高效Rubisco羧化活性篩選體系的設計與構建
發(fā)布時間:2021-08-19 15:16
【背景】廣泛存在于植物、藻類及其他自養(yǎng)微生物中的核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶(Rubisco)是卡爾文循環(huán)中固定CO2的關鍵酶及限速酶,在生物質(zhì)合成和全球碳循環(huán)中扮演著重要角色。鑒于Rubisco的重要性以及極低的固碳羧化活性,對Rubisco的篩選進化研究具有重要意義!灸康摹繕嫿ㄒ环N適用于篩選高效Rubisco羧化活性的篩選體系!痉椒ā糠治霈F(xiàn)有篩選體系對Rubisco羧化活性篩選壓力缺失的原因,設計構建適用于高效Rubisco羧化活性的篩選體系,以BWLac產(chǎn)乳酸菌株為宿主,在含有5%CO2的N2環(huán)境下厭氧培養(yǎng),比較不同羧化活性Rubisco對細胞生長的影響,通過HPLC及LCMS檢測總?cè)樗峒肮潭–O2生成乳酸的產(chǎn)量評估篩選體系。【結果】通過終端代謝產(chǎn)物乳酸產(chǎn)生下拉力,以及甘油代謝產(chǎn)生的剩余還原力需要平衡消耗掉的設計靶點,增強Prk和Rubisco的固碳支路代謝通量,加強RuBP對細胞的毒性抑制作用,使細胞生長與Rubisco活性有效偶聯(lián),構建高通量篩選辦法。在新構建的篩選體系中,Rubisco失活突變體BWLac/197不能生長,Rubisco和Prk雙失活突變體BWLa...
【文章來源】:微生物學通報. 2020,47(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
高效羧化活性篩選體系Rubisco平板生長情況
通過細胞生長的菌落大小來表征Rubisco羧化活性的高通量篩選方法,篩選獲得的酶分子是總活性的提高,不能區(qū)別可溶性表達的提高和比酶活提高的差異,這也是所有酶分子定向進化篩選突變體的共性問題。此前已有報道,關于來源于Synechococcus sp.PCC6301的Rubisco進化,獲得了大亞基Rbc L F345I突變株,其可溶性提高了近7倍,而羧化作用的催化效率降低了17%[14]。為了盡可能避免篩選到可溶性表達的Rubisco,本研究中應用22°C低溫誘導表達Rubisco,以及25°C的平板篩選培養(yǎng)溫度,目的是盡可能減少Rubisco誘導表達過程中形成不可溶包涵體,從而降低篩選到Rubisco可溶性表達提高的可能性。圖6 不同羧化活性Rubisco的產(chǎn)乳酸能力評價
針對2.1節(jié)中現(xiàn)有篩選體系不能篩選獲得羧化活性更高的Rubisco酶分子元件的問題,希望通過增加Prk和Rubisco的固碳支路代謝通量,提高RuBP細胞毒性的抑制作用,放大Rubisco羧化活性差異在細胞生長方面的體現(xiàn)。為此,從兩個方面考慮設計如何增強Rubisco的固碳代謝通量,設計原理示意圖如圖2所示。一是以乳酸終端代謝產(chǎn)物形成下拉力,為Rubisco羧化活性固定的CO2找到終端出口,設計強化丙酮酸到乳酸終端代謝產(chǎn)物的代謝路徑,阻斷丙酮酸到乙酰CoA的甲酸裂解酶PflB活性,以及丙酮酸到琥珀酸的琥珀酸脫氫酶Frd活性,使乳酸成為細胞在厭氧條件下丙酮酸代謝的主要代謝終產(chǎn)物,通過乳酸的代謝生成持續(xù)拉動Prk和Rubisco固碳支路;二是依據(jù)甘油代謝產(chǎn)乳酸剩余還原力NADH的特征,見反應式(1),設計通過Prk和Rubisco支路代謝利用木糖,固定CO2生成乳酸,如反應式(2)所示,消耗甘油代謝產(chǎn)乳酸剩余的NADH,從而平衡胞內(nèi)還原力,也就是說,通過甘油代謝產(chǎn)乳酸的過剩還原力,增強Prk和Rubisco固碳支路代謝通量(圖2)。圖2 高效Rubisco羧化活性篩選體系設計原理圖
本文編號:3351649
【文章來源】:微生物學通報. 2020,47(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【部分圖文】:
高效羧化活性篩選體系Rubisco平板生長情況
通過細胞生長的菌落大小來表征Rubisco羧化活性的高通量篩選方法,篩選獲得的酶分子是總活性的提高,不能區(qū)別可溶性表達的提高和比酶活提高的差異,這也是所有酶分子定向進化篩選突變體的共性問題。此前已有報道,關于來源于Synechococcus sp.PCC6301的Rubisco進化,獲得了大亞基Rbc L F345I突變株,其可溶性提高了近7倍,而羧化作用的催化效率降低了17%[14]。為了盡可能避免篩選到可溶性表達的Rubisco,本研究中應用22°C低溫誘導表達Rubisco,以及25°C的平板篩選培養(yǎng)溫度,目的是盡可能減少Rubisco誘導表達過程中形成不可溶包涵體,從而降低篩選到Rubisco可溶性表達提高的可能性。圖6 不同羧化活性Rubisco的產(chǎn)乳酸能力評價
針對2.1節(jié)中現(xiàn)有篩選體系不能篩選獲得羧化活性更高的Rubisco酶分子元件的問題,希望通過增加Prk和Rubisco的固碳支路代謝通量,提高RuBP細胞毒性的抑制作用,放大Rubisco羧化活性差異在細胞生長方面的體現(xiàn)。為此,從兩個方面考慮設計如何增強Rubisco的固碳代謝通量,設計原理示意圖如圖2所示。一是以乳酸終端代謝產(chǎn)物形成下拉力,為Rubisco羧化活性固定的CO2找到終端出口,設計強化丙酮酸到乳酸終端代謝產(chǎn)物的代謝路徑,阻斷丙酮酸到乙酰CoA的甲酸裂解酶PflB活性,以及丙酮酸到琥珀酸的琥珀酸脫氫酶Frd活性,使乳酸成為細胞在厭氧條件下丙酮酸代謝的主要代謝終產(chǎn)物,通過乳酸的代謝生成持續(xù)拉動Prk和Rubisco固碳支路;二是依據(jù)甘油代謝產(chǎn)乳酸剩余還原力NADH的特征,見反應式(1),設計通過Prk和Rubisco支路代謝利用木糖,固定CO2生成乳酸,如反應式(2)所示,消耗甘油代謝產(chǎn)乳酸剩余的NADH,從而平衡胞內(nèi)還原力,也就是說,通過甘油代謝產(chǎn)乳酸的過剩還原力,增強Prk和Rubisco固碳支路代謝通量(圖2)。圖2 高效Rubisco羧化活性篩選體系設計原理圖
本文編號:3351649
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