傳物質(zhì)分子量。主要是 Repli-chip 以及 Repli-seq 技tani et al 2008, Ryba et al 2011)主要是使用 5-溴-2-脫氧的 DNA,根據(jù) S 期的不同時(shí)期利用熒光激活細(xì)胞分選用 BrdU 分離出目標(biāo)時(shí)間點(diǎn)合成的 DNA,最后通過(guò)微nsen 等人又對(duì)從 BrdU 標(biāo)記和 FACS 分選獲得的 DNA Repli-seq 技術(shù)(Hansen et al 2010)。通過(guò)將 S 期劃分為是 6 個(gè)時(shí)期(G1、S1、S2、S3、S4、G2)計(jì)算早 S 期比。Repli-chip與Repli-seq數(shù)據(jù)在平滑和標(biāo)準(zhǔn)化后具有較

流程圖,流程,染色體,測(cè)序技術(shù)


華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文染色體構(gòu)象捕獲是一種用于研究細(xì)胞中染色體交互模式的生物技術(shù),而 H術(shù)(Lieberman-Aiden et al 2009) (High-through chromosome conformation captu以細(xì)胞核結(jié)構(gòu)為研究對(duì)象,利用高通量測(cè)序技術(shù)獲得高分辨率的染色質(zhì)相互作譜,結(jié)合生物信息學(xué)分析方法探索染色質(zhì)的相互關(guān)系(圖 1.3)。


本文編號(hào):3400323

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