CHX（Cation/H⁺ exchanger）基因家族是CPA（Cation proton antiporter）基因家族的一個亞家族,家族基因廣泛參與維持植物體內(nèi)Na⁺/K⁺離子平衡的調(diào)控過程,對植物維持細胞離子濃度、花器官的發(fā)育起著至關(guān)重要的作用。本研究以葡萄為材料,共鑒定出19個VvCHX基因,命名為VvCHX1～VvCHX19。運用生物信息學(xué)的方法,系統(tǒng)地分析了葡萄VvCHXs基因的結(jié)構(gòu)、蛋白理化性質(zhì)、保守基序、系統(tǒng)進化,同源基因分析和組織特異性表達。結(jié)果表明,根據(jù)多物種CHX蛋白的進化樹分析將19個Vv CHX家族成員劃分為4類;VvCHX家族基因不均勻的分布于7條染色體上,其中3對基因存在串聯(lián)重復(fù)現(xiàn)象;同源基因分析表明,葡萄VvCHX家族成員可能在維持離子濃度、花器官發(fā)育中起到重要作用;組織特異性表達分析表明,絕大多數(shù)葡萄VvCHX基因家族成員在雄蕊、花粉、花中表達量較高。本研究進一步探究CHX基因家族調(diào)控植物抗逆的分子機制提供依據(jù)。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(24)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

CHX基因家族系統(tǒng)發(fā)育樹

Motif Logo表明VvCHX家族基因中的3個結(jié)構(gòu)域所包含的motif多個氨基酸位點保持不變，證明了VvCHX基因家族的Na+/H+exchanger結(jié)構(gòu)域、AA-NH-like結(jié)構(gòu)域和C端結(jié)構(gòu)域都具有很高的保守性。如motif 3的結(jié)構(gòu)為MN-X1-KG-X2-E-X4-N-X2-K-E/D-K-X3-D-X2-F-X10-T-X4-PV-X3-Y-X1-P。motif 10的結(jié)構(gòu)為GLKT-D/N-VA-X3-G-X3-W-GL-LV-LVIFIAC-X1-GK。1.4 葡萄CHX基因順式調(diào)控元件分析

為進一步分析各種脅迫處理后VvCHX基因的表達，針對兩種試驗處理，分析17個VvCHX基因的表達，獲得干旱脅迫環(huán)境和熱脅迫環(huán)境中VvCHX的表達量，構(gòu)建表達熱圖(圖6)。圖4 葡萄和擬南芥的CHX基因家族同源性分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]大豆CHX基因家族全基因組鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 才曉溪,沈陽,周伍紅,賈博為,孫明哲,王金玉,楊珺凱,李建偉,孫曉麗.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(12)
[2]植物鹽脅迫下應(yīng)激調(diào)控分子機制研究進展[J]. 張昆,李明娜,曹世豪,孫彥.  草地學(xué)報. 2017(02)
[3]蘋果K+轉(zhuǎn)運蛋白基因家族鑒定及表達分析[J]. 楊琳,董玲,李明軍,馬鋒旺,鄒養(yǎng)軍.  園藝學(xué)報. 2016(06)
[4]Na+（K+）/H+轉(zhuǎn)運蛋白NHX基因的研究進展[J]. 李靜,劉明,孫晶,李思楠,李文濱,武小霞.  大豆科學(xué). 2011(06)

博士論文
[1]葡萄CPA1基因家族注釋和功能分化及植物CPA1基因家族過表達的META分析[D]. 馬媛春.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號：3311027